Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 505,000 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 505,000 | 0 | A | T | 99.6% | 593.8 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 505,001 | 0 | G | C | 99.2% | 589.8 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (131/118); minor base T (1/1); total (132/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 505,002 | 0 | T | A | 99.2% | 586.2 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (129/119); minor base C (2/0); total (132/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
AGCATTACACCAGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGAGCATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATAGTCTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAACACTCTGTGGCCGCTGTTTGGTATTGCCAACCAGATGCTGGCAGGGATGGCGCTGATGCTCTGTGCCGTGGTGTTGTTCAAGATGAAACGTCAACGTTACGCCTGGGTGGCGCTGGTACCAACGGCCTGGCTGCTGATTTGTACCCTGACCGCAGGCTGGCAGAAAGCGTTTAGCCCGGATGCGAAA > CP042583/504724‑505281 ||| tACACCAGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACct > 2:488445/1‑288 (MQ=255) aaccacgtaggCTAAACCAGATGGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGAGCAGTGCCCGTGCGGGCGGGGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACctgct < 2:796189/279‑1 (MQ=255) gATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCaa > 2:661309/1‑289 (MQ=255) gATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCa > 1:1851719/1‑288 (MQ=255) 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ggagagagtcgttcatTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACt < 2:1237188/276‑1 (MQ=255) gTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACt < 1:477830/288‑1 (MQ=255) gaacagtcgatcatTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGATGGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCTAACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTtc < 1:664474/279‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |