Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,708,753 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,708,753 | 0 | A | T | 100.0% | 408.7 / NA | 172 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (91/81); total (91/81) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,708,754 | 0 | C | G | 98.8% | 397.1 / ‑5.8 | 172 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (90/80); total (91/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,708,755 | 0 | T | A | 100.0% | 408.6 / NA | 172 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (91/81); total (91/81) |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CGGTGGCACATCCACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACGCTAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATACTAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATC > CP042583/1708473‑1709027 ||| cGGTGGCACATCCACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACAt > 2:1114815/1‑289 (MQ=255) tGGCACATCCACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATaaa > 2:187730/1‑289 (MQ=255) aggCACATCCACCCGCCAGAACAATTCCAAGCCCGAAGATATACCAACCGATACCAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATaa < 1:692382/287‑1 (MQ=255) acaTCCACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAaattaa < 1:1369458/289‑1 (MQ=255) ccACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAAttaattaa > 2:1311433/1‑289 (MQ=255) cACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAAc < 1:187730/289‑1 (MQ=255) ttCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGAAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAAt > 2:919062/1‑289 (MQ=255) cccAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACACAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGa < 2:1244325/289‑1 (MQ=255) aGATCTACCAACCTTTCACACGACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCATTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAattatt < 2:1649788/289‑1 (MQ=255) tataCCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTc < 2:1846274/287‑1 (MQ=255) tataCCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTc < 1:1917327/287‑1 (MQ=255) tataCCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCAt < 1:381840/289‑1 (MQ=255) ccTATAACCGTACCAGGCCGCGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAAATAACGCAAAAACCCCCACGCTGTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACtggtg < 2:1344064/289‑1 (MQ=255) cAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCa < 2:878087/289‑1 (MQ=255) tACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGTCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc < 1:1512648/274‑1 (MQ=255) tACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGa > 1:1694583/1‑288 (MQ=255) tACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGa > 1:250364/1‑288 (MQ=255) tACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGa > 2:1489002/1‑288 (MQ=255) aCCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCTCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGAcc < 1:1029656/289‑1 (MQ=255) aCCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGAcc > 1:916052/1‑289 (MQ=255) aCCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCACCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCACGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc > 2:965295/1‑273 (MQ=255) atgtcaacaggAACGCACCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCAGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGTCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCaa < 2:806320/280‑1 (MQ=255) ccACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAAGTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCACTaa > 1:648278/1‑288 (MQ=255) cACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAAcc > 1:1101293/1‑289 (MQ=255) cGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCaa > 1:1612576/1‑289 (MQ=255) cGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCAAGACTGGTGGAATGCAAAACAATAACCaa > 2:1932554/1‑289 (MQ=255) gggAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCaaa < 1:1360183/289‑1 (MQ=255) gggAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCaaa > 1:122659/1‑289 (MQ=255) cGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAAttaattaa < 1:980171/224‑1 (MQ=255) gCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc < 2:341892/251‑1 (MQ=255) gCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc > 1:341892/1‑251 (MQ=255) catcaGGCCCGCCTGAATTAAAGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGt < 2:119233/285‑1 (MQ=255) aGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGtt > 2:1579176/1‑289 (MQ=255) aGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGtta < 1:1489002/287‑1 (MQ=255) aGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGtta < 2:1851609/287‑1 (MQ=255) ccGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATg < 1:1311433/289‑1 (MQ=255) cGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACaa < 2:550729/275‑1 (MQ=255) cGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACaa > 1:550729/1‑275 (MQ=255) ccTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATgagg > 1:1144710/1‑289 (MQ=255) aaTTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGtt < 2:303605/289‑1 (MQ=255) atacaCGCAAAAACCCCCCCGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTACTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGtt < 2:1793100/284‑1 (MQ=255) ccACGCTTTGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATaaa > 1:508574/1‑289 (MQ=255) tttGTACCGAAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAAcc < 2:467991/289‑1 (MQ=255) cgaaaTTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCa < 2:1101293/286‑1 (MQ=255) gaaaTTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGt > 1:1851565/3‑243 (MQ=255) aaaTTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCaaa > 1:456378/2‑289 (MQ=255) gCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACaaa > 2:1355316/1‑233 (MQ=255) aaaTCATCAATGAGTAAAAAATGCGATTATTTTTCACGATATACCTATCTCTAAAACCACCTGTCAGGC‑AAACCGCCCACGCTGTATGAAAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGGCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCAt < 2:497768/288‑1 (MQ=255) aTCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATAGCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCAtt < 1:1902514/289‑1 (MQ=255) gTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGt < 2:456378/288‑1 (MQ=255) tAAAACATGCGATTATTTTTCGCGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGttt > 2:1186709/1‑289 (MQ=255) aaaaCATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATa > 1:575559/1‑241 (MQ=255) aaaaCATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATa < 2:575559/241‑1 (MQ=255) aaaaCATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTtta > 1:1188104/1‑289 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc < 1:644406/165‑1 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc > 2:644406/1‑165 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGAc > 1:1954463/1‑165 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAAtt > 1:1614506/1‑202 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAAtt < 2:1614506/202‑1 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAg > 2:373601/1‑289 (MQ=255) gCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGC‑AAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGa > 1:1940242/1‑289 (MQ=255) ttCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAgatgat < 2:1364073/289‑1 (MQ=255) tataCATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTa < 1:1114815/289‑1 (MQ=255) tataCATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTa < 1:495933/289‑1 (MQ=255) tatCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTa > 1:1027448/1‑283 (MQ=255) tCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCg > 2:1816178/1‑289 (MQ=255) tCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCg > 1:1796573/1‑289 (MQ=255) tCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCg > 1:542059/1‑289 (MQ=255) tCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCg > 1:720279/1‑289 (MQ=255) tCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCg > 1:1543113/1‑289 (MQ=255) cgcgAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTa < 2:1283921/280‑1 (MQ=255) cgcgAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGt > 2:1249777/1‑289 (MQ=255) gcgAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGAcc > 1:180854/1‑154 (MQ=255) gcgAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAACGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGt > 1:1065745/1‑288 (MQ=255) gcgAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAAGGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACAGGAGCCAAATGTTCATTCGACCTCGGGTTATTATTAGACAAGATGATTATGCTAAGTCTTctt > 2:1420537/1‑286 (MQ=255) gAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGt > 1:1276713/1‑286 (MQ=255) accaccTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTa > 1:1346541/1‑273 (MQ=255) ccTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGaaaa < 2:1858815/256‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGaa < 1:456665/289‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGaa > 1:896395/1‑289 (MQ=255) tGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTGATATCATTCAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACg < 2:660289/289‑1 (MQ=255) tGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACg < 2:1526179/289‑1 (MQ=255) tGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAg < 2:1940242/289‑1 (MQ=255) cAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCaa > 2:744053/1‑192 (MQ=255) aaaTCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAg < 1:1828518/285‑1 (MQ=255) aTCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGGACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCaa > 1:716666/1‑189 (MQ=255) aTCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGaa < 1:7070/253‑1 (MQ=255) aTCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGAt < 2:1961991/259‑1 (MQ=255) cagcagAGCACCACAAATTATCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTGACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTGTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAAt < 1:751635/289‑1 (MQ=255) agagCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATc < 1:932871/286‑1 (MQ=255) agCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACtggtg < 1:325247/89‑1 (MQ=255) agCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGAcc > 2:1638732/1‑289 (MQ=255) caccacAAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGCATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAAc > 1:196223/1‑242 (MQ=255) cacaAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTTATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATag < 2:1972237/289‑1 (MQ=255) cacaAATTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATag < 2:608609/289‑1 (MQ=255) cacaAATTACACCGCGTAATAACATTGAAAACATAAAGTAATGAACCAGATGAATTGTAATGAGGAAATTAATCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTAGTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATag < 2:1687335/289‑1 (MQ=255) aTTAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTa > 2:271244/1‑215 (MQ=255) tAGCCCGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTa > 1:168147/1‑223 (MQ=255) cccGCTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGa > 1:1112527/1‑288 (MQ=255) cTTAATATCATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCa > 2:712164/1‑252 (MQ=255) ||| CGGTGGCACATCCACCCGCCAGAACAATTCCCAGCCCGAAGATATACCCACCTATAACAGTACCAAGCCACGGGAACGCCCCGGCTTCGTAAGTCAGTAGGCCCGCCTGAATTAACGCAAAAACCCCCACGCTTTGTACGCTAATTGCAATCAGCAAGGCGTAAAACATGCGATTATTTTTCACGATATACATATCGCGAAAACCACCTGTCAGGCAAAAACGCCCACGCTGCATGACAAATCCCAGCAGAGCACCACAAATTAGCCCGCTTAATATCATACTAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATC > CP042583/1708473‑1709027 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |