Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 697,902 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 697,902 | 0 | A | T | 97.7% | 619.0 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (134/126); minor base C (5/1); total (140/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 697,903 | 0 | G | C | 99.6% | 630.1 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (139/127); total (140/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 697,904 | 0 | C | G | 99.6% | 631.3 / ‑3.7 | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (139/127); minor base . (1/0); total (140/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
GTGACGGATTTACGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGAGTTTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCAGCTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGA > CP042583/697623‑698181 ||| cGGATTTACGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGAt > 1:1908491/1‑289 (MQ=255) aTTTACGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTca > 1:1226425/1‑289 (MQ=255) aTTTACGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTca > 1:1489273/1‑289 (MQ=255) gttAGGTCTGAATTTGCGGCTTCGGGGGCATCAGCCGAGTT‑GCGTGTACGTTGAACTGACCCGCAAACGCATAGCCAACGGTGTGCGCCGAGGGCTGGTGGGCTTACAGTCAGTTGCCGACGGGCTTGATTTGATAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCAGCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGCG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTca < 2:45468/287‑1 (MQ=255) tACGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTcagca < 1:1128012/289‑1 (MQ=255) aCGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTcagcag > 1:1014294/1‑289 (MQ=255) gTTGGTGGTTCAAGGCGGTCAGCCGCGTTGAGTTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGGGAGGGCCGGGTGCTGGTGGGCTTACAGGCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGa < 2:1456220/289‑1 (MQ=255) tgcggtcagcgcggTTACCGGTTG‑GTTAAGCGGCACCGCAAACGCGCCGCCAACGGTGAGCGGAGTGTGCTGGTGGGCTTACCGTCATTTGGCGAAGGGGTTGATTTGAAAGTTGTTCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGGGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGc < 2:477660/275‑1 (MQ=255) ggCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCCCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACAGATTccacgc > 2:797533/1‑283 (MQ=255) gggttCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTAGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGcc < 2:643194/284‑1 (MQ=255) gCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTTCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCTAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGc < 1:306130/287‑1 (MQ=255) cGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCa < 1:26692/288‑1 (MQ=255) gctCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GGTGAACTGCACCGCAAACGCGGCGCCAACGGTGAGGGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACg < 2:1025898/287‑1 (MQ=255) aTCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCCACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCCAT‑CGCCTCGTTTACCCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACgg > 2:534639/1‑289 (MQ=255) aTCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACg < 1:40420/288‑1 (MQ=255) tCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGt > 1:356291/1‑289 (MQ=255) cgcgTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTg < 1:1642371/286‑1 (MQ=255) cgcgTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTg < 1:592221/289‑1 (MQ=255) ttACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGCCAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGACTGGCTGAAAAGCCTCAACAGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTTGCTCTAAGCCCCGGGTTCAggggg > 2:24583/1‑288 (MQ=255) tACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCg > 1:1021707/1‑289 (MQ=255) cggttagtgcaccagCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGGGTGCTGGTGGGCTTACAGTCGTTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACCAACTCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAg < 2:1047787/275‑1 (MQ=255) ttA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTgg < 1:129834/289‑1 (MQ=255) ttA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTgg < 1:19285/289‑1 (MQ=255) ttA‑GTGGAACTGCACGGCAAAGGGGTGGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCGCCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTgg < 2:896350/289‑1 (MQ=255) tA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGt > 1:1117589/1‑289 (MQ=255) aaCTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCt > 1:931439/1‑288 (MQ=255) cACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCAc > 1:1736840/1‑258 (MQ=255) cACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACa > 1:626747/1‑289 (MQ=255) cACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACa > 1:1845687/1‑289 (MQ=255) cACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACa > 2:684342/1‑289 (MQ=255) ccGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGTCATTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACaa > 1:1719545/1‑288 (MQ=255) 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gCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTGCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATc > 1:963004/1‑289 (MQ=255) gCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTa < 2:1207497/272‑1 (MQ=255) gCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCggg > 2:572158/1‑289 (MQ=255) gCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCggg > 2:1603615/1‑289 (MQ=255) gCCGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCggg > 1:664476/1‑289 (MQ=255) cGAG‑CGCCTCGTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGa < 2:254227/288‑1 (MQ=255) ||| GTGACGGATTTACGTCTGATGTTGCTGGTTCAGGGCGATCAGCCGCGTTACCGTTTA‑GTTGAACTGCACCGCAAACGCGTCGCCAACGGTGAGCGCAGCGTGCTGGTGGGCTTACAGAGTTTTGCCGAAGGGCTTGATTTGAAAGGTGATCTGCTCAGCCAGGTGCATATCCACAAAATCGCTTTTCCGCCCATCGACAGCCCGGTGGTGATCACCGAAGGGGAATGGCTGAAAAGCCTCAACCGCTATCCGTTTGAGGTGCAAAGCCTGCCGAG‑CGCCAGCTTTAACCTGATTCAGCAGGTTGGGCGACTGATTCGAAGCCACGGTTGCTGGGGCGAAGTGGTTATCTACGACAAACGCTTGCTGACCAAAAATTATGGCAAGCGACTACTGGATGCATTACCGGTATTTCCGATAGAGCAACCGGAAGTCCCTGAAGGTATAGTTAAAAAGAAAGAAAAAACGAAATCCCCACGCCGTCGGCGGCGTTAATGATGTGAGTCAGGTAAGGAGTCGTAAATGGACTATCGCAAAATCATTAAAGAGATCGGGCGCGGGA > CP042583/697623‑698181 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |