Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 614,371 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 614,372 | 0 | C | G | 99.6% | 599.5 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (131/127); minor base T (0/1); total (131/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 614,373 | 0 | T | A | 99.2% | 601.7 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (129/126); minor base G (1/1); total (131/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TCATCAATAATAAACGGGCCTGGCGGGACTTTTTTCTGGTAAATGACGCGGCCACTTTGACTGATCGTCACCGTGGCATTGGTCTGTGCAATACCGCTAATTTGTGGGGCGTAGCCACGCAGCTCCCACGGTAACATTCGATCGTCACTCGCCAGTGCCGCGCCGGTATAAGAAAAACCATCGAAAATATTGGAACTGAAATCGGTTTCGCCGAGGGTTAACTTAGAGCCTAATTGCGGTAATGGACGAAAAAGATAGGTGCGGCTTATTCCGCCACTCTGGTCATGGTTATCTTCGCTATCGGTCTTATTAAGCTGGTAATCACTGCGTAAGCGCCATGCCCCGGCGTTAATTCCGGCGGTACCGTAGGCATTCAGGTTAGTGCTGCTGCTGCCGTCCTGTGGGCGGTAGCTGCTGGCAAACAAGTTGTAATCCATCAGGACACCGGCAACACCTTCTTTCCATGTAGAGGGGGGAGCCCAGTTTTCACTGTGCCACGCCAGCCAGGCTTGCGGAATACTAATATTCAGTTGCTGATTGGCTTGATCGA > CP042583/614096‑614645 ||| tcaaccataataAACGGGCCTGGCGGGAATTTTTTCGGGTAAATGACGCGGCCTGATTGACTGATCGTCACCGTGGCATTGGTCTGTGCAATACCGCTAATTTGTGGGGCGTAGCCGCGCAGCTCCCACGGTAACATTCGATCGTCACTCGCCAGTGCCGCGCCGGTATAAGAAAAACCATCGAAAATATTGGAACTGAAATCGGTTTCGCCGAGGGTTAACTTAGAGCCTAATTGCGGTAATGGACGAAAAAGATAGGTGCGCGATATTCCGCCTGACTGGTCATgg < 2:230853/282‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |