| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 460,089 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 460,089 | 0 | A | T | 99.0% | 477.7 / NA | 206 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (95/108); minor base C (2/0); total (97/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 460,090 | 0 | G | C | 99.5% | 481.6 / NA | 206 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (96/109); minor base A (1/0); total (97/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 460,091 | 0 | T | A | 99.0% | 483.4 / NA | 206 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (95/109); minor base C (2/0); total (97/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
AAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATAGTTCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGTTGCTGATTTAAGCCG > CP042583/459813‑460369 ||| aaGACGATCCCTTCGGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACACGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCACGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTCAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATCCCTAACTTCCCTAACCCCCAGGAGTGCAgg > 2:1800067/1‑289 (MQ=255) atcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTTGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCATGATCCTCAAGAGGGCAGGGAAAg > 2:1033875/10‑288 (MQ=255) atcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 1:5026/10‑287 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATTACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCCCAGGAGTGCAGGGaaa > 2:235290/9‑286 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 2:586664/9‑286 (MQ=255) tcccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGaaa > 1:1310848/9‑286 (MQ=255) cccttcggTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTg < 2:1190090/282‑1 (MQ=255) aGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCa < 1:1417890/288‑1 (MQ=255) aGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAg < 1:23555/289‑1 (MQ=255) aTAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCaaa > 1:1011820/1‑286 (MQ=255) aaTGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTa < 1:667047/289‑1 (MQ=255) tGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAAt > 2:1663242/1‑289 (MQ=255) tGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAAt > 1:153293/1‑289 (MQ=255) ttGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGATGAAATTTCAGACCGTTCATGAtt > 1:1755917/1‑289 (MQ=255) aCGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATgg < 2:738807/289‑1 (MQ=255) cAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACGGTTAATGATTATGGttca > 1:361774/1‑286 (MQ=255) ggAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGACCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTGTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGACAGCCAAAAGTTAGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCAGTACCTTCCAGAGTACAGGGAAAGCTCAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcagt > 2:1814148/1‑284 (MQ=255) ggAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCAGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcag < 2:1608132/288‑5 (MQ=255) aaTGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcag < 2:153293/286‑5 (MQ=255) aaTGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTACGTCAAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGttcag < 1:1110470/286‑5 (MQ=255) aTGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTACCTATATCAATGTTCATAATCTATCACCTGTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAACAGTTGGGGAATGCTATGGCTGGACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTCACGGGACAGCTGAACTTTCCGACTGTTAATTATTATGGttcagtaa > 2:755955/1‑281 (MQ=255) tGTTTTGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACt < 1:1608142/289‑1 (MQ=255) ttGCAACTGGCGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCgg > 1:1733742/1‑289 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 1:1167810/288‑1 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 1:1121764/288‑1 (MQ=255) cGATTTTATCGCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCACCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 1:981336/288‑1 (MQ=255) cgcGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTaaa < 1:916042/287‑1 (MQ=255) attTCTCCGTCCAAGTAAAGTACAAGAATTAAACGCAGAAGCGACGGACACACTCAAGGTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAatcat < 2:812421/289‑1 (MQ=255) tcaattACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCagag < 1:1209318/289‑1 (MQ=255) tcaattACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCagag < 1:1790186/289‑1 (MQ=255) ttACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCCGCAAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATTTTACAATCTAGGAGCTaa > 2:1118556/1‑289 (MQ=255) ttACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACGCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACAGCATCATCTGACAATATCAGAGCTaa > 2:647210/1‑289 (MQ=255) tACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAAt < 1:1231225/289‑1 (MQ=255) tACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAAt < 2:1623896/289‑1 (MQ=255) aTTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa < 1:632413/289‑1 (MQ=255) aTTACCCGAAGAAGCGCCGACCACACTCAAGTGTTCGCGATCCGGTAACTATATAAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACGTACAAGTGGGCAGCCAAATGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa < 2:42825/289‑1 (MQ=255) cccGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGCTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACACTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGAACGTTAATGATTATGTTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGTGATAATAATTAAAATa > 2:1848421/1‑288 (MQ=255) ccGCAGACGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTGTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAcc < 1:1770547/289‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAcc < 1:904849/289‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAcc < 1:895084/289‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAcc < 1:83777/289‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCAAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATAcc < 1:1800067/289‑1 (MQ=255) gCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCa < 2:414668/289‑1 (MQ=255) ccGGACACACTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACgg < 1:652092/289‑1 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTcc > 2:1070237/1‑288 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCg < 2:453124/289‑1 (MQ=255) acTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCg < 2:864091/289‑1 (MQ=255) ctaaagtttgcgagATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc < 2:652480/276‑1 (MQ=255) cTCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGc < 2:1787142/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:610105/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:1239535/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 2:265922/289‑1 (MQ=255) tCAAGTTTTCGCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGGTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCa < 1:1550843/289‑1 (MQ=255) tttcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGta < 2:1055309/284‑1 (MQ=255) tcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAg < 2:1302186/202‑1 (MQ=255) tcgcGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGtat > 2:937183/4‑288 (MQ=255) acGATCCGGTAACTATATCAATGGTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATAcc < 2:1309771/288‑1 (MQ=255) aaCTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTg > 1:776581/1‑288 (MQ=255) aCTATATCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGc < 2:63117/289‑1 (MQ=255) atatCAATGTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACAGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTAAGGATATTCCGCAGTGGTATACCTGCTGTCTGGCCgg > 1:1699213/1‑289 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGaaa > 1:591604/1‑230 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCact < 1:629058/239‑1 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTta > 1:1658967/1‑289 (MQ=255) ttCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTAGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGCGGTATACCTGTGTTCTGGCCGGATTTTGTta > 2:329957/1‑289 (MQ=255) cATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGTGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTtatt < 1:1133946/289‑2 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAatcat < 1:1912396/189‑1 (MQ=255) atcaccTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAatcat > 2:1912396/5‑193 (MQ=255) ttttATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACtactac < 1:1055616/227‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:1070237/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 1:782394/289‑1 (MQ=255) gTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACcct < 2:776581/289‑1 (MQ=255) cACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGCGCAGGCAAAGCTGAAATTGCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACAGAATAATCTGACCATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGCATACCTGGTGTCTGGCCGGCATTTGTTATTGATCTCTTCCCTTTTTACcct > 2:1428251/1‑287 (MQ=255) gTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTaa > 1:488982/1‑289 (MQ=255) cTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGACTTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTAt > 1:1001392/1‑289 (MQ=255) cTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTag > 2:1585936/1‑288 (MQ=255) ttACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCt > 1:1336530/1‑286 (MQ=255) ttACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCt < 2:1336530/286‑1 (MQ=255) aaGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGa > 1:285642/1‑289 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGa < 1:717233/160‑1 (MQ=255) ggCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGTTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGtt > 2:214249/1‑289 (MQ=255) tGGGGAATGCTATGGGTGCAACCCGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGc < 2:1733742/289‑1 (MQ=255) tGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACGGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCCGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGc < 2:361774/289‑1 (MQ=255) tGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGc < 1:245350/289‑1 (MQ=255) gggAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCAt > 1:1839564/1‑289 (MQ=255) ggAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCAt < 1:107561/288‑1 (MQ=255) tGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTtta < 2:1209226/289‑1 (MQ=255) gCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTTAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTttat < 2:1907814/289‑1 (MQ=255) tATGGCTGCACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTttatt < 1:820168/288‑1 (MQ=255) cTGCAACCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCGCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAgaga < 2:1253475/288‑1 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATg > 1:1615619/1‑288 (MQ=255) cACCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATg > 1:1821301/1‑288 (MQ=255) aCCCAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGc > 1:560177/1‑289 (MQ=255) cAGAGTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGcaca < 1:411967/289‑1 (MQ=255) gagTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTg < 2:952435/216‑1 (MQ=255) gagTTAATTCACAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGTCATTTTTATTAGATAATGGCACAt > 2:1219757/1‑288 (MQ=255) ttaattcacAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGt < 2:1777397/281‑1 (MQ=255) cAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGTTGCTGAtt > 1:1094938/1‑289 (MQ=255) cAAATTCCCTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGTTGCTGAtt > 2:549672/1‑289 (MQ=255) aTTCCCTTTCCCTCAGGAGTGTATGGAAAGCTGAAATTTCAGAACGTTAATGAGTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGTTGCTGATTTat < 2:1755917/289‑2 (MQ=255) ccTTACCCTCAGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTTCAGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATTCATCTCTTGCCATTTTCCCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGTTGCTGATTTatcgag > 2:1043736/1‑284 (MQ=255) ||| AAGACGATCCCTAGCGTAGATAAAAATGCATTGAACGGCAGGAATGTTTTGCAACTGGCGATTTTAAGCCGCATGAAATTATTTCTCCGTCCAATTCAATTACAAGAATTACCCGCAGAAGCGCCGGACACACTCAAGTTTAGCCGATCCGGTAACTATATCAATGTTCATAATCCAAGTCCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTTGGGGAATGCTATGGCTGCACCCAGAGTTAATAGTCAAATTCCCTTACCCAGTGGAGTGCAGGGAAAGCTGAAATTTCAGACCGTTAATGATTATGGTAGTGTAACTCCGGTCAGAGAAGTGAACTTAAACTAACCGAATCATCTGACAATATCAGAGCTAATTATGAAAATACCCACTACTACGGATATTCCGCAGAGGTATACCTGGTGTCTGGCCGGAATTTGTTATAGTTCTCTTGCCATTTTACCCTCCTTTTTAAGCTATGCGGAAAGTTATTTCAACCCGGCATTTTTATTAGAGAATGGCACATCCGTTGCTGATTTAAGCCG > CP042583/459813‑460369 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |