| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,839,496 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,839,496 | 0 | A | T | 97.7% | 298.6 / NA | 134 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (66/64); minor base C (3/0); total (70/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,839,497 | 0 | G | C | 99.2% | 299.7 / NA | 134 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (70/63); total (70/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,839,498 | 0 | C | G | 99.2% | 303.0 / NA | 134 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (70/62); total (70/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTAGTCTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGAGCATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCAGCAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATAGTCCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTGGGCG > CP042583/1839216‑1839775 ||| cGGACGTGAGGCGGTGATGTTAAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTCCGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGc < 1:1050295/289‑1 (MQ=255) aGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTAca > 2:1352171/1‑288 (MQ=255) gTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCCCGAACAGCCTGTAcatccgca > 2:1597750/1‑285 (MQ=255) tGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGcc < 1:1637266/276‑1 (MQ=255) tGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGc > 2:1655837/1‑275 (MQ=255) tGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGc < 1:1655837/275‑1 (MQ=255) cttctctTTTTTCCGCGGTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGTTGT‑TGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCg < 2:353228/286‑1 (MQ=255) ccgCTCTGTTTGACCCGCTCTGGTTTCACTGGCCCGGGACTTTGCCCCCCCGCTGGCTTATGCCGTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGCAATGGATCTGGGGGCAGAGGTAGCGTTAATGGTGTGCGTTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGAGGCGAAGAGAGCTGCCGCTGGCGACCGGCACGATGGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTGGTCATTTGTACAGTGATGT‑GGGCCTGCAACAGGCTGTACATCATCAACATG‑GCg < 2:222393/287‑1 (MQ=255) cAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCg < 1:774416/289‑1 (MQ=255) aGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑cc > 2:141053/1‑287 (MQ=255) ctctTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCACACCGCTGGCTTATGCCGTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGGTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGACGCGCCGTAACCGTCCCGATACGCTGCTGCCGCTTGTCGTTTGTACATTAATTT‑TGGGCACGACCAGCCTGTAcaccaacctgcatcttag > 2:1637266/1‑275 (MQ=255) tttcACGCTCACAGGTTTCACTGTCATGGGTCATTGGCCCACCGATGGCTTATGCCTTGGCGATGGTTTTCAGCTGTACGGTAATGTATCTGAGCGCGGCGGTGGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGGGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGAGCCGCGCCGTAACCGTCGCCATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCtatttat < 2:313057/289‑1 (MQ=255) gcTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGCCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTAATTTGTACATTGCTGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTTCATCATCAA‑ATGTCCTCTATTTATTATTAAc > 2:1788139/1‑288 (MQ=255) cTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCCCGAACAGCCTGTACAACATCCACATT‑CCGCTATTTATTATGAACCAACTTCATCtt > 2:1954042/1‑288 (MQ=255) gTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCCTCTTCCCGAGaa > 2:209979/1‑287 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTATCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCTTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:534850/289‑1 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGGGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:295336/289‑1 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:563027/289‑1 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:1352171/289‑1 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATGGTGTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 2:1507966/289‑1 (MQ=255) ttGGCCAACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:1240640/289‑1 (MQ=255) tgggCCGACGGCTGGTTATTGCCTTTGCGGTGGGTTCTAGCGTTTCGGTAAATTATCTGGGGGCGGCGGTTGCGGTTATTGTTTGCGGTCTGATCGTGTGGCTGTTTTTCCCGTCGGTGCGAAACGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGGTCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 2:15500/287‑1 (MQ=255) ccACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGgtg < 1:1106600/289‑1 (MQ=255) caaCCGCTGGCTTTGGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTTCGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGgtg < 2:1918605/287‑1 (MQ=255) cACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACAGGCCgggtt > 2:1414516/1‑286 (MQ=255) aCCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGc < 2:1974473/220‑1 (MQ=255) aCCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGc > 1:1974473/1‑220 (MQ=255) aCCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGtgtg > 1:268596/1‑289 (MQ=255) ccGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGtga > 1:1445320/1‑289 (MQ=255) gCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATgg > 1:1253256/1‑289 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc > 2:118023/1‑265 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:118023/265‑1 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAccgccg > 1:654863/1‑288 (MQ=255) gggTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTg < 1:1597750/289‑1 (MQ=255) tttCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGa < 1:1954042/288‑1 (MQ=255) ttACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCcgac > 1:1663077/1‑289 (MQ=255) tACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACCGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCcgacg > 2:1770879/1‑289 (MQ=255) tACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGGCGGGCTTGAAATCCcgacg > 1:911366/1‑289 (MQ=255) aTGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACa > 1:83517/1‑193 (MQ=255) aTGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACa < 2:83517/193‑1 (MQ=255) aTGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGa < 2:72415/289‑1 (MQ=255) tCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCa > 1:1874588/1‑216 (MQ=255) gAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGCTGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGa > 1:1658270/1‑289 (MQ=255) gAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGa > 2:1547480/1‑289 (MQ=255) gAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGGGATGACGGGGACCGCCGCCGGGCTCGAAATCCCGACGATTTTGATTGCCggt > 2:906105/1‑288 (MQ=255) cgcAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACCTG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATTGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGGAGATGTTGATTGCCGGatat > 2:1139326/1‑289 (MQ=255) cgcAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGCGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGGTGGGAATCCCGCCGATGTTGATTGCTGGatct > 1:1732069/1‑287 (MQ=255) cAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc > 1:1071185/1‑226 (MQ=255) aGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCaa < 1:1547480/288‑1 (MQ=255) tATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTTATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCAGCTTCCCGAGAAACTGGCCGGCGTGATTATGGGGACCGCCGCCGTGCCTGAAATCCCGACGGTGTTTATTGCCGGATATTTCCCCAACAGTCTg > 2:1044800/1‑289 (MQ=255) tATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAACTCCCGACGATGTTGATTGCCGGCTATTTCGCCAAACGTcgg > 2:872604/1‑287 (MQ=255) tATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAAAGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGAGGATGGGGACAGCTGCCGGGCTGGAAATCCCGCCGAGGGTGATTGCCGGATATTTCGCCacagttctg > 1:1367882/1‑281 (MQ=255) tGCGGGGGGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGGGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGc < 2:1207817/289‑1 (MQ=255) tgtgATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAACTCCCGACGATGTGGATTGCTGGATCTTTTGCCAAACGTCTGGGTAAGCGtt > 2:1002341/1‑287 (MQ=255) tgtgATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGtt > 1:1207817/1‑287 (MQ=255) aTGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATACCGACGATGTTGATTGCCGGATATGTCGCCAAACGTCGGGGTAAGCGGTTCTTaa > 2:245422/1‑289 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTGGGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACa > 1:482410/1‑146 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTGGGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACa < 2:482410/146‑1 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCtatttat < 2:201243/158‑1 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCtatttat > 1:201243/1‑158 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 1:529839/191‑1 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc > 2:529839/1‑191 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcg > 1:1632952/1‑289 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcg > 1:560804/1‑289 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCCTCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGGTATTTCGCCAAAAGCGTGGGTCATCGTTTTTTAATGCGCGtt > 2:677599/1‑289 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCTGGCTGGAAATCCCGACGCTGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATgccggtg > 2:1580091/1‑284 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcggt > 1:731811/1‑287 (MQ=255) ggTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTtg < 2:560804/287‑1 (MQ=255) tttACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCcg > 1:979852/1‑223 (MQ=255) ttcccgtcgaTGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCg < 1:689395/280‑1 (MQ=255) aaacgggCTTCCGCTGCCGACCGGCACGATAGAGGCGCCGCGCCGTAACCGTCGTGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTTATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGt < 2:1253256/283‑1 (MQ=255) aatggCTTCCGCTGGCGACCGGCCCGATCGAAGCGCCGCGGCGTAACCGTCGCGTTACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTGCATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGttt < 2:1632952/285‑1 (MQ=255) agCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATCTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGTACAGACTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGCGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAATTCCTGACGATGTTGCTTGCCGGATATTTCGCCAAACGCCTGGGTAAGCGTTGATTAATGTGCGGTGCTGCCTGTGGTGGCTTGTGTTTTTa > 2:1086180/1‑289 (MQ=255) cTTCCGCTTGCGCCCGGCCCGCTCGAAGCCCCGCGCCGTAACCGTCTCGATACGCTGCTGCTGTTTTTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGTGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACg < 1:365354/289‑1 (MQ=255) ttcacgtGGCGACCGGCACGATCGCAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGATCTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACg < 1:195765/282‑1 (MQ=255) tGGCGTCCGGACCGATCGAGGGCCCGCGGCGTAACCGGCGGGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGaa < 2:764048/288‑1 (MQ=255) cACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGgc > 2:72569/1‑288 (MQ=255) cGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCa < 1:755601/289‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCAttc < 1:587385/289‑3 (MQ=255) cgcgccgTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCa < 1:1414516/288‑1 (MQ=255) ggcccgTAACCGTCGCGATTCGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGTCCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCAtt < 2:342720/286‑1 (MQ=255) gTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGtt < 1:1580091/289‑1 (MQ=255) tCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTTTTGGGCtt > 2:1058785/1‑288 (MQ=255) cgcgATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATCTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTg < 1:1562635/288‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAgctgct < 1:1058785/289‑1 (MQ=255) tgctgctgTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTaaa > 1:1405753/1‑289 (MQ=255) ctgctgTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATg > 2:869627/1‑289 (MQ=255) ctgTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAg > 2:572191/1‑276 (MQ=255) tttGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGt < 2:1835446/177‑1 (MQ=255) tttGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGt > 1:1835446/1‑177 (MQ=255) tGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTggg < 2:1663077/289‑1 (MQ=255) tGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTggg < 2:654863/289‑1 (MQ=255) tGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTggg < 1:808197/289‑1 (MQ=255) tGATGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAAGGCTATTTTTATTGGCATTCTggg < 2:268596/289‑1 (MQ=255) tGAGGT‑GGGGCTCTAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTGCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTggg < 1:1162290/289‑1 (MQ=255) aTGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTc < 1:965795/198‑1 (MQ=255) aTGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTGggcg > 2:455454/1‑289 (MQ=255) aTGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTGggcg > 1:1440158/1‑289 (MQ=255) aTGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGGTGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATTCACCTCTCCTTTTGTTGGGCTTGCCGCTGCTAAATGCTATTTTTTTTggacttcgtggcc > 2:1215588/1‑278 (MQ=255) aTGT‑GGGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGGTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTc > 2:965795/1‑198 (MQ=255) ||| CGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTAGTCTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGAGCATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGT‑GGGGCAGCAACAGCCTGTACATCATCAACATG‑CCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCCGTGGGTGGCGTCTGTTTTTACGCAGGAATGCTGATGGCGCATAGTCCTGTCATTCTGTTGGGCTTGCAGCTGCTAAATGCTATTTTTATTGGCATTCTGGGCG > CP042583/1839216‑1839775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |