Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 809,845 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 809,845 | 0 | A | T | 99.5% | 444.7 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 809,847 | 0 | C | G | 100.0% | 443.6 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (111/77); total (111/77) |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TGCGTGTTCAGGTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGAGTTTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTAAGCTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATG > CP042583/809567‑810125 ||| tgggggttcggtttttttTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGTCATTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTa < 2:302811/275‑1 (MQ=255) 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tCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGAt < 1:649035/289‑1 (MQ=255) tCATGATCGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGAt < 1:1035459/289‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTATCGTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTa < 2:630132/289‑1 (MQ=255) ||| TGCGTGTTCAGGTCTTTGTCGTCATTCTCGGCAGTATCGCGATGCTTAGCCAGGCGGCGATGGCCCCAGCGTTATTCATCCTCGGTGCCGCTGGCTTTACGCTATATCCGGTGGCGATGGCATGGGCTTGCGAGAAAGTTGAACATCATCAACTGGTGGCGATGAACCAGGCCTTACTGTTGAGCTATACTGTGGGAAGTCTGCTTGGCCCGAGTTTTACCGCTATGCTAATGCAGAATTTCTCCGATAATTTATTGTTTATCATGATCGCCAGCGTAAGCTTTATCTATTTGCTGATGCTGCTGCGCAACGCCGGTCATACGCCGAAACCCGTTGCTCACGTGTAAATGAATTCAAGCAGAGTGTGAACTTACTGTTTCACACTCTGCTTTTTTGTTTCTTCTATCTGACTTGCTTTATTCCAAATTTTATTCGTTTAAAAATAAAATGTGCAGCAGGTTATAATTTTGCATTTCGCTATTTCCGCACTTCTTATTTGCCGCGCATAATCCCTCGTTTTACCGATGCCCCTTTAATTTTGGCGAAGGATTTGTCTATG > CP042583/809567‑810125 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |