Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,674,572 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,674,572 | 0 | G | C | 99.5% | 505.0 / NA | 215 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,674,573 | 0 | C | G | 100.0% | 502.0 / NA | 215 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (113/102); total (113/102) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,674,574 | 0 | T | A | 100.0% | 510.8 / NA | 215 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (113/102); total (113/102) |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
GGCGTACTGAAGCCCTATGTTAATTTCTTTGCGGTAACGTAATCCGGAACACATTATGCTTATTGAGATAGTGATACGTAGCACTTCCCCCATGCAATTCGGCAATCGCTTTGACTAAAGAAAGGCCTAGTCCCTGACCTACGGAATGACGGCTATTATCTCCCCGCCAAAATCTACGGAAGAGTTTTTCAGGCTCATTAATTTTCGTTCCAGGGCTGGCGATATCAATATTAAGATAGCTGTTGGTATCAAGAAAACTGGTTATATGAATACGGCTTTTTTCTGGGCTA‑TATCTAATGGCATTAACAATAAGATTGCTTAACATTCGTTGTAGTAAAATTTTATCCGCAAAGATTTGCTGATTGCACTCGACCTTAAAGCAAATCTCTTTCTCGTCACTAAGGTATTCAAGATAGTCCAACAAATTTTCGACTTCCTTATTGAGAGAAAGGCTGTCCAGTTTCACCAAAACATTGTTTTTATCTGCCCTGGCAAGAAACAGTATGTTCTCTGTTAACCGGCTAATATTTTCCAGCTCTTCAATGTTTCCGGCAA > CP042583/1674298‑1674852 ||| tACTGAAGCCCTATGTTAATTTCTTTGCGGTAACGTAATCCGGAACACATTATGCTTATTGAGATAGTGATACGTAGCACTTCCCCCATGCAATTAGGCAATCGCTTTGAATAAAGAAAGGCCTAGTCCCTGACCTACGGAATGACGCGAATTATCTCTCCGCCAAAATCTACGGAAGAGTTTTTCCGGCTCATTAATTTCCGCTCCAGGGCTGGCGATCTCAATATTAAGATAGCTGTTGGTATCAAGAAAACTGGTTCTATGAATACGCGATTTTTCTggcgaatat > 2:1382794/1‑282 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |