Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 694,081 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 694,081 | 0 | A | T | 99.6% | 586.1 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 694,082 | 0 | G | C | 99.6% | 583.6 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (131/119); total (131/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 694,083 | 0 | C | G | 99.6% | 583.8 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (129/120); total (131/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TGCGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTAGCCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTGACCGCATGCTCGACATGGGCTTTATCCACGATATCCGTCGCGTGTTAACAAAACTACCTGCGAAGCGCCAGAACCTGTTATTCTCCGCGACCTTCTCTGACGATATTAAAGCCCTGGCGGAA > CP042583/693803‑694362 ||| tGCGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTggt‑ggt > 1:1881521/1‑289 (MQ=255) ggcgcgcCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCCGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGCCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTggt‑ggt < 1:797192/288‑1 (MQ=255) ccccGTTGCCGAGCAGTGTTACCGTGAACCCAGCCCGATTCCGCAGCAGGCGAGCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGTCTAGCGCCCAGACCGGAACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCATACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGtt < 2:1627249/286‑1 (MQ=255) gcCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTtg < 1:138331/289‑1 (MQ=255) cGTTGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTtgg < 1:875817/288‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTTCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCCGATTGGCGCAAACGTCCGTCATTACAGCACCTACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTgggtgg > 2:589793/1‑289 (MQ=255) gCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGAAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGgtggtg < 1:1748016/289‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGgtgt < 1:510457/288‑1 (MQ=255) cAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCCAAGGGCGTCGTCCGGTACGTTCGCCCATCCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCCGCGCCGATGGGCGAAAACGTCCGTGATTACCGCCAATCACTGAACCTTCGTTCGCTGGTGGGTGTTGGGGGGggtggtt > 2:210384/1‑286 (MQ=255) ccGTGAACCCACCCCGAGTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCg < 1:1230532/289‑1 (MQ=255) gggAACCCACCCCTATCAAGCAGCAGGCGATACCGGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGACCAGACCGGCAACGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTGGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCa < 2:758053/287‑1 (MQ=255) aaccacccccTCTTCGCCGGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACGGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCCCGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAga < 2:814657/282‑1 (MQ=255) aaCCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAgat > 2:1216572/1‑289 (MQ=255) aaCCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAgat > 2:888908/1‑289 (MQ=255) aaCCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTCGT‑GGTGGTTTGTTGGGTGAGTATTAACCCggcgaa > 2:761737/1‑284 (MQ=255) aaCCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGCCGTCCGGTACGTGCGCGCATTCTTACCCCCACCCGTGAACTGGCGGCGCAGAGTGGCGAAAAGGTACGTGATTACAGCAAATGCCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTTGTGGGAGTATTAACCCGcgtag > 2:1245008/1‑285 (MQ=255) acccacccCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGCACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGC‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAgatg > 1:643287/1‑289 (MQ=255) cccacccCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCGGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAgatga < 1:1567122/289‑1 (MQ=255) cagcagGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGCTTGGCTAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTCTTAACCAGCAGCTTATGAAACTGCTCggcg > 2:1385692/1‑289 (MQ=255) cagcagGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGGGTgggg > 2:467661/1‑287 (MQ=255) cagGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCa < 1:218776/266‑1 (MQ=255) aggggagcctggCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACCCCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGgcggcg < 2:874702/277‑1 (MQ=255) ggCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGtt > 2:1742484/1‑289 (MQ=255) tCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCCGGT‑GGGGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGAGTACAAAACGGCGGGGCGGCGTTGgtgt > 2:1396654/1‑289 (MQ=255) tGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCtg > 1:199913/1‑289 (MQ=255) gCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGc < 1:738551/288‑1 (MQ=255) ccGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCGAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCggg > 1:590215/1‑288 (MQ=255) ccGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGGTCTTGTGGAAACCCCggg > 2:376178/1‑288 (MQ=255) 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gATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTGACCGCATGCTCGACATGGGCTTTATCCACGATATCCGTCGCGTGTTAACAAAACTACCTGCGAAGCGCCAGAACCTGTTATTCTCCGCGACCTTCTCTGACg < 2:317105/289‑1 (MQ=255) aGCAAATACCTGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTGACCGCATGCTCGACATGGGCTTTATCCACGATATCCGTCGCGTGTTAACAAAACTACCTGCGAAGCGCCAGAACCTGTTATTCTCCGCGACCTTCTCTGACGATATTa > 2:1328527/1‑289 (MQ=255) tGAACATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTGACCGCATGCTCGACATGGGCTTTATCCACGATATCCGTCCCGTGTTAACAAAACTACCTGCGACGCGCCATAACCTGTTATTCCCCGCCACCTTCCCTGACGATATTAATGCCCTGGc > 2:246836/1‑289 (MQ=255) aaCATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCTGCGTTGATGTGCTGGTGGCAATCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTGACCGCATGCTCGACATGGGCTTTATCCACGATATCCGTCGCGTGTTAACAAAACTACCTGCGAAGCGCCAGAACCTGTTATTCCCCGCGACCTTCCCTGACGATATTAACTCCCTGGCg > 2:732515/1‑288 (MQ=255) aaCATTCGTTCGCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTg < 2:227463/169‑1 (MQ=255) ||| TGCGCGCCGTTGCCGAGCAGGGTTACCGTGAACCCACCCCTATTCAGCAGCAGGCGATCCCTGCGGTGCTGGAAGGCCGCGACCTGATGGCTAGCGCCCAGACCGGCACCGGCAAAACAGCGGGCTTTACGCTGCCGCTGTTGCAACACCTGATCACTCGCCAGCCGCACGCCAAAGGGCGTCGTCCGGTACGTGCGCTCATTCTTACCCCGACCCGTGAACTGGCGGCGCAGATTGGCGAAAACGTCCGTGATTACAGCAAATACCTGAACATTCGTAGCCTGGT‑GGTGTTTGGTGGTGTGAGTATTAACCCGCAGATGATGAAACTGCGTGGCGGCGTTGATGTGCTGGTGGCAACCCCGGGACGTTTGCTGGACCTGGAACATCAGAATGCAGTGAAGCT‑GGATCAGGTTGAAATCCTCGTCCTCGATGAAGCTGACCGCATGCTCGACATGGGCTTTATCCACGATATCCGTCGCGTGTTAACAAAACTACCTGCGAAGCGCCAGAACCTGTTATTCTCCGCGACCTTCTCTGACGATATTAAAGCCCTGGCGGAA > CP042583/693803‑694362 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |