Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,776,865 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,776,865 | 0 | A | T | 100.0% | 440.2 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (104/84); total (104/84) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,776,866 | 0 | G | C | 98.9% | 433.1 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base C (103/82); minor base A (1/1); total (104/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,776,867 | 0 | T | A | 100.0% | 446.0 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (104/84); total (104/84) |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CACGGAATCTCTTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATAGTCTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACAGTCATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTAGTCATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACGTTTCGCGGCGCAGC > CP042583/1776588‑1777141 ||| cACGGAATCTCTTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCg > 2:1614288/1‑288 (MQ=255) cACGGAATCTCTTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCg > 1:477838/1‑288 (MQ=255) aCGGAATCTCTTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGt < 1:1667117/288‑1 (MQ=255) aTCTCTTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGaa < 1:1555564/289‑1 (MQ=255) ctTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAaga < 2:957660/289‑1 (MQ=255) ctTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAaga < 1:823973/289‑1 (MQ=255) gcgcAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATAAGGGAAAATGACAACTACTAACATTATCGTCTGGaacaaaatg > 2:1681768/1‑282 (MQ=255) cGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGa < 1:997250/289‑1 (MQ=255) tGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGc > 2:1280201/1‑288 (MQ=255) gAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGtt > 2:1519367/1‑289 (MQ=255) ggAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAaga > 2:314593/1‑245 (MQ=255) ggAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAaga < 1:314593/245‑1 (MQ=255) aCTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCt > 1:789614/1‑289 (MQ=255) aCTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCGGTATGTATTGGCAAAGTTTCGGCGGGAGATggat > 2:814879/1‑287 (MQ=255) cTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGa < 1:1531766/250‑1 (MQ=255) tGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCttt < 1:937197/289‑1 (MQ=255) gggTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTTTATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGACTGTCTGGAACCGGTATATATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGGTggacttg > 2:694065/1‑284 (MQ=255) gTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGa > 2:1741156/1‑288 (MQ=255) tttCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATgaga > 1:287378/1‑289 (MQ=255) tttCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATgaga > 1:890902/1‑289 (MQ=255) tttCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATgaga > 2:586374/1‑289 (MQ=255) tttCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATgaga > 2:1441770/1‑289 (MQ=255) aaTTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCAAGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGCACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAATATATGGGAAAATGACAACTAATCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGGCTGGAACCTGTATTAATTGGTATAGTTGCCGGGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGGATCTATGAGaaaacac > 2:202144/1‑286 (MQ=255) ttATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCAt < 2:1254527/289‑1 (MQ=255) tCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCGTCTGTTcgc > 2:731114/1‑289 (MQ=255) cccGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCgg > 1:946783/1‑289 (MQ=255) cGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGt < 2:1376658/289‑1 (MQ=255) ggAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTgaga > 1:1149194/1‑235 (MQ=255) ggAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTgaga < 2:1149194/235‑1 (MQ=255) ggAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTg > 1:931113/1‑289 (MQ=255) ggAAAACTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTg > 1:525942/1‑289 (MQ=255) aaaaCTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAg > 2:256631/1‑289 (MQ=255) aaaCTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAgg < 1:1644402/289‑1 (MQ=255) aaaCTGGATCCAGCACGGAATTCACTCTTGGTGTAGTGGCATGACTACGAGGGGCGGGTTGAAGAGATACTGAATGGCTGGAACGCCCCGGAAGCCGAATTATACGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATTGGAAATTGACAACTCCTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGATCCTGTAGTTATTGGCACAGTTGGCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGTCTGCGTATCAATGAGAAGAAGCATCTGTTCGCGGGTGAgg < 2:728077/289‑1 (MQ=255) aCTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGAc < 1:131286/289‑1 (MQ=255) cTGGATGCTGCACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACt < 1:1614288/289‑1 (MQ=255) tgcACGCAATTCACTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTtctc > 1:1012677/1‑289 (MQ=255) gcaattcactctTTGTTCCGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTAt < 1:323208/281‑1 (MQ=255) actctTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGa < 1:1636238/288‑1 (MQ=255) ttGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGa > 1:1623249/1‑289 (MQ=255) gTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATg < 2:525942/289‑1 (MQ=255) tCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATgc < 1:1280201/288‑1 (MQ=255) cAGCGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGt > 1:1247113/1‑252 (MQ=255) gTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTgaga < 2:1696072/197‑1 (MQ=255) ttACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCATATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGt < 1:974100/289‑1 (MQ=255) ttACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCAt < 2:1638327/232‑1 (MQ=255) ctacCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTct > 1:1102338/1‑288 (MQ=255) acCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTct > 1:1890383/1‑286 (MQ=255) ccAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTctgctg < 1:103913/289‑1 (MQ=255) ggggCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTg > 2:139083/1‑289 (MQ=255) ggggCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTACCCTCGGACTGGATGCGCTACCAGGTCTTCTGTTg > 2:860622/1‑289 (MQ=255) ggCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTgg < 1:641953/288‑1 (MQ=255) ggCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTg > 1:1682781/1‑287 (MQ=255) ggCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTAACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATTAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTgg < 2:955566/288‑1 (MQ=255) cGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAACGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTAACCGCGGAATGGATTCGCTACCCGGGCTGCTGTCGGCtt > 2:1000223/1‑289 (MQ=255) gggTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCttt > 1:1425881/1‑289 (MQ=255) gTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCg < 1:1174229/253‑1 (MQ=255) gTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTAc < 1:1444850/268‑1 (MQ=255) gTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTAc > 2:1444850/1‑268 (MQ=255) agggggccggAAGGGCGGGAACTGCCGGGAAGCGCAATTAGCAGAACGGGCGCGCCGGAGCGGTCACATAGAAGCGTTGATTAACATATGGGAAAATGACGACTACTGACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGGCTGGAACCTGTATTGAGTGGCAGAGTGGGGGCGGGGGGGGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCtttttcaca < 2:1536987/279‑6 (MQ=255) agagATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCtttttcaca < 1:1519367/288‑6 (MQ=255) aaTGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAg > 2:791050/1‑289 (MQ=255) aTGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGa < 1:1741156/289‑1 (MQ=255) cTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACa > 1:716105/1‑289 (MQ=255) cccGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTa > 1:1802143/1‑289 (MQ=255) caATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAAtt > 2:49702/1‑289 (MQ=255) aGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGcaca > 2:1163778/1‑117 (MQ=255) aGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGcaca < 1:1163778/117‑1 (MQ=255) aGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTg > 2:1197093/1‑139 (MQ=255) aGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTg < 1:1197093/139‑1 (MQ=255) gAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCa > 1:431008/1‑288 (MQ=255) aCAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTgg < 1:747259/282‑1 (MQ=255) aCAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTgg > 2:747259/1‑282 (MQ=255) gcgcTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGa > 1:1213903/1‑287 (MQ=255) cTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTgg > 1:312823/1‑289 (MQ=255) cGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGgcgc < 1:876550/289‑1 (MQ=255) gCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACCTTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCt < 1:696862/289‑1 (MQ=255) gCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCt < 2:1425881/289‑1 (MQ=255) gTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGTTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCt > 2:1179152/1‑287 (MQ=255) gTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTg < 2:431008/288‑1 (MQ=255) tCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAGAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCCCAGTTGCCGCGAGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGATAAACAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGTTTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCAAACAGGAACATTTCCGTTAATTTTTATTTTTCGCGCTATCGAACTGTGGCTGccgact > 2:1462715/1‑285 (MQ=255) acaTAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAACGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGAAACATAACTGGCGCTGCCCGTTg > 2:1843065/1‑288 (MQ=255) acaTAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTg > 1:24122/1‑288 (MQ=255) gCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGTTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTACATTTTTGCGCAACAGACTTGGCCCTGCCTGTTGCCCATGTCt > 2:1862672/1‑289 (MQ=255) ttaattaaCATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCaa > 1:309472/1‑256 (MQ=255) ttaattaaCATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCaa < 2:309472/256‑1 (MQ=255) ttaattaaCATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGc > 2:180147/1‑289 (MQ=255) taattaaCATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCg > 1:595501/1‑289 (MQ=255) ttaaCATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACg < 2:287378/289‑1 (MQ=255) cATATGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGGAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTgaga < 1:1283206/86‑1 (MQ=255) atatGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGAt < 2:1906165/171‑1 (MQ=255) atatGGGAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGAt > 1:1906165/1‑171 (MQ=255) gggAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAAc < 2:1302260/244‑1 (MQ=255) gggAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGccc < 1:271814/267‑1 (MQ=255) gggAAAATGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTCTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACGTTTCgcggc > 2:90596/1‑289 (MQ=255) gAAAAGTACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACGTTTCgcggcg < 2:1213903/288‑1 (MQ=255) aaaTGACAACGACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACGTTTCGCGGCGCa < 1:1462715/288‑1 (MQ=255) aaTGACAACTACTAACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTAGTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACGTTTCGCGGCGCAGc < 1:1090698/289‑1 (MQ=255) aTGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTg < 2:1707886/255‑1 (MQ=255) aTGACAACTACTCACATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTTCACATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTg > 1:1707886/1‑255 (MQ=255) ||| CACGGAATCTCTTGCGCAACGCATGGAACAAAAAAGTGGACGAGTTGTATTACAGGAACTGGGTTTTGGGGATGATGTATGGCTGTTTCTGAATTATATACTCCCCGGAAAACTGGATGCTGCACGCAATAGTCTCTTTGTTCAGTGGCATTACTACCAGGGGCGGGTTGAAGAGATCCTGAATGGCTGGAACTCCCCGGAAGCACAATTAGCAGAACAGGCGCTCCGCAGCGGTCACATAGAAGCGTTAATTAACATATGGGAAAATGACAACTACAGTCATTATCGTCCGGAAAAGAGTGTCTGGAACCTGTATTTATTGGCACAGTTGCCGCGTGAGATGGCTTTGACCTTCTGGCTGCGTATCAATGAGAAAAAGCATCTGTTCGCGGGTGAGGACTATTTTCTCAGTATCCTCGGATTGGATGCGCTACCAGGTCTGCTGTTGGCTTTTAGTCATCGTCCAAAAGAAACATTTCCGTTAATTTTAAATTTTGGCGCAACAGAACTGGCGCTGCCTGTTGCCCACGTCTGGCGACGTTTCGCGGCGCAGC > CP042583/1776588‑1777141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |