Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,808,128 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,808,128 | 0 | A | T | 99.5% | 513.1 / NA | 215 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,808,129 | 0 | G | C | 100.0% | 508.7 / NA | 215 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (113/102); total (113/102) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,808,130 | 0 | T | A | 100.0% | 510.1 / NA | 215 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (113/102); total (113/102) |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
GGCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCAAGTGATATTGTTCTCGATTACGCAGGCTTTCGTACGCTGGATTCCATCGTGCGTACACGCAAAGTTTTCGATACTAATGATTTCATTATTATCACCCAACGTTTCCACTGTGAGCGAGCATTATTTATTGCGCTGCATATGGGGATTCAGGCTCAGTGTTATGCCGTACCGAGTCCGAAAGATATGCTGAGTGTACGTATTCGTGAATTTGCCGCCCGTTTCGGTGCGCTGGCTGACCTTTATATTTTTAAACGTGAACCGCGTTTTTTAGGGCCGCTGGTC > CP042583/1807852‑1808409 ||| ggCCTCGATCGCTGGATGAGCTGGAAAACCGCGCCTTATATCTACGACGAATTGCAGGATCTCCCCTACCGCCAGGTCGGTGTGGTGCTCGGAACAGCAAAATATTATCGTACTGGCGTAATTAATCAGTATTATCGCTACCGCATTCAAGGAGCGATTAATGCCTATAACAGCGGTAAGGTAAATTATCTATTACTGAGCGGCGATAACGCATTGCAAAGTTATAATGAGCCGATGACCATGCGCAAAGATTTAATCGCTGCTGGTGTCGACCCATCAGATATTGt > 2:1044200/1‑287 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |