| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 613,159 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 613,159 | 0 | A | T | 99.6% | 615.5 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (123/134); minor base C (1/0); total (125/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 613,160 | 0 | C | G | 99.2% | 602.3 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (123/133); minor base T (2/0); total (125/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 613,161 | 0 | T | A | 99.6% | 608.6 / ‑5.1 | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (125/132); minor base G (0/1); total (125/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
CGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCACTACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAGCTCATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGGCTAATGCTCAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAAACTCGTGCTAATGCTGATATCTCTCCAGTCAC > CP042583/612879‑613436 ||| cGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAg < 1:373121/289‑1 (MQ=255) gTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAgg > 1:1941738/1‑289 (MQ=255) tCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGt > 1:1004427/1‑289 (MQ=255) tcatGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGCTAGTTAcc > 1:45511/1‑289 (MQ=255) tcatGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTAcc > 1:1877680/1‑289 (MQ=255) catGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAGATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTAcc > 1:941890/1‑288 (MQ=255) catGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTAcc > 1:1585434/1‑288 (MQ=255) tCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCa > 1:1990194/1‑288 (MQ=255) cACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGt > 1:675666/1‑278 (MQ=255) cACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGt < 2:675666/278‑1 (MQ=255) aGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTc < 1:1720932/288‑1 (MQ=255) tGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGa < 1:381823/288‑1 (MQ=255) ggTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCa > 1:341764/1‑278 (MQ=255) ggTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGAc < 2:258969/288‑1 (MQ=255) gTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGa > 1:1196647/1‑289 (MQ=255) gTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGGCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACCCAGGTTCTGATAGGTACCTGCTC‑CCTGGGCCCCATTGTCCGGACGa > 2:281992/1‑289 (MQ=255) aaCTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGAt < 1:1292127/288‑1 (MQ=255) ccaccGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGa < 2:1884792/289‑1 (MQ=255) gCAATGCCAAAATGGTTGGTGTATGCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGc < 2:84151/289‑1 (MQ=255) gCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGc < 1:32621/289‑1 (MQ=255) cAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCTGGACGATCGGATTGCTGTCCGGCCGACATGc > 2:1546438/1‑288 (MQ=255) atggcgaaaaGGGTGGTGTAGCGGAGATGGCACTGAACCGGAATATCTGCCAGGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCGAGCTGCTGCTGAAGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATAACCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGcccc < 2:1658843/283‑1 (MQ=255) ccAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGAGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAACGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGCTCTGTAATCACTGGAGGAATAGGTATCCGTAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTGACC‑GCTCACCTCGGCTCCATTGTCCGAACGATCGGATTGCAGCCCGGCACCCATGccccgg > 2:1601554/1‑286 (MQ=255) gttgggGTAGGCGAGCTTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCACCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGGTGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGGTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCGGCTATTACg < 2:390907/288‑1 (MQ=255) tggtGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTc > 1:167500/1‑289 (MQ=255) gtAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATc < 2:1990194/288‑1 (MQ=255) aGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCa < 2:1941738/288‑1 (MQ=255) gagaTTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGTTGCTGACCAGCAGGCGTGGTTCATTGGTGGATCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTa < 1:874081/289‑1 (MQ=255) aTTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGCCGATCGGATTGCAGTCCGGCCGCCATGCACCAGCTGTTACGTTCATCCCGCGtcacg > 2:104338/1‑285 (MQ=255) aTTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGGCCGGACGATCGGATTGGAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTTTTACGGTCATCCAGAGTATCg > 2:949518/1‑289 (MQ=255) aTTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCCATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACCCACCCGCTGAACTCAGTTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGCTCGGATTTCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTAATACGTTCATCCAGCGTAtgg > 2:51638/1‑287 (MQ=255) cccTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCCATTACGTTAATCCAGCGTCTCTTTc > 2:322330/1‑288 (MQ=255) ccTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTAt > 1:943940/1‑282 (MQ=255) ccTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTcc < 1:1546438/288‑1 (MQ=255) ccTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTcc < 2:1851013/288‑1 (MQ=255) aaCCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGACCGGATTGCAGTCCGGCCGACATTCCCCAGCTATTACTTTCATCCAACGTTTCCTTCCacgac > 2:1671408/1‑285 (MQ=255) cGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCacgacatg < 1:988088/289‑8 (MQ=255) cGGAAGATCTGCCAAGCCATCGGTGCTGACCATCCGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCacgacatg < 2:348673/289‑8 (MQ=255) aaTATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCa > 1:1525148/1‑266 (MQ=255) aaTATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCa < 2:1525148/266‑1 (MQ=255) aaTATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg < 1:1800431/288‑1 (MQ=255) aaTATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg < 1:828114/288‑1 (MQ=255) tCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTc > 2:747174/1‑229 (MQ=255) gCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg > 1:1869479/1‑281 (MQ=255) cGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCt < 2:941890/289‑1 (MQ=255) cTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCg < 2:1305013/193‑1 (MQ=255) aCCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACCTGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGtttt > 2:388738/1‑289 (MQ=255) aCCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTa < 1:548363/268‑1 (MQ=255) ccATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTg < 1:528090/289‑1 (MQ=255) cATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGc < 2:233879/289‑1 (MQ=255) cAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCgg < 2:910382/206‑1 (MQ=255) cAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGTTGTGGCTACTGtgtgtcatg > 2:528090/1‑281 (MQ=255) cAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATg > 2:287454/1‑289 (MQ=255) cAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCCCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCCGACATGCCCCAGCTCTTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCCCGACCTGCGTTGTATGGTGCTGTGGTGACTGtttgtcc > 2:1232773/1‑283 (MQ=255) gTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTTGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATAACCCACTCACCCGCTGAACTCAGTTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCCGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCGATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCCGTGTATGGTGCTGTTGCTACTGTTTTGCATCTCATa > 2:1291759/1‑289 (MQ=255) gTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTa < 1:281928/258‑1 (MQ=255) tGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGGAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg < 1:1657112/252‑1 (MQ=255) ggTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAg < 2:880650/288‑1 (MQ=255) ttCATTGGTGGGGCTGCGTAGATGAAATGCTGAACCCAATTGGGTTGCGGTGGAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATGCCTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATCGTTACC‑GCTCCCCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGcc < 2:1762705/288‑1 (MQ=255) tCATTGGTGGAGCTGCGGCTATGAAATTCTGCACCATATTGGGTGGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCaa < 2:126392/289‑1 (MQ=255) ttGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTAACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCCATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTACACGCCATACGGTGTAGGGTGCTGTTGCGACTGTTTTGCATGTACTAGCTAAccc > 2:635357/1‑289 (MQ=255) tggAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGac < 1:62253/288‑1 (MQ=255) gAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGcc < 1:1162528/278‑1 (MQ=255) gAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGcc > 2:1162528/1‑278 (MQ=255) gAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGacca > 2:1715032/1‑288 (MQ=255) cTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGt > 1:1312420/1‑289 (MQ=255) tgaggcgATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGt < 1:1950863/285‑1 (MQ=255) cgATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCg < 2:113831/288‑1 (MQ=255) aTGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAg > 1:1406483/1‑289 (MQ=255) tatTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTcc > 2:1497148/1‑202 (MQ=255) tatTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTcc < 1:1497148/202‑1 (MQ=255) tatTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAgcgaaatcgaca > 1:1071539/1‑278 (MQ=255) tatTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAgcgaaatcgaca < 1:1232809/289‑12 (MQ=255) tatTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGAGCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCACAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACCTGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACACGATCACCGTTACCGAAGGGGAgcgacatccaca > 1:1134198/1‑278 (MQ=255) ttGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGGGTATGGTGCTGTGGCTATCGGTTTTCATGTCATAGCCAACCCGGCCACCGTTAACGAAGGGGaccgaaatcggtaga > 2:335326/1‑275 (MQ=255) ttGGGGTGCGATCAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCAGACGGAACTGTCATCACTGGCAGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAgcgaaatcgacaga < 2:45511/289‑14 (MQ=255) tGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCt > 2:1391304/1‑221 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGt > 2:1612925/1‑102 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGt < 1:1612925/102‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTa < 1:897999/221‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTg > 1:722658/1‑289 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTg > 1:271236/1‑289 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGAAAGATAAATCTg > 1:1420841/1‑289 (MQ=255) cGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACCGTTTGGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTg > 1:1984450/1‑289 (MQ=255) aaaGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATg < 1:518606/204‑1 (MQ=255) atCCAGCTGCTGCTGACGAAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGCAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt < 2:1406483/288‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt < 1:1906667/288‑1 (MQ=255) tgACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGt < 1:1748425/288‑1 (MQ=255) ggtcGGAACGTTAATCACTGGCGGCATAGGTCACAAGAAGATCCCACTCACCCGCTGCAAGCATGTGCTTAGATGTAAC‑GCTCACCTGGCCTCCATTGTCCGGACGATCGAATTGCAGTCCTGGAGACATGCCCCAGCGATTACATTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGt < 2:1083359/285‑1 (MQ=255) cGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTggg < 1:1665932/288‑1 (MQ=255) cGGAACGGTAATCAATGGCGGCATAGGTACCAGAAAGTTCCCAAGCACCCGCTGAACTCGGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCGATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTggg < 2:560013/288‑1 (MQ=255) aaaCTGTAATAACTGGCGGCAGAGGTACCAGAAAGATCCCACGCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATGGGCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGGGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTc < 1:306229/287‑1 (MQ=255) aCTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTa > 1:240612/1‑289 (MQ=255) aCTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg > 1:1492524/1‑159 (MQ=255) aCTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGaatgac > 1:1683493/1‑285 (MQ=255) tGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCtt < 2:145156/258‑1 (MQ=255) tAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg < 2:584653/149‑1 (MQ=255) atCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATCGAGATATCTCTCCAg > 1:151970/1‑289 (MQ=255) tCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATCGAGATATCTCTCCAGt < 1:1045077/289‑1 (MQ=255) caaCTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCCTCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTGTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGCGAAATCGACAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAATGACGTCGAAATCGAGATATCTCTCCAGTc > 1:1386005/3‑288 (MQ=255) ||| CGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCACTACTCAGGTGCTGATAGTTACC‑GCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAGCTCATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGGCTAATGCTCAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAAACTCGTGCTAATGCTGATATCTCTCCAGTCAC > CP042583/612879‑613436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |