| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 716,943 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 716,943 | 0 | A | T | 99.6% | 653.0 / NA | 276 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (150/125); minor base G (0/1); total (150/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 716,944 | 0 | G | C | 100.0% | 641.3 / NA | 276 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (150/126); total (150/126) | |||||||||||
| * | CP042583 | 716,945 | 0 | C | G | 99.3% | 642.4 / NA | 277 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base G (148/126); minor base T (2/0); total (150/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTAGCCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTAGCTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGCTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGC > CP042583/716663‑717232 ||| cTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTTTTGTTGTTCCGCTTACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAAACGGCTGATTCTTTTTTAGGCGCTGGACTGTC‑ACGCTGGTTCGCTACTg > 2:1503605/1‑289 (MQ=255) gCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGCTTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCCGGTTCGCTACTGAc > 2:1220770/1‑288 (MQ=255) ccATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAAt > 1:1238102/1‑289 (MQ=255) ttAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCg > 2:1350023/1‑288 (MQ=255) ttAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGCGTCAGATCCCGGTTAATCGGCTGATCATTTTTGGGGCGCTGG‑CAGTCAACGGTGGTTCGGTAATAAGCCCAATTGGCAACCAGc > 2:773652/1‑289 (MQ=255) aaGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCaa > 2:796614/1‑289 (MQ=255) ccTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAatat > 1:1876456/1‑288 (MQ=255) cTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTTAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAatat > 1:1151012/1‑287 (MQ=255) cTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAACatat > 1:224666/1‑287 (MQ=255) cTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAatat > 1:1572683/1‑287 (MQ=255) tGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCt > 2:1540656/1‑289 (MQ=255) gctgctGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATc < 1:961571/289‑1 (MQ=255) ctgACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTggg > 1:1721855/1‑289 (MQ=255) ctgACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCCGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCCACCCGCAAAATATTCTTATCTggg > 2:632673/1‑289 (MQ=255) ctaaaGGTGTGGTGTTCATGGGTTATTTGGGTGGGCTGGGGCGAAAAGTGGTGCGCCGCTCGGGTACGGAGCGTGGGCTGGCGATGTTTAGGGTGCGGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTGCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACg < 2:1273691/287‑1 (MQ=255) tgGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAACCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCAGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCt > 2:490480/1‑289 (MQ=255) tgGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTGATGGTTCTGGCGGCGGCGCTGATTTGTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTGATTGTTGTTCGGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGCTAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTCGCGGCTCTGG‑CCGTCAACGCTGTTTCGCTACTGCTGTCATTTGGCTATCCGCAACGTACTAGTATCAGGGGaaaatctggg > 2:1068741/1‑278 (MQ=255) aaGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCtttcgttt < 1:921744/289‑7 (MQ=255) aTTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTggg < 2:1410931/261‑1 (MQ=255) cTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTTGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCaaa > 2:603834/1‑289 (MQ=255) cTGGCGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTCACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCtaa > 1:1774247/1‑289 (MQ=255) ggggCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATg > 1:959459/1‑289 (MQ=255) ggCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATgg < 2:1378895/288‑1 (MQ=255) cAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCAcc > 1:646736/1‑288 (MQ=255) cAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCAcc > 2:508717/1‑288 (MQ=255) tGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCgctggctg > 1:848834/1‑288 (MQ=255) gcctcTTTGCTAGGGGGCGTCGGCTGGCGAGTTTTATGGGGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGgcg < 2:237856/288‑1 (MQ=255) gccgcTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGgcg < 2:283911/288‑1 (MQ=255) tGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCCGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCCACCAGCAAAATATTCTTAGCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGTCGGCTTTATTGCCCAAATGGCACCTCTGGCTGGCTCaagtatg > 2:827734/1‑284 (MQ=255) ggtACGGAGTGTCGGCTGGGGATGTGTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCCACGATGTCGCGCTGTATATTGTTGTTCCGCTGACGATCACGCTAAAAAGTCTGTGTGAGATCCCGGTTAGTCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTGAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTCGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGc < 2:1595874/287‑1 (MQ=255) gAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACg > 2:1239883/1‑288 (MQ=255) ggCGTCGGCTGGGGAGGTTTATTGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACgc < 2:936167/287‑1 (MQ=255) cGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGT‑‑GATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCGAGGA‑TGCTGACgctgcg > 2:1865248/1‑285 (MQ=255) tCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACggtcct > 1:1213810/1‑288 (MQ=255) gATGTTTATGGTGCTTGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACTATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCtgtg < 2:268935/288‑1 (MQ=255) gATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCtgtg < 2:1738887/288‑1 (MQ=255) tGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCt < 1:251669/288‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGGCGGCGGCGCTTCGTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGtgtt < 2:1693324/289‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGCGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGTGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTCATTGCCCAATGGTGATCGCTGTCAGGCCCAATGACTGGT‑ATGCTCATGATCCTGTCCTTGTGTTGTGTccg > 2:555714/1‑288 (MQ=255) tGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCACTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTc > 2:349123/1‑287 (MQ=255) ggcgCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGTCATGA‑TGCGGACGCGCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTGCCCTGGAAAg > 2:1174323/1‑289 (MQ=255) gcgcTGGTTTCTGCCTTTCTGCCAAACGATGTCGCACTGTTTATTGTTGTTCAGCTGACGTCTAGGTGAAAAATACTGTGTGAGCTCCCGGTTTATCGTCTGATTATTTTTGAGGCGCGTG‑CAGTCAACGCTTGTGCGCTACTGACGCCAATTGGCACCCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGGGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTGTCCCTGGAAAgg < 2:224666/289‑1 (MQ=255) gactgctTTCTTCCCTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATAACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAgg < 2:880597/286‑1 (MQ=255) ctctgctTTCTACCTATCTGACCAACGATGTCGCTCTGTTTATTGGTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGGGATCCCGGTTAATAGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAgg < 1:1705981/286‑1 (MQ=255) cgcTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAgg < 1:616294/288‑1 (MQ=255) cgcTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAgg < 1:1006281/288‑1 (MQ=255) cgcTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGc > 1:1623466/1‑289 (MQ=255) gctTTCGTCCTTTCTGACCAACGGTGTCGCGCTGTTTAGTGTTGTTCCGCTGACTATACCGCTAAAAAGACTGTGTGTGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGGGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTGGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTGCCTGGAAAGGCGATg < 2:1774247/289‑1 (MQ=255) ttCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCaa < 2:332504/289‑1 (MQ=255) ttCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATAc > 1:1054105/1‑289 (MQ=255) tCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACg < 1:318989/289‑1 (MQ=255) aCCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAgg < 1:747675/268‑1 (MQ=255) aCCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACggggg > 1:1833864/1‑289 (MQ=255) cGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGa < 2:470624/266‑1 (MQ=255) cGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGa > 1:470624/1‑266 (MQ=255) gTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATAGGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAaca < 1:490480/288‑1 (MQ=255) cTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGt > 1:692057/1‑289 (MQ=255) tttATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGa > 1:892407/1‑289 (MQ=255) tATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACgctcctgc > 1:1749395/1‑218 (MQ=255) gttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGTTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGc < 2:1013843/289‑1 (MQ=255) gttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGc < 1:1520320/289‑1 (MQ=255) gttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGc < 1:1309087/289‑1 (MQ=255) gtgccGCTAACAATCACGCTTAAAAGACTTTGTGAGATCCCGGTTAATCGGTTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTGGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGc < 2:1098040/286‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTc < 1:1816646/123‑1 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGTCGATGCAATACCATACGGGGGTCCAAACACCGGAGTGGACACcgcg > 2:1139230/1‑286 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATCCGGGGGTGCAAACCCCGGGGTGGAAACcgcg > 2:1489315/1‑286 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACcgcg > 1:1098040/1‑286 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACcgcg > 1:1140637/1‑286 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGcc > 1:23037/1‑288 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCT‑GAAAGGCGCTGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCggggg > 2:455385/1‑286 (MQ=255) ttCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTA‑TTTTGCGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGATCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACAGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCCGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCACTACCAAACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTg > 1:410395/1‑289 (MQ=255) cGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGgt < 2:252785/289‑1 (MQ=255) cTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGcc < 2:868353/95‑1 (MQ=255) cTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGgtgt > 1:1028883/1‑289 (MQ=255) gACTATCACGCTAAAAAGACTTTGT‑‑GATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGT‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAg < 1:1865248/289‑1 (MQ=255) aCTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCAGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTTACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCCTACGGGGGTGCAACAACCGGAGTGGAAACCGCGGCGGGCGGGGa > 2:1724146/1‑289 (MQ=255) cTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAg < 1:796614/289‑1 (MQ=255) cTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAg < 1:565908/289‑1 (MQ=255) cTATCACGCTAAAAAGACTGGTTGAGATCCCGGTTAATGGGCTGATTCTTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAg < 2:1053702/289‑1 (MQ=255) cGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATa > 2:394494/1‑240 (MQ=255) cGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATa < 1:394494/240‑1 (MQ=255) gCTAAAAATACTGTTCGAGATCCCGGTTAATCGGCTGGTTATTTGTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGTGGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAAACCGGAAAATATTCTTGTCTGGGGACGTGCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAAGGA‑TGCTGACGCGCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAACCCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTg < 2:1213810/289‑1 (MQ=255) tAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTggg > 1:720991/1‑289 (MQ=255) tAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTAGCCACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCGGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGTGAAGGCGATGCCATACCATACGGGGGTGCCAACACCGGCGTGGAAACCGGGGGTTGCGTTGAGGTGTCgggg > 2:1032225/1‑289 (MQ=255) aaaaaGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTgggg < 2:1623466/289‑1 (MQ=255) aaaaaGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTgggg < 1:166295/289‑1 (MQ=255) tgtgtgAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTCTTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGCACCCGCGGCCGGTGCGGAGTTGTCTggggtcttatgt > 2:1314891/1‑281 (MQ=255) gtgtgAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGTATTTATTGCCCAAATGGAACCGCTGGCTGTCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAGTa > 1:869033/1‑222 (MQ=255) gtgtgAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAACCACCGGAGTGGAACCCGCGGCTGGTGTGGTGTTTGCTGTGGCTGtagctg > 2:1657928/1‑285 (MQ=255) gtgtgAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGtatagc > 1:1272860/1‑287 (MQ=255) gtgtgAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATc > 1:1257124/1‑289 (MQ=255) tgtgAGATCCCGGTTAAGCGGCTGATTATTTTGGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGTTTTATTGCCCAAATGGCCCCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCGCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTg < 1:263047/276‑1 (MQ=255) aTCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACAACGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTGTGGGGCTGTATATCGTCtt > 1:498325/1‑287 (MQ=255) ccGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGa < 2:693947/289‑1 (MQ=255) cGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAgg > 1:452862/1‑201 (MQ=255) cGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGAc > 1:1463208/1‑289 (MQ=255) tCGGCTGATTATTTTTGATGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGACGGCGCTg < 1:1388370/289‑1 (MQ=255) tCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCCGGTGTGGGGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCGGACGGCGCTg > 2:309443/1‑289 (MQ=255) cTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATAGCGTCTTTCTGACCGCGCCGGAGt > 2:409461/1‑289 (MQ=255) cgcTGG‑CAGTCAACGCTGGTTCGCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTTCGTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGCtgt < 2:1300125/288‑1 (MQ=255) ||| CTGGCACACCATCATCACCTTAAGCGGCCTGATGCTGCTGACCAAAGGTGTGGAGTTAAGCGGTTATTTTGATGTGCTGGGGCGCAAAATGGTGCGCCGCTTTGCTACGGAGCGTCGGCTGGCGATGTTTATGGTGCTGGCGGCGGCGCTGCTTTCTACCTTTCTGACCAACGATGTCGCGCTGTTTATTGTTGTTCCGCTGACTATCACGCTAAAAAGACTGTGTGAGATCCCGGTTAATCGGCTGATTATTTTTGAGGCGCTGG‑CAGTCAACGCTGGTAGCCTACTGACGCCAATTGGCAACCCGCAAAATATTCTTATCTGGGGACGTTCTGGTCTTAGCTTTGCCGGATTTATTGCCCAAATGGCACCGCTGGCTGGCGCAATGA‑TGCTGACGCTCCTGCTCCTGTGCTGGTGTTGTTTCCCTGGAAAGGCGATGCAATACCATACGGGGGTGCAAACACCGGAGTGGAAACCGCGGCTGGTGTGGAGTTGTCTGGGGCTGTATATCGTCTTTCTGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGCTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGC > CP042583/716663‑717232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |