Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 927,316 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 927,316 | 0 | A | T | 99.6% | 604.8 / NA | 254 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (122/131); minor base G (0/1); total (122/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 927,317 | 0 | C | G | 99.6% | 602.0 / NA | 254 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (122/131); minor base A (0/1); total (122/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 927,318 | 0 | T | A | 99.2% | 592.5 / NA | 254 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (121/130); minor base G (0/2); total (122/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
TGTAGCGCGGCTTCGGCAGCACAATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑GCTTTTATGAAAATTCGGACTGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTACTGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCGCTCAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGACTTCATCT > CP042583/927039‑927594 ||| tGTAGCGCGGCTTCGGCAGCACAATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGCTCGGGCGAGCGGTTGAGACATCac > 1:1146455/1‑287 (MQ=255) cgGCTTCGGCAGCACAATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCg > 1:1449063/1‑289 (MQ=255) cTTCGGCAGCACAATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCgaga > 1:1832864/1‑289 (MQ=255) tCGGCAGCACAATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATc < 1:573573/289‑1 (MQ=255) acaATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTa < 1:1109843/287‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGc > 1:1242546/1‑266 (MQ=255) ccAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCg > 1:176774/1‑289 (MQ=255) ccAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCg < 1:1414881/289‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCg > 1:1280518/1‑289 (MQ=255) ggCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCCATGACCGGCGGCGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGTCGTg > 2:1364885/1‑288 (MQ=255) ggCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTgg > 2:943345/1‑289 (MQ=255) cTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCCCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCCAGGGGTTGAGTCCTCAAAACCGGCCAGATCCAATTAGCCGCCTGGCGTTGCa > 2:1782507/1‑289 (MQ=255) cGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATaa > 1:1286467/1‑289 (MQ=255) cGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACT‑TTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTA‑‑CGCCTGGCGTGGCATAAGCg > 1:725145/1‑289 (MQ=255) ggCACCAGTTCATCAACAAGTTGATAATCCCAGGGGCTTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGTTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATaa < 2:1124546/288‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTTTATAATCCCAGTAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCatat < 2:598094/289‑1 (MQ=255) tCCCCCAGTACATAACCCCAGGTGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCATGCAGGTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCGGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCatat < 2:765325/289‑1 (MQ=255) aGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGTCAATGACCGGGCGCGTGGTTGAGACACCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGCTTTGCATATccccc > 2:1564285/1‑288 (MQ=255) aGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATccacc > 1:1510915/1‑288 (MQ=255) aGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATccacc > 2:1229878/1‑288 (MQ=255) gttggaaTCCCAGGCGCCTTTCGCCGACATTTCCCCCTGCAGTGTCGGCTGCTTAGCCAGGGTGTTCAGGTGGTT‑CGATTTAGGAAAATTCGGTGAGCCGTGTCCGCCAGCCTCGACATCCTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCcaccac < 2:15544/283‑1 (MQ=255) tGATCATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCcaccac < 1:615461/287‑1 (MQ=255) gATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGa > 1:1067003/1‑288 (MQ=255) tCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGt < 1:349268/265‑1 (MQ=255) ccccAGGGGCCTTGCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGAGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGTGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGACTGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAgcg < 2:1286467/288‑1 (MQ=255) ccAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCa < 2:1378163/289‑1 (MQ=255) cAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCTATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAgcgc > 1:1032441/1‑287 (MQ=255) ccTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCAt > 2:227152/1‑250 (MQ=255) ctctcgcccgtcaTTTCCCCGGCGGCTGCGGCTGCGTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGAGTTATGAAAATTCGGTGGGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTtgctg < 2:1509407/277‑1 (MQ=255) cAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCg < 1:134522/289‑1 (MQ=255) tGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTc < 1:23641/289‑1 (MQ=255) gCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATCAGCGTTTTGCGTATCCCCCACGATCACTGCACTTTGACTCGGCTCTGAGGTAATGGCTTCCgggtc > 2:1760078/1‑286 (MQ=255) ggtggctTACCCGTTGTTTGCAGGGCGTTCGCTTTCGT‑AAAGTTCGGTGCGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACAGACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCAGCCCGGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGa < 2:1570914/284‑1 (MQ=255) ggCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGACAATTCGGTGCGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGa < 1:1738652/288‑1 (MQ=255) ggCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGa < 1:154970/288‑1 (MQ=255) ctgctTACGCTTGTGTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACGGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGc < 2:388587/288‑1 (MQ=255) gctTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGt < 1:100714/289‑1 (MQ=255) ttACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGtt < 1:1591090/288‑1 (MQ=255) ttACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTAATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTa < 1:1251766/289‑1 (MQ=255) gCATGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGgt < 1:428363/289‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGgtcg > 1:252602/1‑289 (MQ=255) ggTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGgtcgtc > 1:791859/1‑289 (MQ=255) gTTTTCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGtca > 1:1215191/1‑289 (MQ=255) tttCAGGGCGTT‑CGATTTATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGtcatc < 2:559295/289‑1 (MQ=255) gCGTT‑GGATTTTGGAAAATTCGGTGGGCCGGGTCCGCCAGACTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCa < 2:1906961/288‑1 (MQ=255) gcgttcgatttATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCa < 1:153726/280‑1 (MQ=255) gcggtggatttATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCTCCAGCCTCGACATACGGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCa < 2:416851/280‑1 (MQ=255) ccgttagttttATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCa < 2:1740234/281‑1 (MQ=255) gttcgatttATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCAcc > 1:935444/7‑288 (MQ=255) tggattgtcgAAAACTCGGTGGGCAGGGTTCGACCGCCGCGACATACTGTTCAGCCCAGCGAGTTTGAAGCCAGGTGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCAcctcc < 2:307557/280‑1 (MQ=255) ttATGCAAATTGGGTGAGCCGGGTCCGCCGGCATGGACATACTGTTCATCCCGGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGt < 2:110857/289‑1 (MQ=255) ttACGAAACTTCGGGGGGCAGGGGCAGACAGCCTCGACCTACTCTTCCTCCCAGCCAGTTGGAAACCAGATGGTCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTAACGGCGGTTTGAAGGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGt < 2:3372/289‑1 (MQ=255) atATGAAAATTCGTTGGACCGGGTCCGCCATCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAGCCGGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGt < 1:1760078/288‑1 (MQ=255) tATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTc < 1:1888096/289‑1 (MQ=255) tATGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTc < 2:361863/289‑1 (MQ=255) tGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGCCATCCTGTTCATTCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATCTCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGCATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGATTCAg < 1:643380/289‑1 (MQ=255) tGAAAATTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAg < 2:1172217/289‑1 (MQ=255) gAAAATTCGGGAGCCGGGGTCCGCCGCCCTCAACCTACTGTTACTCACTGCCATTTGGAAGCCACATGATCGGCATCCCTGCGCCGCGGGCTGCGGTCAGGGCGGTGTGAATGTGGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAGCCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAgc < 2:1732504/289‑1 (MQ=255) aagaTTCGGTCATCCGGGTCCGCTAGCCTCGTCCTACAGTTACTGCCGACCGTTTTGAAACGCGGTGATCAGCAGCCGCGCCGCTTGCGGGGCGATTACGGCTGTTTGAATGTTGGGAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTACGTAGGCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTGTTGCATACCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAgg < 2:1235579/285‑2 (MQ=255) aaaTTCGGTGAGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAgcgc < 1:751820/289‑1 (MQ=255) ttcggtgagCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGTAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTGGAATGTTGGCAATGACCAGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGTGCTCTAAGTAGCCACCTGGCGTGGCATCAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACGTTGCTGCAGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTACGGTCGTCACAATCTCACATCCTGACTCTGCGCAgg > 2:1548153/9‑289 (MQ=255) gtgagCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGa < 2:733597/238‑1 (MQ=255) ccGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATggg < 2:1280518/288‑1 (MQ=255) ccgacggccatgACATACAGTTCGTTCCAGCGAGTTTGAAAACAGATGTACTGCAACCGTGCCGGTCGCGCTGCGGGGACGGCGGTTTGAGTGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGGTGAGAGATCAACGGTGGCGGGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGGTGCGGATCGAAGGTAATGGATTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCCGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCa < 2:1266266/278‑1 (MQ=255) gCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCAtt < 1:683510/289‑1 (MQ=255) gACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGACACCAGTTGATCAGCATCACTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCAcctcc < 1:871462/249‑1 (MQ=255) gACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTg > 1:1867655/1‑289 (MQ=255) gTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCGGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATg < 2:1867655/289‑1 (MQ=255) gTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGgtc < 1:216589/224‑1 (MQ=255) ttCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGc < 2:164478/114‑1 (MQ=255) ttCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGc > 1:164478/1‑114 (MQ=255) aGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTTCGGATCGAAGGTAATGTCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCAGGCCACCTCCTTAGTCAGCGCAGGTGGCTGGGCGCGGCCTTGCTTCAGTGGGTGAAGGCGCTCGCCg > 2:1077162/1‑289 (MQ=255) aGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAgc > 1:603815/1‑241 (MQ=255) aGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCg > 1:142385/1‑289 (MQ=255) aGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCg > 1:164952/1‑289 (MQ=255) ccATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGgcgc > 1:1686105/1‑255 (MQ=255) ccATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGaa > 2:728450/1‑289 (MQ=255) ccATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCCCCTGAGTCAGCGCAGGTAATGGGGCTCGGCGTTGCATCAGTGGTTGAAGGCGCTCGCCGaa > 2:865893/1‑289 (MQ=255) tttGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGtt > 1:1208824/1‑289 (MQ=255) ttGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGc < 2:1061530/218‑1 (MQ=255) ttGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGc > 1:1061530/1‑218 (MQ=255) gatgatCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGc > 2:609282/1‑209 (MQ=255) gatgatCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTccc > 2:237960/1‑287 (MQ=255) gCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGACAATCGTCGaa > 1:1787804/1‑289 (MQ=255) ccGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCCGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGGGTGCCGACAGAAACTCGTCGCAg > 2:1157600/1‑289 (MQ=255) cgcgCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTaa > 2:1671247/1‑289 (MQ=255) cACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTTAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCt > 1:838947/1‑288 (MQ=255) ggTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCa < 1:1395044/288‑1 (MQ=255) tttGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCAcc < 2:142385/288‑1 (MQ=255) tGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAgg < 1:939287/289‑1 (MQ=255) tGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGc < 1:475924/283‑1 (MQ=255) tGGCAATGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGc > 2:475924/1‑283 (MQ=255) aaTGACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGa < 1:744316/289‑1 (MQ=255) aTGCCCGGGCGAGGGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGAGCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGAc < 2:791859/289‑1 (MQ=255) gACCGGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGACtt < 1:331870/289‑1 (MQ=255) gACCAGGCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCATTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAAGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGTTAGATGGGCGCGGCATTTCATCAGTGGTTTAATGCGCTCGCCGAAGGTGTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGACtt < 1:1566334/289‑1 (MQ=255) ggCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGt < 2:1797450/159‑1 (MQ=255) ggCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGt > 1:1797450/1‑159 (MQ=255) ggCGAGTGGTTGAGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGACTTCATcc > 1:295360/1‑288 (MQ=255) ggCGAGTGGTTGAGACAGCAAACGCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGGTCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCGGGTGGATGGGCGCGGCATTGCATCAGAGGTTGAAGGGGCGCGCCGAAGGTTTCGATTCCCGACAGAAAACCGTCGACAGTTAACATCCCCCCTTCGGCACCCGGCACGCGTGCCCCTCCATCt > 2:891826/1‑289 (MQ=255) ||| TGTAGCGCGGCTTCGGCAGCACAATATCGCCAGGCTGCGGCACCAGTTCATCCACCAGTTGATAATCCCAGGAGCCTTTCGCCAGCAATTTCCCCTGCAGCTGCGGCTGCTTACGCATGGTTTTCAGGGCGTT‑GCTTTTATGAAAATTCGGACTGCCGGGTCCGCCAGCCTCGACATACTGTTCATCCCAGCCATTTTGAAACCAGATGATCAGCATCCCTGCCGCTCGCGCTGCGGTCACGGCGGTTTGAATGTTGGCAATGACCGGGCGAGTGGTACTGACATCAAACCCGGCGAGATCTAAGTAGCCGCCTGGCGTGGCATAAGCGTTTTGCATATCCACCACGATCAGCGCACTTTGCTGCGGATCGAAGGTAATGGCTTCCGGTCGAGCGGTTAAGGTCGTCATCATGCCACCTCCTGAGTCAGCGCAGGTAGATGGGCGCGGCATTGCATCAGTGGTTGAATGCGCTCGCCGAAGGTTTCGATTCCGCTCAGAAAATCGTCGAAGGTTAACAGCACGCCTTCGGCACCAGGCACGCTTGCGACTTCATCT > CP042583/927039‑927594 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |