| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,746,720 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,746,720 | 0 | A | T | 98.4% | 437.7 / NA | 193 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); major base T (92/96); minor base G (1/2); total (95/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,746,721 | 0 | G | C | 99.0% | 439.8 / ‑5.8 | 193 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (94/96); minor base T (1/1); total (95/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,746,722 | 0 | C | G | 99.0% | 441.3 / NA | 193 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (93/98); total (95/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
CGGATTCAGTCTCAATAACCTTAGCTTAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGAGCATGAGTCTGAGTCTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATAAGC‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑AGTCTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCAGCATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAGGCGGAT > CP042583/1746440‑1747001 ||| cGGATTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTg > 1:555446/1‑289 (MQ=255)cGGATTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTg > 1:1188279/1‑289 (MQ=255) aTTCAGTCTCAATAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGt < 1:139054/288‑1 (MQ=255) aaTAACCTTTCGTTAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTTCTGGTTTCTCTGACAt > 1:1228077/1‑289 (MQ=255) aacctttcgttAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTaa < 2:1205964/280‑1 (MQ=255) cctttcgttAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACg < 1:45254/282‑1 (MQ=255) ctttcgttAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCCGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCCGTCGCCATTGGT‑TAATCGTTGCTGGTTTCTCTGACCTTaaac > 2:703468/7‑286 (MQ=255) ttcgttAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTTCTGGGTTCTCTGACATTAACGCCa > 1:597574/5‑289 (MQ=255) tcgttAATGGGGTGCACCGTCGCTACTGGTTTCGTGGTGGTGGGTGCCAGCGTGGTGCGGGAAGACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCGGAACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGGCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCaa < 2:1862385/286‑1 (MQ=255) tGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGGTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTCTCGCCCTTGGCATCGCG‑TTCCCGTTTTCTCTGACATTAACGCCACTGAtttg > 2:1602460/1‑289 (MQ=255) cgcTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGGATTTGCCGTGTCGCTTTCTGTCGCCATTGGTATTACC‑GTGCTGGTTTTTCTGACCTTAACTCCAATGATGTGTgg > 2:1046896/1‑289 (MQ=255) cTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTctct > 1:207239/1‑263 (MQ=255) cTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGAtgtgtg > 1:1633654/1‑286 (MQ=255) acgaTCGCTACTGTTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGATGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGa < 1:915052/286‑1 (MQ=255) cGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGAGGTGTGGCTGGATGCTg > 1:374509/1‑289 (MQ=255) cTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGTAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCCCTGACATTAACGCCAATGATTTTTGTCGGGATGCTTAAAg > 2:1351698/1‑288 (MQ=255) cTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGa > 1:1215667/1‑279 (MQ=255) cTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGa < 2:1215667/279‑1 (MQ=255) tggATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTgg < 1:1120495/262‑1 (MQ=255) tggagagtccATAGTGGGGATGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGACACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGACGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGTTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGAGGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCcgcg < 2:1515517/280‑1 (MQ=255) cGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGTATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGGCCGAGCaa > 2:644207/1‑289 (MQ=255) cGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCaa > 1:503038/1‑289 (MQ=255) cATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCGCGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAg < 1:1778650/289‑1 (MQ=255) cATCGTGGGGCTTGAAAGCGTTGCGTGTCCTCTGGAAGCGGGCATGAAACCGTGGCAAGCCGAACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTGTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAg < 2:18903/289‑1 (MQ=255) aTCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGc > 1:678865/1‑289 (MQ=255) tCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCg > 2:246154/1‑289 (MQ=255) cGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCg > 2:114434/1‑288 (MQ=255) gtggtgCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTCGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCCTTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCCGACCTTAACCCCAATGGCGTGTGGCCGGCTGCTGACAGCCAGCAAGCGACGCGCGCAACAGCGa > 2:378734/1‑288 (MQ=255) gAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGAtgtg > 2:2000466/1‑236 (MQ=255) tGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGc < 1:246154/289‑1 (MQ=255) cACGTGATCTGGAAGCGGGAATGGAACCGTTGCACGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTGACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGATTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCa < 2:1387960/288‑1 (MQ=255) cACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTTACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCCAAAGCGATAGCGT‑GTGTTTGGTCGCAt > 2:368609/1‑289 (MQ=255) cACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCCTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAAGGAAGTTTGGCTGGTTGCTGAAAGCCAGCAAACCGCGCGCGCCAAAGCGACTGCGTGGGTTTTggcg > 2:1962262/1‑284 (MQ=255) ggAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGcc < 1:1043356/289‑1 (MQ=255) aGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCCTTCTGTCGCCATTGGTATCTCG‑TTGATGGTTGTTCTGACATTAACGCCCATGATGTGTGGCTGGATGCTGACAGCCTGCACGCCGCGCGAGCAAAAGGGTCTGCAT‑GGGTCTTGTCGACTGTTGTGAGcctgt > 2:1320805/1‑286 (MQ=255) gtgaggacaCCGTGGGAAGCCGTATGTCAAGGTACGCGCGGAGCTGTGTTTCCGGTGCTGTCTGTGGGTCGGTGACTGGGGGCGGTGGTCCGGCCGCTGCTGTTGATAGGCGGATTGCCTGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCGTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGAGGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGcaa < 2:1257277/280‑1 (MQ=255) ggAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTTACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGcaac > 1:396102/1‑289 (MQ=255) ggAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGcaac > 1:1287898/1‑289 (MQ=255) gAATGAAACCGTTGCCAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAACTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGTTGCTGTTGATGGGCGGAGTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGcaac < 1:690824/288‑1 (MQ=255) ttGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCa > 1:137877/1‑289 (MQ=255) tGCATGCCGCAGTGCAAGGTGCTCGCGAAGTCGGTTTTACGGGGCTGTCGATGGGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTAACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCaa < 1:1004440/289‑1 (MQ=255) gCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCACTGATGTGTGGCTGGATTCTGAAAGCCAGCAATCCGCGCGAGCAAACGCGACGTCGT‑GGCGTTGGTCTCGTGTTGGGAGGCCTTCAACACggagccgctaaagtt > 2:1417905/1‑275 (MQ=255) cGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAgg > 2:7438/1‑273 (MQ=255) aCTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTc < 1:1962262/288‑1 (MQ=255) tCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCaa > 1:721618/1‑288 (MQ=255) gTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAagt > 2:1639440/1‑261 (MQ=255) gTCGGTTTTACGGTGCTGTCGATGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑GCACTAAAATGGGTGCTCAATCATAccc > 1:22611/1‑289 (MQ=255) tgctgtcgaTGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCg < 2:495316/280‑1 (MQ=255) tgctgtcgaTGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCg < 2:1287898/280‑1 (MQ=255) ctgtcgaTGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCTCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGCTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑GCACTAAAATGGGGGCTCAATCATAACCGCCTGGTtggtcggg > 2:1943241/7‑284 (MQ=255) ctgtcgaTGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGccc > 2:544/7‑226 (MQ=255) ctgtcgaTGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCgtgg > 1:109164/7‑289 (MQ=255) tcgaTGAGTCTGTCACTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCg < 2:1763031/206‑1 (MQ=255) gagtctgtcactGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGt > 2:664279/1‑213 (MQ=255) gagtctgtcactGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCtt > 1:487880/1‑289 (MQ=255) gagtctgtcactGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGAGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCtt > 2:165661/1‑289 (MQ=255) tctgtcactgGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCgtggtg > 2:929182/8‑280 (MQ=255) tctgtcactgGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCgtggtg < 1:929182/273‑1 (MQ=255) tgtcactgGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACCTTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTAAATCATACCCGCCTGGTGCGCGTGGTGTCGCTTGGCa > 2:560464/6‑288 (MQ=255) tgtcactgGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCAt > 1:891413/6‑202 (MQ=255) tgtcactgGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCAt < 2:891413/197‑1 (MQ=255) tgtcactgGTGGCAGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTCACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATTCTGTGTGGCTTGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCCCGAGCAAAAGCGACTGCGG‑GTTTTTGGTCCGACGTTGGTAGCCCTGCAACCAGGCCACGGCGAGTTATCT‑AAACGTGTGGTCCATCATCCGCGTCTGGGGGGCGTTGTCCTGCTTGCCa > 2:111410/6‑288 (MQ=255) gtggCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTctct < 1:776255/110‑1 (MQ=255) gtggCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGc < 2:1371442/241‑1 (MQ=255) gtggCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTgctgct < 1:1242886/275‑1 (MQ=255) gtggCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTgcg < 1:1602460/288‑1 (MQ=255) gtggCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATCAACGCCAATGATGTGTGGCTGGCTGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGTTGGGCGTGGTCCGGCTTGGCACCAtctc > 2:584571/1‑284 (MQ=255) cGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCaa < 1:1727074/220‑1 (MQ=255) cGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCaa > 2:1727074/1‑220 (MQ=255) cGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCa > 2:84548/1‑279 (MQ=255) cGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCa < 1:84548/279‑1 (MQ=255) gtgtTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCa > 2:1690364/1‑277 (MQ=255) gtgtTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCa < 1:1690364/277‑1 (MQ=255) ccggCCGCTGCTGTTGGTGGGCGGATTGCCGGGCCGACGGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTgg < 2:1633654/286‑1 (MQ=255) ccTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTgg < 1:193286/289‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCt < 1:1327039/289‑1 (MQ=255) tggATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATctcga < 1:683192/287‑5 (MQ=255) gCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGaa > 2:1096536/1‑289 (MQ=255) gCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGaa > 1:1999852/1‑289 (MQ=255) cGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAAt < 1:514449/214‑1 (MQ=255) cGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAAt > 2:514449/1‑214 (MQ=255) gATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTgg > 2:312774/1‑266 (MQ=255) gATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGc < 1:1571923/267‑1 (MQ=255) gATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGc > 2:1571923/1‑267 (MQ=255) ttGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAAt > 1:1491393/1‑199 (MQ=255) ttGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAAt < 2:1491393/199‑1 (MQ=255) gggCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGACAACcttctt > 1:66114/1‑288 (MQ=255) tcgttaccgggaTTTGCCTGGACGTTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCGGCCCTTAACGCAAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAg < 2:22611/277‑1 (MQ=255) cTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAg < 1:1740031/288‑1 (MQ=255) gTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAg < 1:1355804/289‑1 (MQ=255) aTTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCATTGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGc > 1:1877483/1‑289 (MQ=255) aCGCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATgg > 1:1766179/1‑289 (MQ=255) cgcgTTCTGTGGGCATTGGTTTATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATggg < 2:1915496/289‑1 (MQ=255) gCTTTCTGTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATggg < 1:191356/288‑1 (MQ=255) gTCGCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTc < 1:316113/289‑1 (MQ=255) gCCATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAgg > 2:698800/1‑289 (MQ=255) ccATTGGTTTATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACAGTAACGCCAATGAGGTGTGGGTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGCCTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAgg < 2:1228077/288‑1 (MQ=255) cATTGGTATATCG‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAGGCg < 1:562299/289‑1 (MQ=255) tGGTATATGG‑TTGCTGGTTTCTCGGACATTAACGCAAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGGATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑TCACTAAAATGGGAGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAGGCGGAt < 1:1539834/289‑1 (MQ=255) tGGTATAGTG‑TTGCTGGTTTCTCTGTCATTAACGTCAATAATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAGGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTAAGGCAAG‑TCACTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCTCGATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAGGCGGAt < 1:746459/289‑1 (MQ=255) ||| CGGATTCAGTCTCAATAACCTTAGCTTAATGGCGCTCACCATCGCTACTGGTTTCGTGGTGGATGACGCCATCGTGGTGCTGGAAAACATTGCACGTCATCTGGAAGCGGGAATGAAACCGTTGCAAGCCGCACTGCAAGGTACTCGCGAAGTCGGTTTTACGGTGCTGAGCATGAGTCTGAGTCTGGTGGCGGTGTTCCTGCCGCTGCTGTTGATGGGCGGATTGCCGGGCCGACTGTTACGCGAATTTGCCGTGACGCTTTCTGTCGCCATTGGTATAAGC‑TTGCTGGTTTCTCTGACATTAACGCCAATGATGTGTGGCTGGATGCTGAAAGCCAGCAAGCCGCGCGAGCAAAAGCGACTGCGT‑GGTTTTGGTCGCATGTTGGTAGCCCTGCAACAAGGCTACGGCAAG‑AGTCTAAAATGGGTGCTCAATCATACCCGTCTGGTGGGCGTGGTGCTGCTTGGCACCATTGCGCTGAATATCTGGCTGTATATCAGCATCCCGAAAACCTTCTTCCCGGAGCAGGACACTGGCGTGTTGATGGGCGGGATTCAGGCGGAT > CP042583/1746440‑1747001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |