| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 460,071 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 460,071 | 0 | A | T | 99.6% | 561.6 / NA | 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (116/121); minor base C (1/0); total (117/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 460,072 | 0 | G | C | 99.6% | 557.4 / NA | 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (116/121); minor base A (1/0); total (117/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 460,073 | 0 | T | A | 99.6% | 560.3 / NA | 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (116/121); minor base C (1/0); total (117/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATAGTTCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCC > CP042583/459794‑460352 ||| tctGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTccc < 1:1633065/289‑1 (MQ=255)tctGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTccc < 1:363414/289‑1 (MQ=255)tctGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTc > 1:1052171/1‑287 (MQ=255) tGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCtt < 2:390603/289‑1 (MQ=255) gTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCtt > 1:1086616/1‑288 (MQ=255) ttCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTGTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTACTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGACTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCGTa > 2:1133946/1‑288 (MQ=255) gATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAAGGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATGTTAGCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGCAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTAGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTTGGCATCCAAAAGTTGGGGAATGCGATTGCTGCCTCTAGAGGTAATTCAAAAATTCCCTTAccctca > 2:33026/1‑286 (MQ=255) gATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTGTTTCCCCGTGCAATTCAAGTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACCCTCAAGTTTTCGCGCTCCGGTAACCATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTGTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGTGAATGCTATGGCTGCACTCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctca > 2:1095089/1‑286 (MQ=255) gATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctca > 2:916042/1‑286 (MQ=255) gATGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctca > 2:904849/1‑286 (MQ=255) tGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcag < 1:937081/288‑5 (MQ=255) tGAATGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcag < 1:1304340/288‑5 (MQ=255) aTGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggagt > 1:136880/1‑281 (MQ=255) aTGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggagt > 1:219223/1‑281 (MQ=255) aTGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggagt > 1:1907814/1‑281 (MQ=255) aTGTTAAGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggagt > 1:1787142/1‑281 (MQ=255) cGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTCGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCCATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCCAGTTTTCGCGACCAGTTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCCCCTTTTTATGTCCCCCTGTTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAACGTTGTCGAATGCAATGGCAGCCCACAGAGTGAATTCACAAATTCCCTGCCCCTCAGGAGTGCAGGGcaa > 2:1770547/1‑289 (MQ=255) atcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTTGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCATGATCCTCAAGAGGGCAGGGAAAg > 2:1033875/10‑288 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATTACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCCCAGGAGTGCAGGGaaa > 2:235290/9‑286 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 2:586664/9‑286 (MQ=255) cccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTg < 2:1190090/282‑1 (MQ=255) aTAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCaaa > 1:1011820/1‑286 (MQ=255) tAAAAATGCAGTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAAGCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGa < 1:895500/287‑1 (MQ=255) aaTGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTAccctcaggagt < 1:626977/260‑9 (MQ=255) aaTGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTa < 1:667047/289‑1 (MQ=255) tGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAAt > 2:1663242/1‑289 (MQ=255) tGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAAt > 1:153293/1‑289 (MQ=255) ttGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGAtt > 2:652092/1‑289 (MQ=255) ttGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCAGAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGAtt > 1:1124405/1‑289 (MQ=255) tGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTa < 1:529983/289‑1 (MQ=255) gAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCATAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAATTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTAt < 2:773501/289‑1 (MQ=255) ggAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCAGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcag < 2:1608132/288‑5 (MQ=255) aaTGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcag < 2:153293/286‑5 (MQ=255) aaTGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcag < 1:236731/286‑5 (MQ=255) tGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACt < 1:1608142/289‑1 (MQ=255) ttGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGATGGGGAATGCTATGGCTGCACTCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTCAATGATTATGGTTCAGTAACTGCgg > 2:1306706/1‑289 (MQ=255) ggCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGaa > 1:63117/1‑289 (MQ=255) ggCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTCCAGACCGTTAATGATTATGGTACAGTAACTCCGGTCAGAGaa > 2:1909841/1‑289 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 1:1167810/288‑1 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCACCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 1:981336/288‑1 (MQ=255) cgcGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTaaa < 1:916042/287‑1 (MQ=255) attTCTCCGTCCAAGTAAAGTACAAGAATTAAACGCAGAAGCGACGGACACACTCAAGGTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAatcat < 2:812421/289‑1 (MQ=255) ccAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAatat < 2:1296059/289‑1 (MQ=255) tcaattACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCagag < 1:1760302/289‑1 (MQ=255) tACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAAt < 2:1623896/289‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAcc < 1:83777/289‑1 (MQ=255) ccGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACgg < 1:652092/289‑1 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTcc > 2:1070237/1‑288 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCg < 2:864091/289‑1 (MQ=255) cTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAGCTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc < 1:1747980/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:610105/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:1239535/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:265922/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 1:497433/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 1:886630/289‑1 (MQ=255) tttcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGta < 2:1055309/284‑1 (MQ=255) tcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGtat > 1:1802566/4‑288 (MQ=255) aCTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGc < 2:63117/289‑1 (MQ=255) atatCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACAGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTAAGGATATTCCGCAGTGGTATACCTGCTGTCTGGCCgg > 1:1699213/1‑289 (MQ=255) atCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGaa > 2:782394/1‑289 (MQ=255) tGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGt > 1:1209226/1‑289 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGa < 2:159128/207‑1 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa > 1:591604/1‑230 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTta > 1:148341/1‑289 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTta > 1:1658967/1‑289 (MQ=255) cATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCactac > 1:437724/1‑239 (MQ=255) cATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCactac < 2:437724/239‑1 (MQ=255) cATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTtatt > 2:188229/1‑288 (MQ=255) cATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACACAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAAACACTACTACGCATATTCTGCTGAGGTATACCTGATGTCTTGCCGGAATTTGTtatt > 2:502669/1‑288 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCtt > 2:195302/5‑289 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCtt > 1:1118868/5‑289 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCtt > 2:107561/5‑289 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCtt > 1:35053/5‑289 (MQ=255) tcaccTTTGTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCATTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTg < 1:1227492/286‑1 (MQ=255) tttATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCAtttt > 1:265495/1‑289 (MQ=255) aTGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAAACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTAcc < 1:1330473/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 2:1802566/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:1612978/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:1070237/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:782394/289‑1 (MQ=255) cACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGCGCAGGCAAAGCTGAAATTGCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACAGAATAATCTGACCATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGCATACCTGGTGTCTGGCCGGCATTTGTTATTGATCTCTTCCCTTTTTACcct > 2:1428251/1‑287 (MQ=255) cTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGACTTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTAt > 1:1001392/1‑289 (MQ=255) aaGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCgg < 2:179697/288‑1 (MQ=255) aaGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCgg > 1:179697/1‑288 (MQ=255) aaGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGCGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGACTCATCTGACAATATCCGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGAATATTCAGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAAATTGTAATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCATTTTTAAGCTATGCgaa > 2:420003/1‑287 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGGCCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGtt > 2:956271/1‑289 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGa > 2:717233/1‑160 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGa < 1:717233/160‑1 (MQ=255) tGGGGAATGCTATGGGTGCAACCCGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGc < 2:1733742/289‑1 (MQ=255) tGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACGGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCCGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGc < 2:361774/289‑1 (MQ=255) gggAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCAt > 1:1839564/1‑289 (MQ=255) ggAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCAt < 1:107561/288‑1 (MQ=255) aaTGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCAttt < 2:942369/288‑1 (MQ=255) tGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTtta < 2:1209226/289‑1 (MQ=255) tATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTttatt < 1:820168/288‑1 (MQ=255) tGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTaga > 1:1579648/1‑289 (MQ=255) ggCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGCGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTagag < 2:1310848/289‑1 (MQ=255) gCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGATAATg > 2:750016/1‑289 (MQ=255) cccAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGc > 2:640432/1‑288 (MQ=255) gagTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGTCATTTTTATTAGATAATGGCACAt > 2:1219757/1‑288 (MQ=255) ||| TCTGTTCTGGATGAATGTTAAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATAGTTCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCC > CP042583/459794‑460352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |