Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,694,681 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,694,681 | 0 | A | T | 100.0% | 468.9 / NA | 197 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (99/98); total (99/98) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,694,682 | 0 | G | C | 99.0% | 464.0 / NA | 197 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (98/97); minor base T (1/1); total (99/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,694,683 | 0 | T | A | 100.0% | 471.9 / NA | 197 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (99/98); total (99/98) |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TATTGTTGCTAAAAAAACGGCTAAAGACGGTGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCAGTATGATTATCGCCGAGACATTGACTAGTAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACTGAGTTCAG > CP042583/1694401‑1694958 ||| ttgCTAAAAAAACGGCTAAAGACGGTGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCg > 1:1338039/1‑289 (MQ=255) gCTAAAAAAACGGCTAAAGACGGTGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGt > 1:1053583/1‑288 (MQ=255) tAAAAAAACGGCTAAAGACGGTGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTAc < 2:1262034/288‑1 (MQ=255) aaaaaaaCGGCTAAAGACGGTGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGa < 2:1527565/289‑1 (MQ=255) tGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAAtt > 1:1221086/1‑289 (MQ=255) tGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAAtt > 1:1526715/1‑289 (MQ=255) cTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGTCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATaa > 2:536082/1‑289 (MQ=255) aaaaTTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATaaaa > 2:1557922/1‑289 (MQ=255) ttATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAggc < 2:1905752/289‑1 (MQ=255) aTGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTCTTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTCACCATACGATTGCTACCGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAggcg > 1:1557536/1‑288 (MQ=255) aTGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTAc < 2:1750550/250‑1 (MQ=255) aTGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTAc > 1:1750550/1‑250 (MQ=255) aTGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAggcgg > 2:1602887/1‑289 (MQ=255) aTGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAggcgg < 2:1659326/289‑1 (MQ=255) aTGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCCCCGAGACATTGACTTTAAATGGTAAGCGTACGATTGCTAACTCTGGCACAATTTTTAATAAAAAAggcg > 2:723262/1‑288 (MQ=255) tgtAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCg > 2:1608493/1‑289 (MQ=255) aaaTCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAgg < 2:577016/289‑1 (MQ=255) tCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTc < 2:844358/289‑1 (MQ=255) tATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGTCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTg < 1:536082/289‑1 (MQ=255) tATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGt > 1:833498/1‑285 (MQ=255) tATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTg < 1:868015/289‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGt < 1:1121287/289‑1 (MQ=255) tgctgctgcTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAggcggc > 2:1384444/1‑265 (MQ=255) ctgctAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCta > 1:998447/1‑289 (MQ=255) aCAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGttt < 2:880449/289‑1 (MQ=255) aGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGAc > 1:518741/1‑289 (MQ=255) aGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGAc > 2:795784/1‑289 (MQ=255) tGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTAc > 1:1606502/1‑207 (MQ=255) tGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAAt > 1:944024/1‑289 (MQ=255) aaCCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATAc < 1:1789000/289‑1 (MQ=255) aCCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTCTATGTTTGACAATACg > 1:299238/1‑289 (MQ=255) aCCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATAc < 1:718519/288‑1 (MQ=255) aTCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTc > 1:1276819/1‑259 (MQ=255) aTCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGgtgt > 1:602761/1‑289 (MQ=255) aaCACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGtt < 1:1492191/180‑1 (MQ=255) aTCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATAc > 2:1968785/1‑267 (MQ=255) aTCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAggg > 2:1551173/1‑289 (MQ=255) aTCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAggg > 1:649461/1‑289 (MQ=255) aTCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCAAAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATAc < 1:1968785/267‑1 (MQ=255) aaaTTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGAcc < 2:1638255/289‑1 (MQ=255) aTTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCt < 1:1618879/289‑1 (MQ=255) ttCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCgg > 1:1023936/1‑226 (MQ=255) ttCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCgg < 2:1023936/226‑1 (MQ=255) cGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCt < 1:218627/239‑1 (MQ=255) cGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGa > 1:761766/1‑288 (MQ=255) cGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGa > 1:1895636/1‑288 (MQ=255) cGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGa > 2:382479/1‑288 (MQ=255) gTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGtt < 1:1478867/162‑1 (MQ=255) gTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGtt > 2:1478867/1‑162 (MQ=255) aaCGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCtat < 1:400869/233‑1 (MQ=255) gCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAAt > 2:1228957/1‑240 (MQ=255) cacaAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTg < 1:164468/288‑1 (MQ=255) aagtcacAAAGCACGATAATGATAAAGCAATGGATAAAGCCAAAGGCGGCGGGGATGAAACGTTCGTGAAGGGACGTTATGAAGGCTTTGTTCCTAATGGCTAAATGATTAGCGCAGAGACATTTAATTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGTACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGTAGCGGCAGTTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGc < 2:455393/283‑1 (MQ=255) aGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGGGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTGTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCt < 2:1791452/289‑1 (MQ=255) ttCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCATCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACa < 2:920856/251‑1 (MQ=255) acAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAg < 2:1433302/288‑1 (MQ=255) aaGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTTTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTg > 1:690254/1‑289 (MQ=255) cGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGt > 1:1958831/1‑288 (MQ=255) aaGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTa > 1:899799/1‑222 (MQ=255) aaGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGAtgtg > 1:185410/1‑287 (MQ=255) aaGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGGGAtggt > 2:412191/1‑285 (MQ=255) aGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCt > 2:1866499/1‑235 (MQ=255) aGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCt < 1:1866499/235‑1 (MQ=255) aaTTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGGATTTAAAGGGACAGACCCGGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTTAAGTTGATGTTCGTGCTTTGACTgaa > 2:1927476/1‑289 (MQ=255) tgttAAAGCCAAAGGGGGCGAGGATGAAACGTTCGTGCAGGGAGGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGAACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTgaagaa < 2:150656/286‑1 (MQ=255) aaGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAgg < 2:602761/289‑1 (MQ=255) aaaGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACa < 2:1958831/289‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGa > 2:1296745/1‑194 (MQ=255) aGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGa < 1:1296745/194‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACAtt < 2:944024/289‑1 (MQ=255) aGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACAtt > 1:1378027/1‑289 (MQ=255) aaaCGTTCGTGAAGGGACGTTATTAAGGCTTTGTTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGGGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTg < 2:1726160/288‑1 (MQ=255) aatggtCGTGAAGGGACGTTATGCAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGa < 2:1245835/283‑1 (MQ=255) aaCGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGa < 1:671258/288‑1 (MQ=255) cGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTgaagaa < 2:1648374/256‑1 (MQ=255) cGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTgaagaa > 1:1648374/1‑256 (MQ=255) gCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGAc < 1:79978/289‑1 (MQ=255) gCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGAc < 1:1673746/289‑1 (MQ=255) gCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTAAGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGa < 2:892459/288‑1 (MQ=255) aaGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTaaa > 1:1176009/1‑167 (MQ=255) aaGGCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTaaa < 2:1176009/167‑1 (MQ=255) ggCTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATcg > 2:1847226/1‑289 (MQ=255) cTTTGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATcg < 2:629559/287‑1 (MQ=255) cTTTGGTCCTAATGGCTCAATGAGTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGAACGATTGCTAACGTTCACACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATcg < 2:1371700/287‑1 (MQ=255) ttGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGAc < 1:1545828/170‑1 (MQ=255) ttGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGa > 1:1202797/1‑211 (MQ=255) ttGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGa < 2:1202797/211‑1 (MQ=255) ttGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGttat > 2:678769/1‑250 (MQ=255) ttGGTCCTAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATcgcg > 1:1451881/1‑287 (MQ=255) tAATGGCTCAATGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTaa > 1:885504/1‑234 (MQ=255) ctcaaTGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGACATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATATTGAACCTATTGACCTTCATAAAGGAATCGAGGCTCTAAAagca > 2:1532356/5‑286 (MQ=255) ctcaaTGATTATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAagca > 1:264869/5‑286 (MQ=255) tATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACt < 1:1911542/289‑1 (MQ=255) tATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACt < 1:1234566/289‑1 (MQ=255) tATCGCCGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACt < 1:1005043/289‑1 (MQ=255) cGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACAtt > 1:252586/1‑217 (MQ=255) cGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACAtt < 2:252586/217‑1 (MQ=255) cGAGACATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACTGAGt > 1:1567340/1‑287 (MQ=255) agaCATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGgt > 1:1575143/1‑116 (MQ=255) agaCATTGACTTCAAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACTGAGttttc > 2:1143232/1‑286 (MQ=255) ||| TATTGTTGCTAAAAAAACGGCTAAAGACGGTGCAACGTCTAAAATTTATGCAAAATTCGGTGTAGAAATCTATGCTGCTGCTAAACAAGGTGAACCCGATCCAGAATTAAACACATCTTTAAAATTCGTTATTGAACGTGCAAAGCAGGCACAAGTTCCAAAGCACGTTATTGATAAAGCAATTGATAAAGCCAAAGGCGGCGGAGATGAAACGTTCGTGCAGGGACGTTATGAAGGCTTTGGTCCTAATGGCAGTATGATTATCGCCGAGACATTGACTAGTAATGTTAACCGTACGATTGCTAACGTTCGCACAATTTTCAATAAAAAAGGCGGCAATATCGGAGCGGCAGGTTCTGTCAGCTATATGTTTGACAATACGGGTGTGATTGTATTTAAAGGGACAGACCCTGACCATATTTTTGAAATTTTACTTGAAGCTGAAGTTGATGTTCGTGATGTGACTGAAGAAGAAGGTAACATTGTTATTTATACTGAACCTACTGACCTTCATAAAGGAATCGCGGCTCTAAAAGCAGCTGGAATCACTGAGTTCAG > CP042583/1694401‑1694958 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |