Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,652,993 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,652,993 | 0 | A | T | 99.5% | 457.3 / NA | 194 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (110/82); minor base C (1/0); total (112/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,652,994 | 0 | G | C | 99.5% | 451.2 / NA | 194 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (112/81); total (112/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,652,995 | 0 | T | A | 99.5% | 457.9 / NA | 194 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (111/82); minor base C (1/0); total (112/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GCCACAGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTAGTCTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCAGTCTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAAAGCATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTCCGGCGGCAGGTTT > CP042583/1652713‑1653267 ||| gCCACAGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTtgat > 1:822243/1‑289 (MQ=255) caGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGCAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAACATTCCCCCCTTCATGAat > 2:806803/1‑289 (MQ=255) caGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGaa < 2:1199790/288‑1 (MQ=255) aacaaATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAattat > 2:1788066/1‑288 (MQ=255) caaATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTcc > 1:1042533/1‑289 (MQ=255) ataAACTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCCGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGaa < 2:1036670/289‑1 (MQ=255) tgtgGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATaa > 1:1465263/1‑289 (MQ=255) tgtgGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTCCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATaa > 1:519877/1‑289 (MQ=255) tgtgGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATAAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGTTGCTGCCGCGTTCCTGAGCCGTCACGCCCAGGCAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCCATTAACCGCGTCTTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGTTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCtatac > 2:1111566/1‑288 (MQ=255) cACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGCAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTTTTCACTGCTTTATCAGCAAAAGAGCGCTTGGTGAAGCACTCATCCCTTCGAAGGTTAGGCCGCGTACCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGGACATGCAGCAGCAGTTTGATCACCTGACTTATCCCGGCACATTAACGCGTACTCATAACGTTGATTCTCCGTTTACATAATACTCCGCACTTGTTGCAATATGCCCGGAAACATACAAACAAGa > 2:1837168/1‑288 (MQ=255) cACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGa > 1:982981/1‑288 (MQ=255) cTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACa > 1:1872471/1‑289 (MQ=255) tGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGCTTGCTGAATATTCCTCACTTCATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACAAGAACAATTAATCa > 2:1132798/1‑288 (MQ=255) aaaCCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAattatt < 2:898587/254‑1 (MQ=255) aaaCCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCAccc > 1:1413219/1‑289 (MQ=255) aaaCCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCAccc > 1:1949018/1‑289 (MQ=255) cAGAAATGATTGAAAAGCTTAATGAGCAGATGAGCCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGaa < 1:806803/289‑1 (MQ=255) aTTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGGACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACg > 2:596555/1‑289 (MQ=255) aaCTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCCAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGc < 1:1154059/289‑1 (MQ=255) tAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACTCAGAAAATTAACGAACTGGCTCAt > 2:494659/1‑289 (MQ=255) cAGATGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACg > 1:912209/1‑244 (MQ=255) tGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 1:1685913/288‑1 (MQ=255) tGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGAc < 1:1538564/289‑1 (MQ=255) tGAACCTGGAACTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTCCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 2:519877/288‑1 (MQ=255) cTGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACt < 1:596555/289‑1 (MQ=255) tGTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAAATGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACt > 1:1317620/1‑288 (MQ=255) gTACTCTTCACTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTa > 1:717571/1‑288 (MQ=255) tactcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACAAGAACAATTAATCATCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTAc > 1:1073227/10‑288 (MQ=255) actcttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTAccc < 1:394278/281‑1 (MQ=255) cttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGaa > 2:1404655/6‑241 (MQ=255) ttcacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATTACCCAGAAAATTAACGAAATGGCTCATGCTGCACTGACCAATACGGACTACCCAACa > 2:1646136/5‑289 (MQ=255) cacTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACAtt > 1:1753062/3‑289 (MQ=255) tGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTaa > 2:960561/1‑289 (MQ=255) tCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCt > 1:180049/1‑288 (MQ=255) aTGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACg < 1:1738945/229‑1 (MQ=255) aTGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 1:619177/250‑1 (MQ=255) aTGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa > 2:619177/1‑250 (MQ=255) gcCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGttt < 1:960561/289‑1 (MQ=255) tGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 2:717571/288‑1 (MQ=255) aTACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa > 2:448203/1‑228 (MQ=255) ttCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAgaga > 1:205138/1‑289 (MQ=255) cGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTT‑ATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCa < 2:1236778/188‑1 (MQ=255) gAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGaa > 2:882344/1‑287 (MQ=255) aGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTaa > 2:388767/1‑195 (MQ=255) gctgcCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCa > 1:1978741/1‑289 (MQ=255) gTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCAGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTGGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaaatcgat < 1:1111566/288‑6 (MQ=255) ttCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag > 1:1403931/1‑255 (MQ=255) ttCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaaatcgatta > 1:64748/1‑282 (MQ=255) tCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTACTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaaatcgattat > 1:1469463/1‑281 (MQ=255) tCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACACAGAAACTTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTACTTTCATGCCATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTTTTCAAATCGATGATTGATAAATTa > 1:321135/1‑289 (MQ=255) aGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTggc > 2:940059/1‑289 (MQ=255) gACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgc > 2:789857/1‑289 (MQ=255) cGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTa > 1:1038251/1‑214 (MQ=255) cGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGAAAACCTATAAACACGCACAATTAACCACCCACAAAATTAACGAACTGGCTCATGCGGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATTTTTCTGAGCAGCATGAATAAGAGAAACTGCTCAAATCGCTTACTGATAAATTAAGCATGGCAGTCAAAAgcg > 2:1576448/1‑288 (MQ=255) atatGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgcggcg < 2:1978741/288‑1 (MQ=255) atatGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgcggcg < 1:840238/288‑1 (MQ=255) atatGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGa < 1:1228291/289‑1 (MQ=255) tGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa > 1:457807/1‑168 (MQ=255) tGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGa < 2:457807/168‑1 (MQ=255) gTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTAtttt > 1:754181/1‑289 (MQ=255) tttGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCt < 1:856841/188‑1 (MQ=255) tttGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTa > 1:1971742/1‑289 (MQ=255) tgaaTTACCTGACGCATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATATCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATGAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAAACAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTAt < 2:1317620/286‑1 (MQ=255) aTTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGa > 2:346601/1‑289 (MQ=255) tACCTGAGTGATACCGACAATTTACCTCGTATTAATACCATTGAATCTCCGTTTTCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACTAACAATTAATCAACCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACa < 2:1949018/289‑1 (MQ=255) ccTGACTGTTACTGGCAATTAACCGCGTATTAATACCTTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCAATTTATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACTAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGGATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACaaa < 2:1422186/289‑1 (MQ=255) ccTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgcggcg < 2:1071028/266‑1 (MQ=255) ccTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACaaa < 1:443123/289‑1 (MQ=255) tgactgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGa > 2:668712/1‑265 (MQ=255) tgactgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGa < 1:668712/265‑1 (MQ=255) tgactgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGa > 1:889088/1‑289 (MQ=255) gactgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGaa < 2:982981/289‑1 (MQ=255) ctgaTACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAAt > 2:1280445/1‑149 (MQ=255) tACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAActctct > 1:1639183/1‑289 (MQ=255) gCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTAccc > 1:412129/1‑288 (MQ=255) gCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATATAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTAccc > 2:546368/1‑288 (MQ=255) tttACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCaaatcgatta < 2:1749544/215‑8 (MQ=255) tttACCGCGTATTAATACCGTTGAACCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag < 2:1854543/181‑1 (MQ=255) tttACCGCGTATTAATACCGTTGAACCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGag > 1:1854543/1‑181 (MQ=255) ttacaccggaTTAATACCGTTGAAGCTCCGTTTGCTTAATATTCCTGACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAAACAACCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGaca < 2:639432/280‑1 (MQ=255) gcgTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCCGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTCTTGATAAATTAAGCCTGGCAGGACAAAGCGGCAAAGGTCAGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACa‑a > 2:238351/1‑289 (MQ=255) cgTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAg < 1:1514525/265‑1 (MQ=255) cgTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAg > 2:1514525/1‑265 (MQ=255) aTTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACt > 1:315480/1‑289 (MQ=255) gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACaaa > 1:1888122/1‑252 (MQ=255) gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACaaa < 2:1888122/252‑1 (MQ=255) gTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGa > 2:1468889/1‑269 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGaaa < 2:823342/179‑1 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAAt < 1:988949/204‑1 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAgcggcg < 1:38636/228‑1 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAActct < 2:125117/258‑1 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAActct > 1:125117/1‑258 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCtctc > 2:1379045/1‑288 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTcc > 1:361896/1‑289 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTcc > 2:1584191/1‑289 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTcc > 1:1158664/1‑289 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTcc > 2:171098/1‑289 (MQ=255) ttGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGAATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGTGAAACTGTTCAGATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCTAAGGTTTGTATTTTCTCGACAAAGCACTATCTACCCTCGA‑ACAAACAAACTAATggctgcc > 2:806161/1‑283 (MQ=255) gAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAg > 1:1937131/1‑117 (MQ=255) tctcCGTTTGCTGAATATTCCTCACTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAATCGATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTCcggcgg < 2:1971742/289‑1 (MQ=255) ||| GCCACAGCAACAAATATAACCTTTGTGGAGCACTATCATGCTGAAACCAGAAATGATTGAAAAACTTAATGAGCAGATGAACCTGGAACTGTACTCTAGTCTGCTTTATCAGCAAATGAGCGCCTGGTGCAGCTATCATACCTTCGAAGGTGCTGCCGCGTTCCTGCGCCGTCACGCCCAGGAAGAGATGACGCATATGCAGCGTCTGTTTGATTACCTGACTGATACCGGCAATTTACCGCGTATTAATACCGTTGAATCTCCGTTTGCTGAATATTCCAGTCTTGATGAATTATTCCAGGAAACCTATAAACACGAACAATTAATCACCCAGAAAATTAACGAACTGGCTCATGCTGCAATGACCAATCAGGACTACCCAACATTTAATTTCCTGCAATGGTATGTTTCTGAGCAGCATGAAGAAGAGAAACTGTTCAAAAGCATTATTGATAAATTAAGCCTGGCAGGCAAAAGCGGCGAAGGTCTGTATTTTATCGACAAAGAACTCTCTACCCTCGACACACA‑AAACTAATGCTCTCCGGCGGCAGGTTT > CP042583/1652713‑1653267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |