Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 897,976 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 897,976 | 0 | A | T | 99.5% | 475.2 / NA | 200 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (93/106); minor base C (1/0); total (94/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 897,977 | 0 | G | C | 98.0% | 464.6 / NA | 200 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (94/102); minor base A (0/4); total (94/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 897,978 | 0 | T | A | 100.0% | 473.5 / NA | 200 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (94/106); total (94/106) |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
ACCTGCAACCTGGCCGACAGAGTGCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTAGTACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGA > CP042583/897711‑898252 ||| gCCGACAGAGTGCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTTCCTCGCCTGTCCACCACACGTGCTGGGGGGCGACGGTGGCGAGCTg > 2:126871/1‑289 (MQ=255) ccGACAGAGTGCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGa > 2:318310/1‑289 (MQ=255) agagTGCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGAtctc > 2:952834/1‑288 (MQ=255) gTGCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGAtct < 1:1711421/284‑1 (MQ=255) gCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCa < 1:900795/289‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCa < 1:791065/288‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCa < 1:597141/288‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCa < 1:1617936/288‑1 (MQ=255) tggtgTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGt > 1:1482246/1‑288 (MQ=255) tCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTa > 1:1135998/1‑289 (MQ=255) tttACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTCGCGAGCTGAACCCCGTTCAGGTGCGTTAACAGc > 2:1291804/1‑289 (MQ=255) ttACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCg < 1:1413560/289‑1 (MQ=255) aCCGAAGGGACGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCAAGCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGaa < 1:1490789/289‑1 (MQ=255) acgccggggggAGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGGGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAat < 2:1561651/281‑1 (MQ=255) cgcgcgGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTG‑‑GATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAAtcatca < 1:1592331/289‑1 (MQ=255) gcgGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCGGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAAtcatca < 2:1203704/288‑1 (MQ=255) ccgccATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACg < 1:318310/288‑1 (MQ=255) cATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTc < 2:904151/289‑1 (MQ=255) tGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTa < 1:884933/288‑1 (MQ=255) aaGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTc < 2:809563/288‑1 (MQ=255) aTTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTg > 1:1081450/1‑289 (MQ=255) ctctACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAgcgc < 1:1623946/289‑1 (MQ=255) cgctACCAGTGCGTGGTGCCGACAACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAgcgc < 1:1009430/287‑1 (MQ=255) tACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGGGCCTTAACAGCTGAGGTGAATCATCATGCAACAC‑AAAAGCGACAACGTTTCCAGCCACTATGCTCTTGAAgcgcacg > 2:1394055/1‑286 (MQ=255) ccggTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTg < 2:182548/286‑1 (MQ=255) cAGGGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTgc < 1:1578513/289‑1 (MQ=255) gTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAgg < 1:420410/206‑1 (MQ=255) tGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCa > 1:1510054/1‑289 (MQ=255) tGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGGAGCGAGCTGATCCCCGTTCAGGTGCGTTAACGGCGAAGGGGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACATCGTCAGCCCATATGTCTTTGACGCGACAGTGCGCa > 2:817246/1‑289 (MQ=255) tGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATACCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGACCTGCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCACCATGCAACAGAAAAACCGAC‑ACTGTGTCAGCCACTACGACGTTGAAGCGCCAggcgcc > 2:346285/1‑283 (MQ=255) gCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGc > 1:1341504/1‑234 (MQ=255) gCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGc < 2:1341504/234‑1 (MQ=255) cGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTTAAGCGCCAGTGCGCa > 1:814886/1‑287 (MQ=255) cGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCa > 1:835576/1‑287 (MQ=255) tggtgCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGa > 2:1625048/1‑215 (MQ=255) tggtgCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGa < 1:1625048/215‑1 (MQ=255) tggtgCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTg > 2:66545/1‑289 (MQ=255) gtgCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTgg < 1:952834/288‑1 (MQ=255) gCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGCATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCa > 2:1198702/1‑288 (MQ=255) gCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCa < 1:126871/288‑1 (MQ=255) caccTGTAGCACCGGCCCGCGC‑ATCACAAAGTGAAGAATGGCACTTAGGAAGCTGAGCTTGTGAGCACCAAAATGGCGATCCCCGGGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTATGACCCGTGCCTCGCTTGTTAAACGCACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAACGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGa < 2:1504723/289‑1 (MQ=255) gccggtagcgcccgccCGCGCGATCCCAAGGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGGGGCGCTGATGAACACCAAAAGGGCGATCCCCGAGAAACGGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGAACAGCTTTGGCCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGa < 2:1100924/281‑1 (MQ=255) accTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGa < 2:1482246/289‑1 (MQ=255) accTGGAACGCCAAGCCGCGCGATCGCAAAGGGCAGATGGGCGCTGATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGa < 2:1529226/289‑1 (MQ=255) acatGGAACGCCAGCCCGCGCGAGCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTGATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGa < 2:1361045/286‑1 (MQ=255) cgggacagcaggCCCGCGCGAGCCGAAAGGGCAGATTGGCGCTTATTAAGGAGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCGGGAGATCATGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACg < 2:45230/278‑1 (MQ=255) cTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACg < 1:1889631/289‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCCCGCGCGATCCCACAGGGCAGATTGGCGCTTATGACGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGgtg < 2:406249/288‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCa > 1:1672210/1‑289 (MQ=255) cgggcgATCCCAAAGGGTAGATTGGCGATTCTGCAGCGGCGCGGATGAACGACAAAGTGGCGTTCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTAGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGc < 2:792247/286‑1 (MQ=255) cgggagagcacAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCACAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGc < 2:579438/279‑1 (MQ=255) cgcgcgATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGc < 1:365704/289‑1 (MQ=255) aaGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTTCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGACGCGCCATAGCGCATCTGGCATTGGTTGACGGTGTTATGCAGTGCGGTCTTGATgg > 2:1872425/1‑288 (MQ=255) aaGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGt < 1:1801751/289‑1 (MQ=255) cAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACTCCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCg > 1:1101801/1‑289 (MQ=255) cAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCg > 1:973870/1‑289 (MQ=255) cAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCg > 2:876370/1‑289 (MQ=255) cAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCCCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTACCCAGCTGACCTCCGTGCACGTCCGTTAACAGCGACGGAGAATCCCCACGCCACAG‑AACAGCGCCAACGCTGTCACCCCCCACGTCTTTGACCCGCCCGTCCGCATCTGGCACTGGTTCCCCGCGTCATGCCTGGCggcgctcccccgcacc > 2:1147298/1‑274 (MQ=255) cAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGATTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGCCGACGGTACCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTTTGTTAACAGCGAAGCAGAATCCTCCTGCACCAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACGATGTCTTCGACGCAGCAGTGGGCATGTGGCACCGGTTGACGGTGTTATGCATTGTCGCTTTGATGGTGACCg > 2:12987/1‑289 (MQ=255) ttGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGa < 1:620001/287‑1 (MQ=255) cgcTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCCCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACCG‑CAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTCAAGCGCCAGTTCGCATCTGGCACTGGGTGCCGGTTTTTTGCATCGGGGTGTCGGATGTCTCCGGATACttt > 2:1782498/1‑289 (MQ=255) aGCGGCGCGGATGAGCACCAACATGGCGCTCCCCGAGCAACCGCTGGACATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCGGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAg < 2:125157/289‑1 (MQ=255) cggcgCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGcc > 1:469455/1‑289 (MQ=255) ggacccgatgaAACCCAAGATGGCCATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAAAAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCAGCAAGCCg < 1:1655126/283‑1 (MQ=255) gcgcTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCa < 2:176607/134‑1 (MQ=255) gcTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGCGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCt > 1:1120081/1‑288 (MQ=255) cTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGAt > 2:1544406/1‑257 (MQ=255) cacCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGAGGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTc > 1:913229/1‑289 (MQ=255) cacCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCGGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTc < 1:177607/289‑1 (MQ=255) cAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGgtg > 1:1296177/1‑226 (MQ=255) cAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAgc > 2:1510272/1‑289 (MQ=255) aaaTGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAgcg > 1:1559751/1‑288 (MQ=255) ggCGAGCCCCGAGCAACCGCTGGGGTTCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcga < 2:629030/288‑1 (MQ=255) cgtaTCCCCGAGCAACCGCTGGGTAGCCGCGGTACTCTGCCCGTCTTTGACGCTAGCCGAGCTGGTTAAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGGGAGCTGTTCTCCTTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTAGTTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcgag < 2:498924/285‑1 (MQ=255) cGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcgagg < 1:138900/288‑1 (MQ=255) tacccccggCACCCGCTGGGGATCCTGGGTACCAGGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGGGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACACCGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcgaggcga < 2:1758743/281‑1 (MQ=255) aTCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcgaggcg > 2:480919/1‑288 (MQ=255) tCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTACCAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcgaggcga < 1:295247/288‑1 (MQ=255) tCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCggcgaggcga < 1:66545/288‑1 (MQ=255) cgggCAACCGCTGGAGTTCCTGCGTACTATGCACAGCGTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGGGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt < 2:717647/286‑1 (MQ=255) cGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt < 1:543926/289‑1 (MQ=255) cGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt < 1:720545/289‑1 (MQ=255) cGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGGGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt < 1:1640576/289‑1 (MQ=255) ccGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTaa < 1:818733/108‑1 (MQ=255) ccGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTaa > 2:818733/1‑108 (MQ=255) gCTGGAGATCCGGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACGGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCtat < 1:1710443/289‑1 (MQ=255) gaTCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATggg < 1:1542708/288‑1 (MQ=255) ccTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt < 2:1643421/271‑1 (MQ=255) tGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGCGGCGACGGATCGGTTCTCTATGGGCGACAGCCGGTTAAt > 2:191961/1‑289 (MQ=255) tGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAAt > 1:1250621/1‑289 (MQ=255) tGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCCGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt < 1:1685075/260‑1 (MQ=255) tGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCCGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTAt > 2:1685075/1‑260 (MQ=255) gCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTg < 2:548989/73‑1 (MQ=255) cacaGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGCCGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTc > 1:1645263/1‑289 (MQ=255) tGACCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATTGGCTACATCAGGTTACTTCACTTCAg > 1:90789/1‑288 (MQ=255) aCCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAgcg > 1:55215/1‑288 (MQ=255) aCCCGTGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAgcg > 1:10448/1‑288 (MQ=255) cccGTGCCCCGCCTGTTCACCCCACGGGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATAATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGAATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAgcgc < 1:346285/288‑1 (MQ=255) tGCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTATCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGa > 1:10390/1‑289 (MQ=255) gCCTCGCCTGTTCAACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGa < 2:973870/288‑1 (MQ=255) ||| ACCTGCAACCTGGCCGACAGAGTGCCGTGGTGTCGGTTTTACCGAAGCGCCGCGCGGGGCGTTAGGCCACTGGGCCGCCATTCGCGATGGCAAGATTGATCTCTACCAGTGCGTGGTGCCGACCACCTGGAACGCCAGCCCGCGCGATCCCAAAGGGCAGATTGGCGCTTATGAAGCGGCGCTGATGAACACCAAAATGGCGATCCCCGAGCAACCGCTGGAGATCCTGCGTACTCTGCACAGCTTTGACCCGTGCCTCGCCTGTAGTACACACGTGCTGGGCGACGACGGTAGCGAGCTGATCTCCGTGCAGGTGCGTTAACAGCGAAGGAGAATCATCATGCAACAG‑AAAAGCGACAACGTTGTCAGCCACTATGTCTTTGAAGCGCCAGTGCGCATCTGGCACTGGTTGACGGTGTTATGCATGGCGGTGTTGATGGTCACCGGATACTTTATCGGCAAGCCGCTACCTTCCGTCAGCGGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGA > CP042583/897711‑898252 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |