Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 439,066 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 439,066 | 0 | A | T | 99.2% | 559.4 / NA | 239 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (139/97); minor base C (2/0); total (142/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 439,067 | 0 | G | C | 100.0% | 563.0 / NA | 239 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (142/97); total (142/97) | |||||||||||
* | CP042583 | 439,068 | 0 | C | G | 99.2% | 550.7 / NA | 239 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (140/96); total (142/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
AGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACAGCTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCAGCTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAAT > CP042583/438787‑439346 ||| aGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCttt > 1:1432313/1‑288 (MQ=255) aGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCAGTTCGCCTCGTTCttt > 1:94500/1‑288 (MQ=255) gCGGTATTCAGAAAGCAGATAACGGGGGGTTCCTGTTCCGGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑GTGGGCGGCACCGGCGGTGAGGG‑TATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGGGAAGGCGCG‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATGCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTg < 2:793521/288‑1 (MQ=255) gCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCTCCGTTCTTTGCGGTAGTGGTTAttt > 2:1047682/1‑288 (MQ=255) aGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGGCTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAGACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCGGGAGCCAGTAGTCACTACGGCGCTGATAGCTGGAACGTGCTGGATATTTTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCtg > 1:1887821/1‑289 (MQ=255) acgcagTGGCGTCCTGTTCCAGGTGGTGATAAAGGCAGTAGTTGCGGT‑CTCGGCGGCACCGGCCGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAACCGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGTGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCtgat < 2:145199/283‑1 (MQ=255) aaccGGTGGCTTCCTGTTACTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCtg < 1:719162/283‑1 (MQ=255) gtgagtaaTTCACGCGGTGGTT‑CGGTCCTGGCCGGAACCGGCGGTG‑GCGTCATCCGACTTTACGCAAAACGCCACCTCGTTTCCTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCATATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg < 2:871916/282‑1 (MQ=255) ggtggtGATTAAGCCGATAGTTGCGGT‑CTTGGGGGCACCGGCGGTGAGAG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGTGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGTTATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg < 2:1876349/289‑1 (MQ=255) ggtggtGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg > 1:1681782/1‑289 (MQ=255) gtggtgATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg < 2:514227/288‑1 (MQ=255) gtggtgATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg > 1:42296/1‑288 (MQ=255) gtggtgATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg < 2:453977/288‑1 (MQ=255) tgATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCgg > 1:1044982/1‑289 (MQ=255) gATTAACGGGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCAACGGCGGTGGGGG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCgg < 2:1824478/288‑1 (MQ=255) aTTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTTTTCTGTGGACAACTTTCTCCCCTAACGCGACCGGTa > 2:1840874/1‑289 (MQ=255) ttAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACGGGTTATTCTGCTGACAACTATCTCCACTAAGGCGACCGGTaa > 2:862025/1‑289 (MQ=255) tgcgtgcTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCTGCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGTGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTTATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGc < 1:1601763/282‑1 (MQ=255) cTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTAt > 1:1034623/1‑289 (MQ=255) ggcggcACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAg > 1:12856/1‑289 (MQ=255) ggcggcACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATGGTTCAGCGTTGTGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGAGGTACTGGTTATTCTGATTACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCTGCCGGtttttac > 2:802492/1‑284 (MQ=255) ggcACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGAtt < 1:1576343/289‑1 (MQ=255) cACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATccaattt > 2:160760/1‑282 (MQ=255) tccGGCGGTGAGCG‑ACTCCGACTTTGCGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCGGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTgc < 2:1402262/287‑1 (MQ=255) aTCCGACTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGCTCTTTGCGTTACTGGTTATTCTGCTGACAACTAACTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGACTGCCGCCATTTCACCGACa > 2:1410779/1‑289 (MQ=255) aCTTTACGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCACTTTCACCGACaaa > 2:697544/1‑286 (MQ=255) aCGCAAAACGCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGAcc < 2:388634/289‑1 (MQ=255) tttCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAAc < 2:1337368/279‑1 (MQ=255) tttCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAAc > 1:1337368/1‑279 (MQ=255) tttCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTGATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATCGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGa > 2:23534/1‑289 (MQ=255) tCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATaaaaa < 2:659222/276‑1 (MQ=255) cGTGGGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTAGATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATGGCCGTAGCGAGTATGCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCCTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCGCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAGCGGCTTACTGATTg < 1:959113/289‑1 (MQ=255) cGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGTCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTg < 2:1200070/289‑1 (MQ=255) cGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGAtt > 1:302625/1‑288 (MQ=255) cGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTg < 1:1325246/289‑1 (MQ=255) gggCAGGGGCT‑GGGGAAAAAGGTGGGTTTAGTTGGGGCCTATATTCTGGTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCa < 2:1639365/287‑1 (MQ=255) aGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAg > 1:1720382/1‑289 (MQ=255) ggCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTTCGGTACTGGTTATCCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATTTTATTCCAGCCTGTTACTAAATTGCCGCCATTGCACCCACCAACCTGCCCTTAAAAAACCGCGTATGTATTTCCAGaatt > 2:217098/1‑289 (MQ=255) ggCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGtatt > 1:1412335/1‑289 (MQ=255) gcgcT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGCTACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTACACTAACGCGACCGGACATATTATTCCAGCCGGTTTTCATATTTCCGCCATTGCAACGACAAATCTTACTGATAAAACCGGCGTCCTGATTGCCAGtttgt > 2:208107/1‑285 (MQ=255) gcT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGtattat < 1:276684/288‑1 (MQ=255) gcT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGtattat < 1:180173/288‑1 (MQ=255) gggggCAAGAGTTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTAGTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCa < 2:1770826/287‑1 (MQ=255) cgggCAAACTTTGGGTTTGGTTGTGGCTTGTATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTTGCTACGGCGCGGATACCTGGATCGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCATGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTATCGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGc < 2:1590176/288‑1 (MQ=255) gggTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTg > 1:335471/1‑288 (MQ=255) tggTTGTGGCTTTTATTCTGTTTGCGGTCTCCGGGGTATGTATTATTGCCGGTGCCTGTATGCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTGCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTg < 2:42296/287‑1 (MQ=255) gCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTTGAAATTaa > 1:1052901/1‑289 (MQ=255) gCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTaa > 1:992041/1‑289 (MQ=255) gCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTCCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCAGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGCGGAAATTaa > 1:1212505/1‑289 (MQ=255) tataTTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATgg < 2:57181/289‑1 (MQ=255) atatTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGa > 1:888639/1‑289 (MQ=255) tatTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGaa > 2:1820062/1‑289 (MQ=255) ttGCGGTCGCCGGGTTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGa < 1:686232/289‑1 (MQ=255) ttGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGa < 2:306469/289‑1 (MQ=255) ttGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGa < 2:727681/289‑1 (MQ=255) gtGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGa < 2:1720382/288‑1 (MQ=255) tGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGAc < 1:1644365/289‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACa > 1:551308/1‑289 (MQ=255) ggTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTTATCTTCCCGTGGAACTTAATGGAAAATCAGGaacgc > 2:49030/1‑285 (MQ=255) ggTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGATGGAAATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCCGTTCGCCTCCTTCTTTGCGGTACTGGTTAATCTGCTTACAACTATCCCCCCTCACGCGACCGGTAATCTTATTACAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCCTTGCAACGACAAACCTGACCTATAAAACCGACGTAATGATGACCAGTATCATCCACTTCCTTCTCGCACCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAg > 2:100723/1‑288 (MQ=255) tgtatTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTc > 2:1242967/1‑288 (MQ=255) attattGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCg < 1:400056/289‑1 (MQ=255) attGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACg > 1:1593603/1‑202 (MQ=255) tGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGAtatt > 2:1385521/1‑289 (MQ=255) tGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGAtatt > 1:1267604/1‑289 (MQ=255) ccGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAAcgcg < 1:669802/128‑1 (MQ=255) ccGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGAtatta > 2:134232/1‑288 (MQ=255) ccGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATGAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGAtatta > 1:523741/1‑288 (MQ=255) ggAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATcg > 1:1513677/1‑289 (MQ=255) ggAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATcg > 1:1129927/1‑289 (MQ=255) ggAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATcg > 2:946676/1‑289 (MQ=255) aTTCAATCCGGCGCTGATACCTGGAACGGGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGc < 2:1035260/289‑1 (MQ=255) ttCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCt < 2:369463/289‑1 (MQ=255) cACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGAAAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCAGCGTAATGCTTg > 2:155461/1‑289 (MQ=255) cTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGt < 2:888639/289‑1 (MQ=255) cGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCATGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCg > 2:19883/1‑289 (MQ=255) ggCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCATGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCgg > 1:856921/1‑289 (MQ=255) gcTGATACCTGGAACGGGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTaa < 1:349472/289‑1 (MQ=255) tGATACCTGGAACGTGCTGGGTATTGTTCAGCGTTGGGACCGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAAt < 1:768100/288‑1 (MQ=255) tGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAAtt < 1:208107/289‑1 (MQ=255) tGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAAt < 2:1129927/288‑1 (MQ=255) aTACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTATCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTgg > 1:1246791/1‑289 (MQ=255) gAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCatg > 1:917933/1‑289 (MQ=255) aaCGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCatga > 2:1094812/1‑289 (MQ=255) aCGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCatga < 1:1024276/288‑1 (MQ=255) cGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCatgatg > 1:967432/1‑289 (MQ=255) tGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCt > 2:1677657/1‑262 (MQ=255) tGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGgc > 2:704000/1‑289 (MQ=255) tGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGgc > 2:1045943/1‑289 (MQ=255) tGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGgc > 1:1909348/1‑289 (MQ=255) gCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATggtg > 1:502606/1‑287 (MQ=255) tGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCa < 2:1800721/289‑1 (MQ=255) aGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTgtggt > 1:1098759/1‑289 (MQ=255) cGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGa > 2:636988/1‑289 (MQ=255) cGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGa > 2:15228/1‑289 (MQ=255) cGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGa > 1:1436967/1‑289 (MQ=255) ttGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCa > 2:970914/1‑155 (MQ=255) gCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACa > 2:122143/1‑289 (MQ=255) gCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAACCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACa > 1:1083841/1‑289 (MQ=255) tGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAAt < 1:486167/289‑1 (MQ=255) ||| AGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGT‑CTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCG‑CATCCGACTTTACGCAAAACGCCCACAGCTTTCGTGAGCAGGCGCT‑GGGGCAAACGCTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGTCGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCAGCTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATATTATTCCAGCCGGTTATCAGATTGCCGCCATTGCACCGACAAAACTGACCTATAAAAACGGCGTACTGATTGCCAGTATTATCAGCTTGCTGATCTGCCCGTGGAAATTAATGGAAAATCAGGACAGCATTTATCTTTTCCTCGATATTATCGGCGGAATGCTTGGTCCGGTAATTGGTGTCATGATGGCGCATTATTTTGTGGTGATGCGCGGACAAAT > CP042583/438787‑439346 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |