Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 662,945 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 662,945 | 0 | A | T | 100.0% | 604.9 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (122/133); total (122/133) | |||||||||||
* | CP042583 | 662,946 | 0 | C | G | 100.0% | 602.7 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (122/133); total (122/133) | |||||||||||
* | CP042583 | 662,947 | 0 | T | A | 99.6% | 595.8 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (121/131); total (122/133) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GCATTGCCAGGCCAGGAAGCGCGCTAATCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAAACTCGTGCTAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGAACTATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCACTTTCGTTACACAGCACGCTTTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCTTTTTCCTGCT > CP042583/662668‑663227 ||| cATTGCCAGGCCAGGAAGCGCCGAAATCCCCAGTCCCGCCT‑CACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACg < 1:79827/288‑1 (MQ=255) gccaggccagGAAGCGCCGAAATCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACgttgt > 2:60386/1‑289 (MQ=255) cgggccaggAGGCGCCGGAAGCCCCAGGCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGAGGACGCACTTCGTAAAGCCGGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTc < 2:1643289/287‑1 (MQ=255) gccaggAAGCGCCGAAATCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATg > 1:902145/1‑289 (MQ=255) ggAAGCGCCGAAATCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATTACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTTACCAGCGGTGTAAAACAAAAGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTa > 2:1575231/1‑289 (MQ=255) caacgccgaactCCCCAGTCCCGCCTCCCCCAGTCCTAACACCGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGttt < 1:1406068/275‑1 (MQ=255) gccgaaaTCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCaa > 1:706452/6‑289 (MQ=255) gccgaaaTCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCaa > 1:1700576/6‑289 (MQ=255) aTCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTctg < 1:1152608/289‑3 (MQ=255) cccAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTctg < 1:1613128/286‑3 (MQ=255) cAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTctgattcg < 1:747249/289‑8 (MQ=255) tCCCGCCTACCCCAGTCCTAGTGACGTAGAAGGATGACGCACTTCGTAAAACACGCACAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGCGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTa < 2:1858660/289‑1 (MQ=255) ccGCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTaca < 1:1239912/289‑1 (MQ=255) caccTCCACCCGACCTAATACCGTCGAAAGATGCCGCACTTCGTAAACCCAGTCCAGCTCCCAGGGCGTGTCGGCCCGCTGTTGTTCTCTCACCCGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTacac < 2:1355356/287‑1 (MQ=255) gCCTCCACCAGTCCTAATGACGTCGAAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTAcaca > 2:911497/1‑289 (MQ=255) aatgacgtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGc > 1:946369/12‑289 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGa < 2:39752/224‑1 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCAccgatt > 2:755075/6‑272 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAattat > 2:1268901/6‑289 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAattat > 2:470588/6‑289 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAattat > 1:408470/6‑289 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAattat > 2:1485053/6‑289 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGAAattat > 1:558056/6‑289 (MQ=255) gtcgaaaGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGGGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCCCCGATTCCATGCAattat > 2:828887/6‑289 (MQ=255) tGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGcc < 1:498417/287‑1 (MQ=255) gACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGCCGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGGCTGATTTGTTACACATCACCGATCCCATGCAATTATTCGTGCtttt > 1:349419/1‑288 (MQ=255) tCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGaa > 1:1528791/1‑289 (MQ=255) agccAGTCCGGCGTCCAGGGCTTGTCGGCCCGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGCTGGCGCTGGAGGGGCGTACGCCAATCATTTTTTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGGTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCa < 2:1082109/287‑1 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCTTGCCTTTTTCCAGAATCCGCCCTTTa > 2:1191910/1‑289 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTTCCTTGTTCCAGAATCCGTACTTTa > 2:270959/1‑289 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCg < 1:1218129/282‑1 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTa > 2:331355/1‑289 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTa > 2:1883789/1‑289 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTa > 1:1333742/1‑289 (MQ=255) gTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGGTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGGTACACAGCACCGAATCCATGCAATTATTAGGACCTTGTTCGAGAATCAGCaactgt > 2:450089/1‑284 (MQ=255) tCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa > 1:1498571/1‑289 (MQ=255) tCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTCCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGc > 1:590490/1‑253 (MQ=255) ccAGCTTCCGGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa < 2:770939/288‑1 (MQ=255) ccAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa < 1:100153/288‑1 (MQ=255) ccAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa < 1:1268901/288‑1 (MQ=255) cAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAata < 2:152242/289‑1 (MQ=255) cAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAata < 1:1485053/289‑1 (MQ=255) ttCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAatat < 1:1840015/286‑1 (MQ=255) aGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCg < 1:830068/271‑1 (MQ=255) gCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATa < 1:112918/286‑1 (MQ=255) gttggCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTTGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACCCCTGACATTATACAAGCTGCTTTTTGGACAATGGATGGTCACGCCGACAGGACAGCACGAACGGCTAGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTAATGTTTATGCCAAAGTCTGATCCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGACTTGTTCCAGAATTCGCACTTTAATATTGGGATACAGCtaa > 1:1638106/4‑287 (MQ=255) ccAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGTACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACgttgtt < 1:1796994/184‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGTACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACgttgtt > 2:1796994/1‑184 (MQ=255) aGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTa > 2:523574/1‑289 (MQ=255) tCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTaaa > 2:1236484/1‑289 (MQ=255) tCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTaaa > 1:165294/1‑289 (MQ=255) cGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTaaa < 2:408470/288‑1 (MQ=255) cGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTa < 1:1875164/286‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTctgattcg < 1:931619/184‑8 (MQ=255) gTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTctgattcg > 2:931619/1‑177 (MQ=255) gTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTaaaaaa > 1:671089/1‑289 (MQ=255) gTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTaaaaaa > 1:990491/1‑289 (MQ=255) gCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGt < 1:1175185/288‑1 (MQ=255) gCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTc > 2:1018925/1‑289 (MQ=255) cGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa > 1:36739/1‑226 (MQ=255) cGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa < 2:36739/226‑1 (MQ=255) cGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCg > 1:1751747/1‑289 (MQ=255) gTACGCCAATCAGTTTGTAACCCCCTAACTCCTGCCACTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATTCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCg < 2:1155574/288‑1 (MQ=255) tACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGCTGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACAAAGAACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCAGCACTTTAATATTTGGTTACAGCTCATTAATTTTAACAATTACCAGCCGTTAAAATTAAAATACGTCGGTCTGa > 2:505074/1‑289 (MQ=255) cGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAAt > 2:127135/1‑289 (MQ=255) aTCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACg < 2:1721932/289‑1 (MQ=255) tCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATacac > 1:6680/1‑287 (MQ=255) tttGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACATGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAAc < 2:803039/289‑1 (MQ=255) tttGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAAc < 1:1883789/289‑1 (MQ=255) tAACCCCCTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGGCAATTGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCa < 2:965443/289‑1 (MQ=255) tAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCa < 2:671089/289‑1 (MQ=255) aCCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTaa > 2:20363/1‑206 (MQ=255) cccACTAACTCCTGCCTGTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCa < 2:1389584/289‑1 (MQ=255) cccACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCa < 1:883908/289‑1 (MQ=255) aCTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTAATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATa > 2:1001192/1‑288 (MQ=255) tAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCa < 1:1552930/289‑1 (MQ=255) tAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCa < 1:271711/289‑1 (MQ=255) tCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACgat < 1:331355/289‑1 (MQ=255) tGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACgatgat < 2:6680/289‑1 (MQ=255) gCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACg < 1:1778119/283‑1 (MQ=255) gCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATa < 1:1018925/289‑1 (MQ=255) gCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATa > 2:561323/1‑289 (MQ=255) gCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTAACCATACCAagaagaaa > 2:1111258/1‑287 (MQ=255) gCCATTCTACAAGCGGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCCGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGACTTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATa < 2:878951/289‑1 (MQ=255) cTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATa < 2:182442/283‑1 (MQ=255) ctTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGa > 2:596796/1‑289 (MQ=255) tttttGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGa < 1:1307616/288‑1 (MQ=255) tttttGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGa < 1:198074/288‑1 (MQ=255) aCGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCg > 2:177584/1‑289 (MQ=255) cGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCa < 2:419757/145‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGC‑CGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAGTTTGTGACGTTGGTCATGTTTATGACAAATTCTGAGTCGTTACACAGCACCTATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATAGTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCt < 2:1617616/288‑1 (MQ=255) cACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGCTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATCCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCCCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGGAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGAAGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAAt > 1:219583/1‑289 (MQ=255) aCGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAAtt > 1:1107657/1‑289 (MQ=255) ggCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAACGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCcgcg < 1:1410701/289‑1 (MQ=255) tGGGGTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCTATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCTCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAGATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCaa > 1:767504/1‑288 (MQ=255) gggTAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCt > 2:1541828/1‑289 (MQ=255) tAAAATCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCtttt > 1:821360/1‑289 (MQ=255) tCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCTTTTTCCt > 1:433907/1‑288 (MQ=255) tCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCTTTTTCCt > 1:731473/1‑288 (MQ=255) tCAATGGATGAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTACACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCCAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCTTTGTcat > 2:346484/1‑286 (MQ=255) ||| GCATTGCCAGGCCAGGAAGCGCGCTAATCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAAACTCGTGCTAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGAACTATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCACTTTCGTTACACAGCACGCTTTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAGAATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCTTTTTCCTGCT > CP042583/662668‑663227 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |