Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 906,389 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 906,389 | 0 | A | T | 99.6% | 671.0 / NA | 279 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
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* | CP042583 | 906,390 | 0 | G | C | 100.0% | 665.1 / NA | 279 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (127/152); total (127/152) | |||||||||||
* | CP042583 | 906,391 | 0 | T | A | 100.0% | 673.5 / NA | 279 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (127/152); total (127/152) |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
ATTCCGCACGCTGAACGAAAATCAGAAAGTTGAATTTTCTATTGAGCAGGGGCAACGTGGCCCCGCGGCAGCGAACGTTGTTACGCTCTAAGGTTGCCATTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGTCATGGTTCACAGTACCGCACATCGGCATTCGATGTGACGGAGCGAAACCCTTTGGGCGCTAAGTGTATTTTTTGTAAATCGACGATGATCACCTTTGATAACGTCGCGCTGCAAATACGCACTGACCATGCGCCGCTGGATTAGTCAAAATAATATCAGGCTCCCTCGTGGAGCCTTTTTTATATCTGCCTTATTTTTCTTCAACGCTGTATGTATAGTAAGCGATAACCTGTTGATTATTGAATCTTTCGGGGAGATGGCTTATAACATTTCTTACCTGACCAGGGTACCGGGAACCAACACCTTACTGGCGTGTTGCTGTCTTTTAAGACCAGAAGAGGTTAACAGTGAATATTGAAGAGTTAAAAAAACAAGCCGAAACGGAAATCGCCGACTTTATCGCGCAAAAAATCGCCGAGCTGA > CP042583/906110‑906669 ||| aTTCCGCACGCTGAACGAAAATCAGAAAGTTGAATTTTCTATTGAGCAGGGGCAACGTGGCCCCGCGGCAGCGAACGTTGTTACGCTCTAAGGTTGCCATTATTACTCAACATCTCCATTTCCGCTGTCCATGTTGTCATGGTTCACAGTACCGCACATCGGCATTCGATGTGACGGAGCGAAACCCTTTGGGCGCTAAGTGTATTTTTTGTAAATCGACGATGATCACCTTTGATAACGTCGCGCTGCAAATACGCACTGACCATGCGCCGCTGGATTTCACAAaata < 2:948158/289‑1 (MQ=255) 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