Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 520,591 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 520,591 | 0 | A | T | 97.4% | 615.5 / NA | 266 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (135/124); minor base G (3/4); total (138/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 520,592 | 0 | C | G | 100.0% | 620.0 / NA | 266 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (138/128); total (138/128) | |||||||||||
* | CP042583 | 520,593 | 0 | T | A | 99.2% | 627.3 / NA | 266 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (135/128); minor base C (2/0); total (138/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GAATGCCCCCTTTTTGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGGCTTGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGACTATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCACCAAATTCAATGAAACGGGG > CP042583/520317‑520869 ||| gAATGCCCCCTTTTTGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACg < 2:1205624/289‑1 (MQ=255) gAATGCCCCCTTTTTGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACg < 2:1325750/289‑1 (MQ=255) aaggCCCCCTGTTTGCAATACAGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACg < 2:751627/285‑1 (MQ=255) aagcccaccattctGCAATAACGGTGGCGCACCGCGAGGTAGCAAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGATCAATGCCAGTTCAGGAGCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCGGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGGGAATTATTGGTACg < 2:348230/275‑1 (MQ=255) cccccTTTTTGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACACCCGTTGACCTGCCGTCAGTTGGGAATTATTGGTACGCCGt > 2:1483567/1‑288 (MQ=255) tttttGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGa < 2:1488397/289‑1 (MQ=255) ttttGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCCGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGa > 1:957951/1‑288 (MQ=255) tttGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATc > 1:1594205/1‑289 (MQ=255) gCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGt < 1:1861458/289‑1 (MQ=255) atGTTGGTGCCTCGGGATTGAGCAAACGCAGGCGCCCCGCGCCACGGGGGGATGAGACGTTGGTATGGCCGTGGATCGCCAGCAGTAGGAGCAAGTTATCGAGCAATGCCAGTTAAGGATCTAACCCCTGGTCCAGCAGGGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCGGCTTCGGCTGCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGcc < 2:1953330/289‑1 (MQ=255) gcgcTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACtt > 2:977483/1‑289 (MQ=255) gcTGTAGCCAACGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACACCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACCCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTgc < 1:566369/289‑1 (MQ=255) cggtggCCAGCGCAGGCCCCCCCAGCCACCGGGCAATGCAACGTTGGTATCGCCTTTGATCGCCATCGGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATACCCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTgc < 2:1301759/283‑1 (MQ=255) aGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGCGATGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGa > 2:388140/1‑289 (MQ=255) cgcgcgatGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTa > 2:288853/8‑288 (MQ=255) cgcgatGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGtt < 1:1323763/221‑1 (MQ=255) cgcgatGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCg > 1:1303769/6‑289 (MQ=255) tGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCATTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGACACTTGCCGCCGAAGAAAAACCGTGTGTTGGCTGTACCggttgg > 2:1384054/1‑289 (MQ=255) gTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGGCAGTTGTGAAGTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCACCCGTAGAATAAACGGTTGTGTGCGTGACCGGTCGgttgagttgac > 2:1628717/1‑288 (MQ=255) gCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGa > 2:1317905/1‑246 (MQ=255) tGAGCGCGATCAGTAGGAGCAAGGTATCGGGCAATGCCAGTTAAGGATCTAACCCCTGATCGAGCAGAGTGAGGTAAGACGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGcc < 2:1109051/289‑1 (MQ=255) gATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCCGTTGTGCATTATTGGTACGCAGTTCGCTATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTCGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGCGTTGACGCAAAGGGcaa > 2:110381/1‑287 (MQ=255) gCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTg < 1:716176/289‑1 (MQ=255) aGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGca < 1:1240556/285‑1 (MQ=255) aGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATagca > 1:1136304/1‑289 (MQ=255) aGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCggttggt > 1:1973052/1‑249 (MQ=255) aGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGcc > 2:1244863/1‑288 (MQ=255) gTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACAAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGCCCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAATTGGTTGTTGTAGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTa > 1:1087586/1‑289 (MQ=255) cGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGCCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTGGTTGGCGTTACCGGCTGGTTGAGTTGGACCAAACGCCCACTTCCCGCCCACAGCCCCCCTAAAGa > 2:1538452/1‑289 (MQ=255) aTGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAt > 2:687489/1‑289 (MQ=255) tGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAAc > 1:1384204/1‑213 (MQ=255) tGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAt > 2:763885/1‑288 (MQ=255) tGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAt > 1:538065/1‑288 (MQ=255) cAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAtgct < 1:2000194/288‑1 (MQ=255) cAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTCAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAtgct < 1:436865/288‑1 (MQ=255) ttCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCt > 1:166505/1‑289 (MQ=255) aTCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATg < 1:779077/288‑1 (MQ=255) aaCCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGa < 1:856864/156‑1 (MQ=255) aaCCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTCGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCCCCTAGCCGCCCTAACGGACAAATCCCACCTTTATGCgtgt > 2:779077/1‑289 (MQ=255) aCCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGtt < 1:1993868/289‑1 (MQ=255) aTCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGcc > 2:1333014/1‑288 (MQ=255) gcagAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCg > 2:165764/1‑273 (MQ=255) gcagAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGt > 1:1402096/1‑289 (MQ=255) gTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGcc > 1:1423717/1‑221 (MQ=255) gTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGgcgc > 1:1512885/1‑289 (MQ=255) gTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGgcg < 1:1538452/288‑1 (MQ=255) tGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGcc > 1:1408875/1‑277 (MQ=255) tGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGcc < 2:1408875/277‑1 (MQ=255) tGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGcgcg > 2:491245/1‑289 (MQ=255) tGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGcgcg > 1:996620/1‑289 (MQ=255) tGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTAACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGCCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAAT‑‑‑CGCACATAGCCGCCACAAACAAAAAAGAATGCCTTTATGAGTGTTTACGCCCCCACTGGCCAGGaa > 2:1987293/1‑289 (MQ=255) gAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCgg < 1:1201897/289‑1 (MQ=255) aGGTAATGCGGCAAGGCTTGCTTGCTGACCAGTGCATACCCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCGGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCgg < 2:1466181/288‑1 (MQ=255) aGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCgg < 1:491245/288‑1 (MQ=255) tAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAtg < 2:1730869/249‑1 (MQ=255) tAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAAtg > 1:1730869/1‑249 (MQ=255) cGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTAGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGACCAATTGCCGGACATAGCAGACCTAAATAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGCGGACCTGAACatact > 2:1163511/1‑286 (MQ=255) aGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGgcg > 1:1022800/1‑272 (MQ=255) tgattgatCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCaa < 1:388140/288‑1 (MQ=255) gattgatCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGc < 1:288853/289‑1 (MQ=255) atCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGc > 1:1755288/1‑284 (MQ=255) cACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCCTACCa > 1:529682/1‑289 (MQ=255) cACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCa > 1:1382097/1‑289 (MQ=255) ccAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAAt < 1:359522/289‑1 (MQ=255) cAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGca < 2:1199209/199‑1 (MQ=255) gttaagccccattCGGTTTCCGCGCGTGGTCGGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTTACCTGCCGTCAGTTGGGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCAGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGc < 2:831993/278‑1 (MQ=255) gATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGc < 1:1482335/230‑1 (MQ=255) gATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCg > 2:1389487/1‑231 (MQ=255) gATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCAc > 2:158465/1‑264 (MQ=255) aCCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAGCTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAAt < 2:230556/289‑1 (MQ=255) aCCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAAt < 2:538065/289‑1 (MQ=255) cccGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAAt < 2:16940/278‑1 (MQ=255) cccGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAAt > 1:651165/1‑288 (MQ=255) cccGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAAt > 1:82494/1‑288 (MQ=255) cccGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAAt > 1:1248295/1‑288 (MQ=255) cccGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGCTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATag < 1:1842047/194‑1 (MQ=255) cccGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGCTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATag > 2:1842047/1‑194 (MQ=255) gCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTg < 1:1348524/181‑1 (MQ=255) gCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTg > 2:1348524/1‑181 (MQ=255) gCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATag > 1:472800/1‑191 (MQ=255) gCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCAAACCCATTCTGCGTAATCCgg > 2:1035341/1‑288 (MQ=255) ttCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCTGTGGCGCGGCACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTgg > 1:733635/1‑289 (MQ=255) ttCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTg < 1:1706563/288‑1 (MQ=255) ccGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGGGTAATCCGTGGAGTACCGCtt < 1:763885/289‑1 (MQ=255) tGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTg < 1:1198387/273‑1 (MQ=255) aGGCAAAGCTCTTGGTCAAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTTTGAATTATTCGTACACAGTTCGGGATCGGGCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCg < 2:733635/289‑1 (MQ=255) tGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAg < 1:1035341/288‑1 (MQ=255) tGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCa > 2:517536/1‑288 (MQ=255) aCAGCCGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCACCaaa < 1:1650385/289‑1 (MQ=255) ccGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTg < 1:901602/193‑1 (MQ=255) ccGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTg > 2:901602/1‑193 (MQ=255) cGTTGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCTTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTCCCATTTCCTCACTAACGGCACCAAATTCaa > 2:620597/1‑289 (MQ=255) ttGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCACCAAATTCAATg > 2:443240/1‑289 (MQ=255) ttGACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCACCAAATTCAATg > 1:237100/1‑289 (MQ=255) gACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGCGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACTGGCGCCAAATTCAATGaa > 2:1781365/1‑289 (MQ=255) gACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGc > 1:750288/1‑256 (MQ=255) gACCTGCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCACCAAATTCAATGaa > 1:332441/1‑289 (MQ=255) gCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTTCCATTTCCGCACCACAGGCACCAAATTCAATGAAACggg > 1:191224/1‑289 (MQ=255) gCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAg > 2:1683920/1‑267 (MQ=255) gCCGTCAGTTGTGAATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAg < 1:1683920/267‑1 (MQ=255) ||| GAATGCCCCCTTTTTGCAATAATGTTTGCGCCTCGCGCTGTAGCCAGCGCAGGCCCCCCTCGCCACCGCGGCTTGCAACGTTGGTATCGCCGTTGATCGCCATCAGTAGGAGCAAGGTATCGAGCAATGCCAGTTCAGGATCTAACCCCTGATCCAGCAGAGTGAGGTAATGCGGCAAGGCGTGATTGATCACCAGTGGATAACCCGCTTCGGCTTCACCGCGTGCGCCGGTAAGGCCAAGCTGTTGGTACAACCGTTGACCTGCCGTCAGTTGACTATTATTGGTACGCAGTTCGCGATCGGTCAGGCCACGGCAGAAACTTGCCGCCGTAGAACAAACGGTTGTTGGCGTTACCGGTTGGTTGAGTTGAAGCAAACGGCCAATTGCCGCACATAGCAGCCCTAAAGAAAAAATGCTGCCTTTATGCGTGTTTACGCCCGCAGTGGCGCGGAACATATCACCTTCGCAAGCCATACCAATTGGGCGTAATCCGTGGAGTACCGCTTCTGGTGCCATTTCCGCACTACAGGCACCAAATTCAATGAAACGGGG > CP042583/520317‑520869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |