Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,849,869 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 1,849,869 | 0 | A | T | 99.5% | 416.2 / NA | 181 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,849,870 | 0 | G | C | 100.0% | 417.6 / NA | 181 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (67/114); total (67/114) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,849,871 | 0 | T | A | 99.5% | 418.7 / NA | 181 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (66/114); total (67/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CGCAAAGCTGTTTATAATGGGAGCCGCTTTGACGTCTGGAGTAGCGCATTTATCATCATCGGCTACGCCATTCCGGCCTTTTTGTTTGCCATCCTGCTGATTGTCTTCTTCGCGGGCGGCAGCTATTTCGACCTGTTCCCTCTACGCGGCCTGGTTTCCGCTAACTTTGATAGCCTGCCGTGGTATCAGAAAATCACCGATTATCTGTGGCATATCACGCTGCCGGTGCTGGCGACAGTGATTGGTGGCTTTGCGGCGCTGACCATGCTGACAAAAAACAGTTTCCTTGATGAAGTGCGCAAGCAATAC‑GTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCAGCCTGCTGATTGAGGTGATGTTTAGTCTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCAGCCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTG > CP042583/1849590‑1850147 ||| aaGCTGTTTATAATGGGAGCCGCTTTGACGTCTGGAGTAGCGCATTTATCATCATCGGCTACGCCATTCCGGCCTTTTTGTTTGCCATCCTGCTGATTGTCTTCTTCGCGGGCGGCAGCTATTTCGACCTGTTCCCTCTACGCGGCCTGGTTTCCGCTAACTTTGATTCGCTGCCGTGGTATCAGAAAATCACCGATTATCTGTGGCATATCACGCTGCCGGTGCTGGCGACAGTGATTGGTGGCTTTGCGGCGCTGACCATGCTGACAAAAAACTCATTCCTtgatga < 2:900395/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |