Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,819,348 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,819,348 | 0 | A | T | 99.6% | 600.0 / NA | 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (127/125); minor base C (1/0); total (128/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,819,349 | 0 | G | C | 99.2% | 586.2 / NA | 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (124/125); minor base T (2/0); total (128/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,819,350 | 0 | C | G | 100.0% | 596.3 / NA | 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (128/125); total (128/125) |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGAGCCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACAGTATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTAGCGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCGGGATATGATCACAGTTAC > CP042583/1819073‑1819626 ||| ttGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGcc < 1:283962/289‑1 (MQ=255) gATGCCAGCAACCAGCCCGCGCGGGGAAAATGTTGCCAACTACGATTGGTACGATTTAGGCGAGGGCGGAGGCTTTTTTCTTACTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGCTTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAAt < 2:122089/289‑1 (MQ=255) gCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCg > 1:1853070/1‑289 (MQ=255) gCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCg > 1:1721230/1‑289 (MQ=255) gCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCg > 1:1879268/1‑289 (MQ=255) acacCAGCCCGCGCGGCGGAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTTGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGACGCCGCATTACCCGACGTTTGCATACCTGGGCGATGAATTTCCGGCGCTGATTCCGTCGCACTTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCACTCAGCGGTCACCCAAGCAGTGTTCAGGGTTCCGTGATTA‑CGCGCAGGAAACATCCGGTTAACTACACAATCGTTCTGGTCTTTGCACCAATtggagatctgttcg > 2:1577387/1‑276 (MQ=255) cccGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCg > 1:1636428/1‑289 (MQ=255) ccGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGt > 1:1379327/1‑289 (MQ=255) cAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTagc < 1:860548/289‑1 (MQ=255) aaaCGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCGTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCGGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTagc < 2:1475324/288‑1 (MQ=255) acgacgATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTagcag < 2:1632840/289‑1 (MQ=255) cgaTGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGCTTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGGGAATCCGTGCAGCGCCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTAAGCAGCtct > 2:1493670/1‑287 (MQ=255) cGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAg > 1:1227633/1‑289 (MQ=255) cAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATg < 2:1450528/289‑1 (MQ=255) cAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCAACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATg < 2:228013/289‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCAt > 1:1798633/1‑289 (MQ=255) ggCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTCGGGCATACAAGCGTTTACCAGCTATTTCGGGTAGGACAAAAATGCAt > 2:139334/1‑289 (MQ=255) gcgcAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGc < 1:1301522/286‑1 (MQ=255) cAGGCTTTATACTTAATGCCACGCAACGGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGGATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGGCAGCGACCGCGGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGc < 2:1304557/288‑1 (MQ=255) aGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTg > 2:1272878/1‑289 (MQ=255) ttttATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGaa < 1:1074136/288‑1 (MQ=255) ttttATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGACTTACCGGGTGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGaa < 2:334224/288‑1 (MQ=255) ttataccTTAAGGCGACGAAAGCGCCGGTGGGGACGAATTACCGGATTTATGATGAGCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGTCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGaa < 2:852447/282‑1 (MQ=255) tttATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCCTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATg > 2:1672057/1‑289 (MQ=255) aTCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGTGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGAAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 2:1877074/289‑1 (MQ=255) aTCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 1:1953373/289‑1 (MQ=255) aTCTTAATGCCACGAAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGTGGTATGAGTGTCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGGTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGACAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 2:111619/289‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGGCCTGGTTCAGTCGTAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGGCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt < 2:1638405/289‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt < 1:1710929/289‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt < 1:395728/289‑1 (MQ=255) aTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGa < 1:839054/259‑1 (MQ=255) aTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTg > 2:1766154/1‑289 (MQ=255) aTGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGGGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTGAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCAGTAATGGGAAAGtt > 2:481205/1‑288 (MQ=255) cgaCGCAACCGCCGTGGGGGACGCCTTACCGGATGTAGGATTATCTGAGCCATGAATTACCGGCGCTTGTTCAGTCGCAATTGAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCAATCAATGGGTGGTCACGGTGCGATGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgcg < 2:1482764/286‑1 (MQ=255) aCGAAACCTCCGTGGGCGCACCATTACCGGATGTATGATTAGCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc < 1:969056/289‑1 (MQ=255) cGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgcgc > 2:1257187/1‑286 (MQ=255) ccgccgTAGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGCCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACACACATGCATGGCTGGAATGGGAAAGTTGCGCAGTGagtg > 2:1335839/1‑286 (MQ=255) ggCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgcg < 1:820861/272‑1 (MQ=255) cGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCa < 1:1770123/245‑1 (MQ=255) cGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 2:705968/259‑1 (MQ=255) cgtaTGTGTGTTTATCTGCGCGATTAATTACCGGCGCTGGTTCAATCGCACTTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGAGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAACATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATg < 2:1416230/286‑1 (MQ=255) gATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt < 2:1542022/254‑1 (MQ=255) gATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt > 1:1542022/1‑254 (MQ=255) gATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCg > 1:693454/1‑289 (MQ=255) aTGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATccc > 1:607678/1‑289 (MQ=255) aTGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATccc > 1:1325068/1‑289 (MQ=255) aTGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATccc > 2:620927/1‑289 (MQ=255) tATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATg < 1:202201/255‑1 (MQ=255) aTCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAAcgcg < 2:193137/269‑1 (MQ=255) tCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc > 2:609688/1‑248 (MQ=255) tCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCtt > 1:617089/1‑289 (MQ=255) tCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCtt > 1:1493343/1‑289 (MQ=255) tGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTa > 1:992632/1‑288 (MQ=255) gcgcGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTAt > 2:793301/1‑288 (MQ=255) cgcgATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGc > 2:314799/1‑218 (MQ=255) cgcgATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAGTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGAGGCGATCCGGACGCTTAtgg > 1:100787/1‑287 (MQ=255) cgcgATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGGAGGGATCCCGACCCTTATCg > 2:1709881/1‑289 (MQ=255) gATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 2:1967321/288‑1 (MQ=255) gATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 1:1170642/288‑1 (MQ=255) gATGAATTACCGGCGCGGGTTCAGTCGCAAGTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCAAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 2:874810/288‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAAcgcg > 2:1370151/1‑249 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt > 2:521711/1‑276 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 1:521711/276‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATg > 2:1714745/1‑289 (MQ=255) ttcagtcgcAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTAGGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAACAGGGCGATAATGACCAGtt > 2:1770633/9‑289 (MQ=255) aaTTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTg > 1:1286690/1‑285 (MQ=255) aaTTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTg < 2:1286690/285‑1 (MQ=255) aaTTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCg < 1:768654/288‑1 (MQ=255) aaTTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCAATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGGCCCGCGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCGGGAAGGGGACAGTTGCGCACGTATGTATGCCCGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTAACGATAAGGGCGCTAACTCGCAGTTTCTGGCCg > 2:1802870/1‑288 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTagcag < 2:668983/151‑1 (MQ=255) gCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAAc > 2:953099/1‑288 (MQ=255) gACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTg < 1:1279648/289‑1 (MQ=255) cTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 1:646017/241‑1 (MQ=255) gcgcCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGAGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAggg < 1:1427129/244‑1 (MQ=255) gCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCa > 1:892719/1‑120 (MQ=255) gCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCa < 2:892719/120‑1 (MQ=255) cactcaaTGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 2:821316/219‑1 (MQ=255) ggtggtCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGc > 1:228781/1‑179 (MQ=255) gtCACGGTGCGCTGATTATTGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGCCCTTTGCACCATTTGTGAATCCTTGCAGCGTCCCGTTGGGAATCGAAGCGTTTAGCAGCTATTTTCGTGTGGACAAAACTGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGCTGTAGGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGGCGCTTATCGATCAGCGCGATACTGGTTAGCTTCTTGCCGACGAGTTCCCACCTGCGGTATTGGCAGAAGCCGCGCGCCatcacgcgtc > 2:447636/1‑280 (MQ=255) gtCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTg > 1:271012/1‑289 (MQ=255) gtCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGACCAGGGCGATACTGATCAGTTTCTTGCCGACCCGTTGCAACCTGCGGTACTTGCAGAAGCCGCGCGCCACACAGCgcg > 2:1073007/1‑287 (MQ=255) gtCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGGTGCGCACTGATGTAGGCCAGTAACGCGCAGGATGCGAACCCGACCGTTAACGATACGGGCGCAAATGAACAGTTTATTGCCGACCAGTTGCATCCTGCGGTATTGGACGAAACAGCGCTCATGAAAGCATg > 2:1892072/1‑289 (MQ=255) cACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 1:537453/152‑1 (MQ=255) cACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa > 2:537453/1‑152 (MQ=255) gTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTTCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGTAGAAGCCGCGCGCCATAAAGCGTGGCCGAt > 1:1678778/1‑289 (MQ=255) tGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa > 2:406172/1‑147 (MQ=255) gcgcTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATg > 1:590259/1‑288 (MQ=255) cTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACg > 1:1124016/1‑288 (MQ=255) ttATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGGGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCg > 1:1922469/1‑289 (MQ=255) tGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGcc < 1:249145/289‑1 (MQ=255) tGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGcc > 2:978355/1‑289 (MQ=255) tGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGcc < 1:408321/289‑1 (MQ=255) tGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGcc > 2:249145/1‑289 (MQ=255) tGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCGGCGTATTCAGcc > 2:374370/1‑289 (MQ=255) tGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGAGGACGCTGCGTATTCAGcc > 1:1253616/1‑289 (MQ=255) aaaaaTCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCgg < 2:1853070/289‑1 (MQ=255) aaaaTCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCggg < 2:590259/289‑1 (MQ=255) aaaTCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCGGGa < 1:1641820/289‑1 (MQ=255) gggTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCGGGATATGAt < 1:295759/289‑1 (MQ=255) gTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCGGGATATGATc > 1:737949/1‑288 (MQ=255) ||| TTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGAGCCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACAGTATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGC‑TGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTAGCGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGATCAGTTTCTTGCCGACCAGTTGCAACCTGCGGTACTGGCAGAAGCCGCGCGCCAGAAAGCGTGGCCGATGACGCTGCGTATTCAGCCGGGATATGATCACAGTTAC > CP042583/1819073‑1819626 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |