Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 461,562 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 461,562 | 0 | A | T | 99.6% | 603.2 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 461,563 | 0 | G | C | 100.0% | 597.4 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (111/140); total (111/140) | |||||||||||
* | CP042583 | 461,564 | 0 | C | G | 100.0% | 593.8 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (111/140); total (111/140) |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CGTTTCAAATTTGACCTGACGGCGGGCGATTTTCGTAGCGGTAATAGTCAG‑CAAAGTAGCCCTTTCTTTTTTCAGGGTACGGCACTCGGCGGTTTACCACAGGAATTTACTGCCTACGGCGGGACGCAATTATCTGCCAATTACACCGCCTTTTTATTAGGGCTGGGGCGCAATCTCGGGAACTGGGGCGCAGTGAGCCTGGATGTAACGCATGCGCGCAGTCAGTTAGCCGACGCCAGTCGTCATGAGGGGGATTCTATTCGCTTCCTCTATGCGAAAAGCATGAACACCTTCGGCACCAATTTTCAGTTAATGGGTTACCGCTATAGCACACAAGGTTTTTATACCCTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTAGTCAAAGTCTTAATGACTTTGGCAGCCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTAGCGATAGTGATAC > CP042583/461283‑461842 ||| tttCAAATTTGACCTGACGGCGGGCGATTTTCGTAGCGGTAATAGTCAG‑CAATCATCGCCTTTCTTTTTTCAGGGTACGGCACTCGGCGGTTTACCACAGGAATTTACTGCCTACGGCGGGACGCAATTATCTGCCAATTACACCGCCTTTTTATTAGGGCTGGGGCGCAATCTCGGGAACTGGGGCGCAGTGTCGCTGGATGTAACGCATGCGCGCAGTCAGTTAGCCGACGCCAGTCGTCATGAGGGGGATTCTATTCGCTTCCTCTATGCGAAATCGATGAaca > 1:630552/1‑287 (MQ=255) 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aTGCGAAATCGATGAACACCTTCGGCACCAATTTTCAGTTAATGGGTTACCGCTATTCGACACAAGGTTTTTATACCCTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACttcggattcagatac < 1:586585/289‑15 (MQ=255) ||| CGTTTCAAATTTGACCTGACGGCGGGCGATTTTCGTAGCGGTAATAGTCAG‑CAAAGTAGCCCTTTCTTTTTTCAGGGTACGGCACTCGGCGGTTTACCACAGGAATTTACTGCCTACGGCGGGACGCAATTATCTGCCAATTACACCGCCTTTTTATTAGGGCTGGGGCGCAATCTCGGGAACTGGGGCGCAGTGAGCCTGGATGTAACGCATGCGCGCAGTCAGTTAGCCGACGCCAGTCGTCATGAGGGGGATTCTATTCGCTTCCTCTATGCGAAAAGCATGAACACCTTCGGCACCAATTTTCAGTTAATGGGTTACCGCTATAGCACACAAGGTTTTTATACCCTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTAGTCAAAGTCTTAATGACTTTGGCAGCCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTAGCGATAGTGATAC > CP042583/461283‑461842 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |