| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 459,879 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 459,880 | 0 | G | C | 100.0% | 693.3 / NA | 293 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (169/124); total (169/124) | |||||||||||
| * | CP042583 | 459,881 | 0 | C | G | 100.0% | 701.9 / NA | 293 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (169/124); total (169/124) | |||||||||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
AAACAGACTGCGGTATGGATTAGAAATAGCCATACCAATGAGCGCTTTCTGGTCAATAGCTGGATTGAAAACAGCAGCGGTGTAAAAGAAAAGAGTTTCATCATTACACCGCCACTGTTTGTTAGTGAACCCAAAAGCGAAAATACTTTGCGTATTATTTACACCGGTCCACCGCTGGCAGCAGATCGTGAGTCTCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAG > CP042583/459600‑460158 ||| aaaCAGACTGCGGTATGGAATAGAAATAGCCATACCAATTAGCGCTTTCTGGTCAAGTCGTGGATTGAAAACAGCAGCGGTGTAAAAGAAAAGTCATTCATCATTACACCGCCACTGTTTGTTAGTGAAACCAAAAGCGAAAATACTTTGCGTATTATTTACACCGGTCCACCGCTGGCAGCAGATCGTGAGTCTCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGa < 1:767735/289‑1 (MQ=255) 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AAACAGACTGCGGTATGGATTAGAAATAGCCATACCAATGAGCGCTTTCTGGTCAATAGCTGGATTGAAAACAGCAGCGGTGTAAAAGAAAAGAGTTTCATCATTACACCGCCACTGTTTGTTAGTGAACCCAAAAGCGAAAATACTTTGCGTATTATTTACACCGGTCCACCGCTGGCAGCAGATCGTGAGTCTCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAG > CP042583/459600‑460158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |