| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 632,414 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 632,414 | 0 | A | T | 100.0% | 718.9 / NA | 302 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (141/161); total (141/161) | |||||||||||
| * | CP042583 | 632,415 | 0 | G | C | 99.7% | 704.3 / NA | 302 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (140/161); minor base A (1/0); total (141/161) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 632,416 | 0 | T | A | 100.0% | 717.2 / NA | 302 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (141/161); total (141/161) | |||||||||||
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
TACGGTAATTACGATCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATAGTCCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGAGTGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAACACCGAC > CP042583/632141‑632695 ||| ttATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAagag > 1:1138269/1‑272 (MQ=255) tATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGACAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCTGC‑AAAAGAAGAGTTGGTAAGTACCGGAGCg > 2:1455042/1‑289 (MQ=255) gTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAaagaa > 2:644478/1‑262 (MQ=255) gTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCTAAcgcg > 1:1312623/1‑289 (MQ=255) tttGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa > 2:528833/1‑289 (MQ=255) tttGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa > 1:722981/1‑289 (MQ=255) tttGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa > 1:12114/1‑289 (MQ=255) ttGATATACAGATCAACCAGTTTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAAcgcg < 2:1863801/287‑1 (MQ=255) ttGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGaa > 2:247469/1‑289 (MQ=255) ttGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGaa > 1:1435214/1‑289 (MQ=255) ttGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAAGTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa < 1:1683503/288‑1 (MQ=255) tGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGTCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGaaa < 1:1547848/289‑1 (MQ=255) tGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa < 1:1890785/287‑1 (MQ=255) tataCAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGGAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCg < 1:59358/289‑1 (MQ=255) aTCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTTCGCTATGACGGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAACGAAGCGTGGGTACTTAACGCAGCGAACTCGAAACCTCCATGca > 2:1651852/1‑288 (MQ=255) aTCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACTCAC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTAACTCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCg > 2:1997980/1‑289 (MQ=255) aTCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTaa > 2:921069/1‑259 (MQ=255) aTCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTaa < 1:921069/259‑1 (MQ=255) aTCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTAACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGAAGGGAACGCGAAATCGCCAtcc > 2:1890785/1‑286 (MQ=255) aaCCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGata > 1:1957757/1‑289 (MQ=255) gATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCg < 2:1060515/274‑1 (MQ=255) gATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCg > 1:1060515/1‑274 (MQ=255) aTTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCTCAATGGGAAattatta > 2:688963/1‑288 (MQ=255) ttGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCa > 1:1416596/1‑289 (MQ=255) ttGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCa < 2:1778088/289‑1 (MQ=255) ttGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACAGCAGCGAACGCGAAACAGCAAGGCGATATTATTCa > 2:59054/1‑289 (MQ=255) gTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATg < 1:528833/289‑1 (MQ=255) tCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTCGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGCGGGTAATTACCGCAGCGAACGCCAAACCGCAACGCCATATACTTCATGa > 2:1088565/1‑289 (MQ=255) tCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGa > 1:1724380/1‑289 (MQ=255) tCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGa > 1:494603/1‑289 (MQ=255) tagaggCTATCGCACGATGTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGTAAACTGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTgg < 2:1312623/285‑1 (MQ=255) tATCGGCTATAGCACCCTGTAGATCGAAGCGAATCAGCCTGGCCACGTAATGGCGGCAAAAAGGGACGCTGAAGGGATACTGGTAAATACGTTCTGGCAAATTGCGCTCAATTAGGATGGTTCGCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCTGTGTGCGCTAGGACCGAGTTGTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCTATGCGATATTATTCATGAAGCCTgg < 2:1625571/289‑1 (MQ=255) gCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCATGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCACAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAACGCCAAATTATTCATGAAGCCTGGCaat > 2:1826896/1‑286 (MQ=255) cTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCagag < 2:494603/288‑1 (MQ=255) cTATAGCAGTCTTTTTATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGAGGCAAAAAGGGACGCTGAAGTGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCagag < 2:867933/288‑1 (MQ=255) aTCGAACGCTTTATATCGAAGCGAATCCGCCTGGCAAAGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTTTGGCAAATTGCGGTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAAATGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGA‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAg < 1:688963/289‑1 (MQ=255) tCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATg > 1:12725/1‑258 (MQ=255) tCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCa < 2:1489263/287‑1 (MQ=255) tCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCa > 1:1489263/1‑287 (MQ=255) cGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGt > 1:116997/1‑289 (MQ=255) tttATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTa < 2:1957757/288‑1 (MQ=255) tataTCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTTCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATcc > 2:980880/1‑289 (MQ=255) tataGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGc < 1:1848623/289‑1 (MQ=255) tatCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGc < 1:913707/289‑1 (MQ=255) aGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTa > 1:1457510/1‑285 (MQ=255) aGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGAc > 1:972991/1‑289 (MQ=255) aGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGAc > 1:441003/1‑289 (MQ=255) aGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTAGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGAc > 1:1100866/1‑289 (MQ=255) aaTCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATg > 1:216248/1‑289 (MQ=255) cAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAg < 1:989243/289‑1 (MQ=255) ccTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGACGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa > 2:798910/1‑278 (MQ=255) aCGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCaa < 2:1570137/289‑1 (MQ=255) gTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAAtt < 1:1625297/289‑1 (MQ=255) tAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAAttt > 1:1875634/1‑289 (MQ=255) tGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa < 1:864276/264‑1 (MQ=255) gCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTa > 2:1587991/1‑257 (MQ=255) gCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTa < 1:1587991/257‑1 (MQ=255) tACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTgg < 1:786683/289‑1 (MQ=255) aaaTGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGt < 2:1160205/288‑1 (MQ=255) tGGCAAATTGCGCTCATGGAGGGTGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGgtgt < 2:1666726/289‑1 (MQ=255) tCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCActc < 2:717135/288‑1 (MQ=255) tCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGGAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACAGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGAAGGTGACGAATACGACTATTCACCCGG‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCActc < 2:836164/288‑1 (MQ=255) gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATg < 1:1598898/162‑1 (MQ=255) gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa > 1:28240/1‑196 (MQ=255) gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa < 2:28240/196‑1 (MQ=255) gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTgt > 2:122825/1‑218 (MQ=255) gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAca > 2:567936/1‑288 (MQ=255) ttCTCTGCGACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcag < 2:1107922/288‑1 (MQ=255) ctctGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagcag < 1:979402/289‑1 (MQ=255) tGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGc > 2:160313/1‑185 (MQ=255) tGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTgtt < 2:1901436/259‑1 (MQ=255) aaCTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTa < 2:975644/288‑1 (MQ=255) cgtgTAGATAAATGCAGCGGGGTGCGCAACAACCGGGTGTTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGGGGGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGATCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTg < 2:1013141/286‑1 (MQ=255) ggTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGAt < 2:117889/289‑1 (MQ=255) gTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt > 2:454001/1‑257 (MQ=255) gTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagcag > 2:29128/1‑278 (MQ=255) aGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGAtgtg < 2:1416596/289‑1 (MQ=255) aGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGAtgt < 2:1697407/288‑1 (MQ=255) gCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCt > 2:461042/1‑289 (MQ=255) cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCAc > 1:1778137/1‑216 (MQ=255) tgCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagc > 2:372545/1‑257 (MQ=255) tgCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagc < 1:372545/257‑1 (MQ=255) gcgcTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAAc < 2:1466024/289‑1 (MQ=255) gcTATGACCGGTTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAACGAAGGGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATGCATGAAGCCTGGCAGATCAGGGCTGTTAACCGCTATTAGCTGGCAGTGCCGCTCACTTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGCAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACCCTAAGTCATAACACCAGGGGTAATGCTCTGGATATCCACCtttcatacc > 2:906680/1‑281 (MQ=255) gcTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGt > 2:723486/1‑217 (MQ=255) gggTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGa > 1:949300/1‑289 (MQ=255) ggTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGa > 2:321976/1‑288 (MQ=255) gTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGA‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGTTGACGat < 1:1826896/288‑1 (MQ=255) tATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGatca > 2:1026099/1‑289 (MQ=255) cAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCg > 1:104078/1‑287 (MQ=255) tGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTa < 2:955435/128‑1 (MQ=255) aaGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTg < 1:461042/289‑1 (MQ=255) tctGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGt < 2:137157/287‑1 (MQ=255) gatgatGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTa < 1:321976/289‑1 (MQ=255) gatgatGGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTa < 1:1907590/289‑1 (MQ=255) tgatgGTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTaca < 1:1663713/289‑1 (MQ=255) ggTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTa > 1:645895/1‑116 (MQ=255) ggTGATGAATATGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCtt > 1:258420/1‑289 (MQ=255) tatGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCa < 1:1020357/226‑1 (MQ=255) atGACTATTCACCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAACACCGa < 1:800731/289‑1 (MQ=255) ||| TACGGTAATTACGATCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATAGTCCCGC‑AAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGAGTGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAACACCGAC > CP042583/632141‑632695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |