Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 760,272 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 760,272 | 0 | A | T | 98.6% | 514.7 / NA | 223 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (109/109); minor base G (1/2); total (112/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 760,273 | 0 | G | C | 99.6% | 523.1 / NA | 223 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (111/110); total (112/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 760,274 | 0 | T | A | 98.2% | 516.7 / NA | 223 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (108/111); minor base C (4/0); total (112/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TAGTTCGTAGCCCCTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATAGCTTTAACAGCAGCAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGAGTACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGAAGTAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑AGCCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTAGTAGATTGCGGGAACTGGATCGCAGCATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTACGCTACCGAT > CP042583/759994‑760552 ||| tagttcggtcgcccTGGCTGATGGTTATTTTGCTGTGGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAAGGGTGAGGCTGGTTATCTATTCGTTGACAATCTCGAGGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGATGGTGAGCGGGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGGGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCtt < 2:1761678/278‑1 (MQ=255) tAGTTCGTTCGCCCTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCt < 1:1726341/288‑1 (MQ=255) aGTTCGTTCGCCCTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCtt < 2:838647/288‑1 (MQ=255) tcgttcgcccTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGcc < 2:1229327/282‑1 (MQ=255) ccTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTAGTGCGG‑CGGTGGTGCGGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGTATCAAATGGCTTTGCCTTTAttg > 2:1014501/1‑286 (MQ=255) cTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑AGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCCGGTTTCGCGGGTCAAATGGCGTTGCCTTTATg > 1:1761678/1‑286 (MQ=255) aTTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACcgcg < 2:1373701/288‑1 (MQ=255) tgtgATTTTGGTGCTGGGCTTTACCTTTCCCTACGCGCCAATGCTTATGCTGGTTATCTATTCGTTAAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGGGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGcgccg < 2:267963/289‑1 (MQ=255) ttGCTGCTTGGCTTTACCTTTCTCTCCGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCTTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTaa < 1:1066231/289‑1 (MQ=255) tgctgcTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCCATGCTGATGCTGGTTATCCATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCCGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGGCGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGAGCCGCGGAACGATTGCGGTCGGT‑TTGCTGGTTCGCTTTGGCAGTTTTCGCGGATCAAATGTCGTTGCCTTTTTGAT‑TCCCCGCCGTCTGGTaa > 2:946599/1‑288 (MQ=255) tgctgcTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGGTGGTGCCCTTTGGCCGGTTTGGCGGCACAAATGGCTTTGCCTTGTTGATCACCGcccccgcgggaat > 2:510943/1‑280 (MQ=255) ctgctgGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGCACTATTGCGG‑CGGTGGTGTTGGTTCGGTTTGGCAGGTTTTGCGGGTCAAATGGGTTTTGCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGc > 2:703364/1‑289 (MQ=255) ccTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCAc < 1:686737/289‑1 (MQ=255) ttCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTGTCCTTTATGATCCACGCGCCG‑CGGGTAATGCCAGATGTCATCCCgg > 2:355591/1‑288 (MQ=255) ctctACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCt > 2:260881/1‑238 (MQ=255) tACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTTTGATCACCGCGCCG‑CTGGGTATGCCAGATGGCCTCCAGGGCtttg > 2:523896/1‑287 (MQ=255) cgcgCCAATGCTGTTGTTGGTTATCTATTCGTTTAACGGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTgtcg < 2:1739455/289‑4 (MQ=255) cgcgCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGTCAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGGGCGCTTTGGCAGGTTTCTGGGAGCAAATGGCTTTTCCTTTATGTTCAACGACCCG‑CTGGTAGTGCCCGATGTCATCACggctttgtc > 2:1583154/1‑281 (MQ=255) cgcgCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGcc > 1:1297703/1‑238 (MQ=255) cgcgCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTgtcg < 1:642267/289‑4 (MQ=255) cgcgCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCGGGTTCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTGTGATCACCGCGCCG‑CCGGTCATTGCCGATGTCATCACGGGCTTgtc > 2:108936/1‑286 (MQ=255) aaTGCTGATGCTGGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGGGCGCTTTGGCAGGTTGCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCTCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCttctcgctggtg > 2:80092/1‑279 (MQ=255) tgGTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATtcg < 1:1362093/288‑1 (MQ=255) ggTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATtcgt > 1:1251211/1‑288 (MQ=255) gTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATtcgtc > 1:882643/1‑288 (MQ=255) gTTATCTATTCGTTTAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCC‑GTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTTCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTAGTATCACCGCGCCG‑CTGGGAATGCCAGAGTTCCTCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTTTttgtcg > 2:1178938/1‑288 (MQ=255) tctattcgtttAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGGGAGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGTCTTTATTATCACCGCTCCG‑CTTGTAATGCCAGATGTCCTCACGGGCGTG‑TTGCTGTTGTGATGCTtcgtctct > 2:1326302/9‑284 (MQ=255) tattcgtttAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACcg > 2:54995/7‑226 (MQ=255) ttcgtttAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCt < 1:178794/285‑1 (MQ=255) cgtttAACAGCTCGAAGCTGGCGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CAGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAACTGGCTTTGCCTTTATGCTCCACGCGCCC‑CTGGTAACGCCAGACGGTATCCCCGGCTTGTCGCTGGTTGTT‑TTATTTGTCGCTCtttgt > 2:1876010/3‑284 (MQ=255) ttAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCGTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CGGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTT‑CCGCTGTTGTTTTTATTCGTCGCgctcgctctgg > 2:903959/1‑285 (MQ=255) tAACAGCTCGAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTTTTCGTTCCGCTTTCTCCTGc > 2:627339/1‑288 (MQ=255) ctcgaaGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATtg > 1:1695100/5‑287 (MQ=255) ctcgaaGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATtg > 1:1556883/5‑287 (MQ=255) tcgaaGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATtggct < 1:402938/286‑1 (MQ=255) tcgaaGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATtggct < 1:355591/286‑1 (MQ=255) gagggTGGGGGCCGGCTGGTCAACGCGATGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGa < 2:1579315/285‑1 (MQ=255) gtgtGGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCC‑GTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACcgcg < 1:1178938/288‑1 (MQ=255) tgtgGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACcgcg < 1:1585988/288‑1 (MQ=255) tgtgGGCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCgg > 1:638759/1‑289 (MQ=255) gggCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTa < 1:108936/288‑1 (MQ=255) gggCCGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTAt > 1:78802/1‑289 (MQ=255) cGGCTGGTCAACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTc < 1:510943/289‑1 (MQ=255) ctggtcaaCGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTTGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCAcc > 1:196195/8‑289 (MQ=255) ctggtcaaCGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATTTCATAACGGGCGTG‑TCGCTGTTGTTATTTTTTGTCCCGCTTCCGTATTCCATTGGCTGGCCTTCGGACCGCTGTGTGcctcc > 2:873357/8‑284 (MQ=255) ctggtcaaCGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATtggct > 2:723261/8‑263 (MQ=255) ctggtcaaCGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCAc > 1:1289436/8‑288 (MQ=255) ctggtcaaCGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCCGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCCTTGGCTGGCCTGCGGCCCGCGGTTTGccccc > 2:393017/8‑284 (MQ=255) tcaaCGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCTTGCCATTGTGTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCCCTCCAt > 2:749459/4‑287 (MQ=255) aGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGCGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATtggct < 1:321730/240‑1 (MQ=255) ttATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCCTGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGTCGGCGCATGTCACttttt > 1:1491226/1‑289 (MQ=255) ttATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCCTTTGCTTGCCTGCGGACCTCGGTCTGCTCCCCCTCTGTCTGGCGCCTGTCCCttttt > 2:1169592/1‑289 (MQ=255) ttATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGAGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACttttt > 1:565498/1‑289 (MQ=255) tatggcaggagaacgggatgaGGGGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCGGGGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTg < 2:1556883/277‑1 (MQ=255) tATTGCGCGATGCCGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTg < 1:238100/289‑1 (MQ=255) aTTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGt < 1:546743/289‑1 (MQ=255) aTTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGt < 1:738642/289‑1 (MQ=255) ttGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCCCGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTTCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCCCGGTATGCTCACCCTCTTGCTGGCCTCTGTCCCttttttt > 2:1429683/1‑286 (MQ=255) tGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTAc < 1:853209/289‑1 (MQ=255) tGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTAc < 1:957537/289‑1 (MQ=255) gcgcGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATTTGGCGGGCGCCTGTCACTTTTTGTTCg > 2:1142715/1‑289 (MQ=255) gcgcGATGACGCGATGAGGAGTTGGGTTGGTTTAAGTCTGGCGATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTAc < 2:888439/288‑1 (MQ=255) atgatgCGTGCGGTTGGTTTACGTCTGGCAAGTGCGGCCTGTGCGGCGACGGGGGCGGCGATCCTCGGAGCTATTGCGG‑CGGTGGGGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCg < 2:1402662/288‑1 (MQ=255) tgatgaGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGt < 2:426338/289‑1 (MQ=255) aGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTa > 1:1680130/1‑289 (MQ=255) ttggttTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGTCCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCCTATTTGGCGTGCGTTATTTCt > 2:1100387/1‑287 (MQ=255) gttTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGTCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCTCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCTGACCGCGGTATGCTCCCCCTCTTGCCTGCGCATGGCACTTTTTTTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTTTTTCttctag > 2:169288/1‑284 (MQ=255) ttACGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCTCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCCTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATTACGGGCTTG‑TCGCCGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCCCATTCCATTGTCTTGCCTGCCGACCCCGGTATGCTCCCCTTCTCGCTGGCTCCGCGCCCTTTTTGTCCCGCCTTTGTGGCGGTCGTTTTTGCttcaagat > 2:1831473/1‑282 (MQ=255) ttAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCtttcagat > 1:925473/1‑282 (MQ=255) aggcTGACAATTGCGGCCGGGGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGc < 2:638759/286‑1 (MQ=255) aGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGc < 1:1169592/289‑1 (MQ=255) aGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGc < 1:1229776/289‑1 (MQ=255) gTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGc < 2:1294671/288‑1 (MQ=255) aCAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTgtcgct > 1:1792701/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTTGCGGTCGTTATTTCCTCAAGATTTCGGGAACTGGa > 2:1390422/1‑288 (MQ=255) gCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATTTGGCGGTCGTTATTTCTTTAAGAGTGCGGGAAGTGGATc > 1:44736/1‑289 (MQ=255) ccTGGGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCgct < 1:1266884/288‑2 (MQ=255) tgtgCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCgcttga > 1:773092/1‑285 (MQ=255) tgCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCgctcgata > 1:288642/1‑283 (MQ=255) gcgggggcggCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCTCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAgaagaa < 2:701372/287‑1 (MQ=255) cggcggcggCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGaagaag < 1:1014501/288‑1 (MQ=255) gcggcggcgATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGa > 1:296702/1‑179 (MQ=255) gcggcggcgATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGa < 2:296702/179‑1 (MQ=255) gcggcggcgATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTAt > 1:107826/1‑245 (MQ=255) gcggcggcgATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCgct > 2:1264968/1‑273 (MQ=255) gcggcggcgATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCGTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAagca > 1:379317/1‑288 (MQ=255) aTCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGa > 1:1197481/1‑260 (MQ=255) tATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGGAGCGATTGATCTCGGTGGGAc > 1:1809662/1‑288 (MQ=255) ggtgggcgtggtgcGGTTTAGCAGGTTTGCCGGCTAAAATGGCGTTTCCTTTATGATCACCGCGCCT‑GTGTTAATGCCAGATGTGTTCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTAGCTCATGCCATTGGCTGGCCTTCGGACCGCGGTATGCTGACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTGGGTGCGACGCCGCTGaaa < 2:957900/281‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAg > 1:1395198/1‑289 (MQ=255) ggtgctggtgcGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCGCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGGTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTTCGAGTCCGCTGAAAggg > 1:411585/1‑287 (MQ=255) ctggtgcGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGTATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGTTAGAAGAAGCAGCGATTGAACTCGGTGCAATGCCCCTGCAAGTGgttt > 2:210639/1‑289 (MQ=255) gtgcGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGAGGCCGTCGAAAGTGTTTTTCg > 2:570708/1‑289 (MQ=255) tgcGCTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCCTGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTCTTTCTTCAAGATTGCGGGAACTTGATCGCTCGATAGAAGAAGCAACGATGGAACTCGGTGCGACGCACGAGAAAGAGTTTTTCg > 2:1613351/1‑288 (MQ=255) gcgcTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATTGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTc > 1:1052626/1‑289 (MQ=255) gcgcTTTGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTc > 1:1865737/1‑289 (MQ=255) tttGGCAGGTTTGGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTa < 1:1413521/289‑1 (MQ=255) ttGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTAc < 2:441191/289‑1 (MQ=255) tGGCAGGTTTCGCGGATCAGATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTACg < 1:795241/289‑1 (MQ=255) tGGCAGGTTTCGCGGATCAAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑TCGCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTTCAAGATTGCGGGAACTGGATCGCTCGATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTACg < 1:1622095/289‑1 (MQ=255) ||| TAGTTCGTAGCCCCTGGCGGATTGTGATTTTGCTGCTGGGCTTTACCTTTCTCTACGCGCCAATGCTGATGCTGGTTATCTATAGCTTTAACAGCAGCAAGCTGGTGACGGTGTGGGCCGGCTGGAGTACGCGCTGGTATGGTGAGTTATTGCGCGATGACGCGATGATGAGTGCGGTTGGTTTAAGTCTGACAATTGCGGCCTGTGCGGCGACGGCGGCGGCGATCCTCGGAACTATTGCGG‑CGGTGGTGCTGGTGCGCTTTGGCAGGTTTCGCGGAAGTAATGGCTTTGCCTTTATGATCACCGCGCCG‑CTGGTAATGCCAGATGTCATCACGGGCTTG‑AGCCTGTTGTTATTATTCGTCGCGCTTGCTCATGCCATTGGCTGGCCTGCGGACCGCGGTATGCTCACCATCTGGCTGGCGCATGTCACTTTTTGTACGGCTTATGTGGCGGTCGTTATTTCTAGTAGATTGCGGGAACTGGATCGCAGCATAGAAGAAGCAGCGATGGATCTCGGTGCGACGCCGCTGAAAGTGTTTTTCGTCATTACGCTACCGAT > CP042583/759994‑760552 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |