Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 479,339 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 479,339 | 0 | A | T | 98.5% | 476.5 / NA | 203 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (108/92); minor base G (1/2); total (109/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 479,340 | 0 | G | C | 99.0% | 458.9 / NA | 203 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (107/92); total (109/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 479,341 | 0 | C | G | 99.5% | 481.3 / NA | 203 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (109/93); minor base T (0/1); total (109/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.63e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GAAGTGATCGCCGCCGTGAAGGACAAACTGGAAACGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCAGCGCGCTGGTGGCGATTATTAGCTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGAGCTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGAGC‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCAAAACGTATGCG > CP042583/479060‑479620 ||| aTCGCCGCCGTGAAGGACAAACTGGAAACGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCAtt > 1:1423361/1‑288 (MQ=255) tGGAAACGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGt < 1:181674/289‑1 (MQ=255) tGGAAACGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGt < 1:1308307/289‑1 (MQ=255) aaaCGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGTTGGCATTGCGTTTGGCGTCGGGGCGATGGTCGa > 2:723148/1‑289 (MQ=255) aaaCGCGGAAAGGTAGTCTGCCGGAAGGGGTGGGGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCCTTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGa < 2:653856/289‑1 (MQ=255) aaCGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGa < 1:844011/288‑1 (MQ=255) aaCGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGAGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGa < 2:220354/288‑1 (MQ=255) aCGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAtg < 2:787154/289‑1 (MQ=255) aCGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAtg < 1:1301711/289‑1 (MQ=255) ccGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCg > 1:1245148/1‑289 (MQ=255) aGGCGTGGAGATAGTTAAAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGTACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGaa < 1:527203/288‑1 (MQ=255) agaTAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATa < 1:1321990/288‑1 (MQ=255) gaTAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATaa < 1:723148/288‑1 (MQ=255) gaTAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATaa < 2:4628/288‑1 (MQ=255) aGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACg > 1:1364383/1‑288 (MQ=255) tACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGGTATGATCGAGCATGCGCCTAAACGGCTg > 2:892823/1‑289 (MQ=255) caacaTACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTAGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCGGCTATCGTCATTATCGAGAATGGGCATAAACGGCTGGa > 1:1116429/1‑289 (MQ=255) caTACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAaga > 1:228156/1‑289 (MQ=255) tACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGGTGATGCTGCTATCGTCATGTTCGAGAATGTGGAAAAAccggtctttttta > 2:712719/1‑277 (MQ=255) gATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGgc < 1:1610435/289‑1 (MQ=255) cGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGgcagc > 1:1286193/1‑289 (MQ=255) cagccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCCAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTTCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGACTGCGCATAAACGGCTGGAAGAGGGgcatca > 2:432479/1‑288 (MQ=255) ggccggcgaaTTGACCGCGCCATCGAGAACCGCGGGGGCAAGTTGCTGGGAGAGTTGATTGGGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATGATTTCGTTACGGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCAGGCTCTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCAc < 2:680407/279‑1 (MQ=255) gccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCg > 2:1870148/1‑224 (MQ=255) gccagcTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCg < 1:1870148/224‑1 (MQ=255) cagtTCATGGACCGCGCCGTCGACAACCTCGTCGGCAAGTTGCTGGAAGGGTTTATTGTGGTGGGGGTA‑GTCTGTGCGCGGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCa < 2:1245148/287‑1 (MQ=255) cTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGACGAGATTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACCTAATGCCTATATTATGTTGTTGGGTGGCCTTGAGATTGACGTCGGAGCGATGGTCGATGTCTCTATCGTCATGACCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGAGgcgcaaccatgta > 2:1591172/1‑277 (MQ=255) cTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCAt > 1:1254103/1‑288 (MQ=255) cTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGAGCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCAt > 2:188781/1‑288 (MQ=255) cgcgCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGcc > 1:932688/1‑288 (MQ=255) cgcgCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGACATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCa < 1:1109709/289‑1 (MQ=255) gcgcCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCAc > 1:858381/1‑289 (MQ=255) gcCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTTCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTTCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGTGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCCATTGTCCTGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGGGTGGCAGCACGCGCATGCTGCCGCCACg > 2:954009/1‑288 (MQ=255) gcCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACg < 1:400603/288‑1 (MQ=255) cATCGACGACCTCGGCGGGAAGTTGCTGGAAGAGTTTAGTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCt < 2:1144268/288‑1 (MQ=255) tCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGCTGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCCCCACAAGCCTTACGACACTCTg > 2:1364795/1‑287 (MQ=255) tCAGCGTCAAGTTGCTGGGAGAGTTTGTTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCGCGGCGCTGGTGGCTATTATTTCGTTGCCGCTGGTGTTGTGTAGTGCTTTTATCGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCAAATATGATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGAGGCTGCTATCGTCATGGTCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACAAGCATCCGGACGCCACGCTGGATAATAAAAc < 2:292482/289‑1 (MQ=255) gCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAAcgc > 1:798796/1‑288 (MQ=255) aaGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGTGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTgg < 2:547866/288‑1 (MQ=255) gTTTATGGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGa < 1:1409652/288‑1 (MQ=255) tttATGGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGTGCTTTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGAt < 1:1206118/288‑1 (MQ=255) tgtttgggtgggCGGTAGGTCT‑TGCGCTGTTTCTCTGGCCTGTGCGCTTGGCGGTGGGGGCGTTTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCAAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGTTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGc < 2:660257/279‑1 (MQ=255) gtggtgGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTg < 2:1254103/289‑1 (MQ=255) tgtgCGCTTTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCgg < 1:1592540/289‑1 (MQ=255) tgtgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCgg < 1:892823/289‑1 (MQ=255) tgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGACGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCCCTGGCAGGTGATCACCGCGGCGTCTGTTGCCGTGGGGCTGgcg > 2:1117386/1‑289 (MQ=255) tgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACg > 2:1497116/1‑229 (MQ=255) tgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACg < 1:1497116/229‑1 (MQ=255) tgCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACCCCACGCTGGATAATAAAACGAGCTGGAAGGTGATCACCGAATCGGCTGTTGAAGTGGGGCCGgc > 2:213398/1‑288 (MQ=255) tgCGCTGTTTATCTGGCAAATGCGCTCGGCGCTGGTGGAGATTATATCGTTGCCGCTTGCGTTGTGCATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATCTTGTCGTTGGGTGGCAGTGCGATTGCCGTCGCGGCGTAGGTCGATGCTTCTATCGTCATGACCGAGAATGCGCATAATCTGCTGGAAGCGTGTCAGCACCAGCATGCCTACGCACCTCGGGCTACTAAACAGCGATCGCAGGTTAACTACGATGGACCTGTTGAAGTGTGGcgcggc > 2:1280124/1‑284 (MQ=255) gcgcTGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGgcg < 2:896054/288‑1 (MQ=255) gcggTTGCTCGGGCGTGTGCGTGCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTTCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCAGGCGCTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTTTTGAAGTGGGGCCGGCGCt < 2:1686433/285‑1 (MQ=255) tGTTTCTCTGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGTTAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGGTGGGTCGGTTGGAGTGGggcgggcgggtgt > 2:37551/1‑284 (MQ=255) ctctGGGATGTGGGCTCGGCGGTGGTGGAGTTTATTTCGTTGCCGCTGGGGTGGTGTATTGCTTTTATTGTCATGGACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGAGTGCCGTGGGGGCGATGGTGGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCa < 2:1202767/289‑1 (MQ=255) ctctGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCa > 1:265356/1‑289 (MQ=255) ctGGCATGTGCGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGTCGCGCCTGTTGAAGTGGGACCGGCGCTCTTTATCAg > 2:1537724/1‑288 (MQ=255) ctGGCAGGTGGGCTCGGCGCTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGt < 1:482373/289‑1 (MQ=255) tgcgctcggcgcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATaa > 2:857321/9‑169 (MQ=255) tgcgctcggcgcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGAt > 1:707462/9‑289 (MQ=255) tgcgctcggcgcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCACTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGACGGCGCCATTTATCGGTCTGTTGAt > 2:1903433/9‑289 (MQ=255) tcggcgcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATc < 2:424217/285‑1 (MQ=255) cgcTGGTGGCGATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGtt > 1:1664005/1‑289 (MQ=255) gATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGc > 2:773370/1‑212 (MQ=255) gATTATTTCGTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGc < 1:773370/212‑1 (MQ=255) cgttGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCtt < 1:1148440/287‑1 (MQ=255) cgttGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCtt < 2:1700381/287‑1 (MQ=255) tGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGa < 2:1664005/289‑1 (MQ=255) tGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGa < 1:1709963/289‑1 (MQ=255) tgtgTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGc < 1:611905/288‑1 (MQ=255) gtgtATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAg > 1:1017069/1‑289 (MQ=255) gtgtATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATCCGTCTGTTGACGTGGTGCCGGCGCTATTCATCAGTCTGCTGATAATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACTCTGGactgccag > 2:1824332/1‑282 (MQ=255) tgtATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAgg > 2:824508/1‑289 (MQ=255) ttGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGACGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCCCGTTTGCG‑GTTATCCCGATCTTCACCCTGGACGGGCCGGAAgg > 2:1188006/1‑289 (MQ=255) ttGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGc < 2:1310251/216‑1 (MQ=255) ttGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAgg > 2:273268/1‑289 (MQ=255) ttATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGgcg > 1:967599/1‑215 (MQ=255) ttATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCg > 2:1614320/1‑286 (MQ=255) aTTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGt > 2:1524913/1‑289 (MQ=255) gTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTg < 1:273268/289‑1 (MQ=255) cATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTgg > 1:661259/1‑263 (MQ=255) cATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTgg > 1:640981/1‑288 (MQ=255) cATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGGCTGGTTgg > 2:250333/1‑288 (MQ=255) cATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTAACCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGCAGGGAGTCTTGTTgg > 2:1768647/1‑288 (MQ=255) aTGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGa > 1:1888599/1‑182 (MQ=255) tGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCgg > 2:1565636/1‑204 (MQ=255) tGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCgg < 1:1565636/204‑1 (MQ=255) ttCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTg > 1:169515/1‑288 (MQ=255) ccAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATccc > 1:1293121/1‑240 (MQ=255) ccAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATccc < 2:1293121/240‑1 (MQ=255) ccAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCg > 1:354729/1‑289 (MQ=255) cAGGGACTGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGt < 2:1423361/289‑1 (MQ=255) tGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCaa > 1:594055/1‑289 (MQ=255) tGAATGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAAAGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGCTCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCTGCGACATTTATCAGTCTGCTGATTATCCCGGTGGTG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGGAGGGTGGTGGTTTGTCCCGTTGGAGTTctctaa > 2:1358501/1‑284 (MQ=255) aaTGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAATTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGGTTGGCCCGTTGGCGGTCCCCaaa > 1:831380/1‑288 (MQ=255) aaTGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCaaa > 1:1652194/1‑288 (MQ=255) aaTGCCAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGCCTGCTGATTATCACG‑TGTGCGTTTATCCGTATCTTCACCCTGGAAGGGTAGGAAGGGGGTCTGTTTGGCCCGTTGTCGTTCCCCaaaa > 2:72977/1‑289 (MQ=255) cAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCAAAACGTAt < 1:1524913/289‑1 (MQ=255) cAATATTATGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCAAAACGTAt < 1:1728257/289‑1 (MQ=255) tattatGTCGTTGGGTTGCATTGCGGTTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCAAAACGTATGCg < 1:432479/289‑1 (MQ=255) tattatGTCGTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGTCG‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCAAAACGTATGCg < 1:164615/289‑1 (MQ=255) ||| GAAGTGATCGCCGCCGTGAAGGACAAACTGGAAACGCTGAAAAGTAGTCTGCCGGAAGGCGTGGAGATAGTTACAACATACGATCGCAGCCAGCTCATTGACCGCGCCATCGACAACCTCAGCGGCAAGTTGCTGGAAGAGTTTATTGTGGTGGCGGTA‑GTCTGTGCGCTGTTTCTCTGGCATGTGCGCAGCGCGCTGGTGGCGATTATTAGCTTGCCGCTGGGGTTGTGTATTGCTTTTATTGTCATGCACTTCCAGGGACTGAATGCCAATATTATGAGCTTGGGTGGCATTGCGATTGCCGTCGGGGCGATGGTCGATGCTGCTATCGTCATGATCGAGAATGCGCATAAACGGCTGGAAGAGTGGCAGCACCAGCATCCTGACGCCACGCTGGATAATAAAACGCGCTGGCAGGTGATCACCGATGCGTCTGTTGAAGTGGGGCCGGCGCTATTTATCAGTCTGCTGATTATCACGTTGAGC‑TTTATCCCGATCTTCACCCTGGAAGGGCAGGAAGGGCGTCTGTTTGGCCCGTTGGCGTTCACCAAAACGTATGCG > CP042583/479060‑479620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |