| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,455,141 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,455,141 | 0 | A | T | 100.0% | 555.2 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (108/125); total (108/125) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,455,142 | 0 | G | C | 100.0% | 549.0 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (108/125); total (108/125) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,455,143 | 0 | C | G | 99.6% | 545.6 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (107/125); minor base T (1/0); total (108/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
CTGGTAGCGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGAGTTTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTAGTAGCGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGCACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCAGTGCAGCTGGCG > CP042583/1454863‑1455420 ||| ctggttcggcgGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTa < 1:526859/281‑1 (MQ=255) ggttcggcgGTCATACTGGTTAAAGTGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTAtg < 1:1652668/283‑1 (MQ=255) tcggcgGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGa < 1:137066/286‑1 (MQ=255) cgGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGTTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTCGGTGATtgt > 1:657718/1‑289 (MQ=255) cATACTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATtgtggtg > 1:741652/1‑289 (MQ=255) aCTGGTTAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATtgtggtgtgg < 1:1850118/289‑1 (MQ=255) tAAAGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGccc > 2:1423843/1‑289 (MQ=255) aGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTTTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCaaa > 2:611569/1‑289 (MQ=255) aGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGGTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGGACTGTTCGGTGGAGCCGCACGCTCTTACTGTTAGGTGATTGTGGTGTGGTTGCGCaaa > 2:145238/1‑289 (MQ=255) aGCGATGGTGTCATTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGATATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCaaa > 2:585184/1‑289 (MQ=255) ggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCg < 2:798528/282‑1 (MQ=255) ggtgtcatttGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCg < 1:230184/282‑1 (MQ=255) aaTGTTGTACCCAATGCAGGTGATCTATATGTTGCTCAATAATGTATGGGACGGCTATTGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATGCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAGCAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGt < 2:1188940/289‑1 (MQ=255) aaTGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGt < 1:100103/289‑1 (MQ=255) tcTGGTGAGCTATATGTTTCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATGCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCTATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAg < 1:1187005/288‑1 (MQ=255) gCTGTTCAGCTATATGTTGCTCAATAATCACTGGTACGGCTATGTGCTAGTTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGACCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAg < 2:1014239/289‑1 (MQ=255) gTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCAt > 1:1352175/1‑289 (MQ=255) atatGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAAc < 1:998756/289‑1 (MQ=255) atGTTTGTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:1330521/289‑1 (MQ=255) atGTTGTGCATTAATATCTTGTGTGGCTATGGGCTGATTATGCCGGGTATGCGATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAGCTAATGAATTACCGCAAATGAACAGGAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATGGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 2:475727/289‑1 (MQ=255) atGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:213469/289‑1 (MQ=255) atGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 2:1279820/289‑1 (MQ=255) atGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACAAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:1782901/289‑1 (MQ=255) gTTGGTCAAATATAGCTGGGTCGGCTATTGGGTGATTATTCCGGGTTTTCTATTTTTACTTATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtc < 2:1772215/289‑1 (MQ=255) tGCTCAATAATATCTGGTACTGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtctc < 1:294593/289‑1 (MQ=255) cTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtc > 1:782725/1‑285 (MQ=255) cTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCtt > 1:1564632/1‑289 (MQ=255) cTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCtt > 2:1035351/1‑289 (MQ=255) aataatATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTaaaa > 2:1122671/1‑276 (MQ=255) aataatATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatt > 2:1409752/1‑289 (MQ=255) aataatATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatt > 1:608200/1‑289 (MQ=255) ataataTCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatta < 1:811855/289‑1 (MQ=255) ataataTCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatta < 1:1742888/289‑1 (MQ=255) ggTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCTTCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATggg > 2:543152/1‑289 (MQ=255) ggTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATggg > 1:1067546/1‑289 (MQ=255) ggTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATggg < 1:1035351/289‑1 (MQ=255) tACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATtgtgg < 2:563484/205‑1 (MQ=255) cTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctcgttg > 1:1235388/1‑283 (MQ=255) aTGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctcgttggt > 2:796826/1‑281 (MQ=255) tGGGCTGATTATTCCTGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTATTGAAAAGCAAATTCACCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTc < 2:1329844/289‑1 (MQ=255) tGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctc < 1:1700967/282‑3 (MQ=255) gggCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCCTCTCTTATTACAGTATGGGctcgttgg > 2:246892/1‑279 (MQ=255) ggCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGctcgttgg > 1:1027946/1‑278 (MQ=255) attattCCTGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCttatta < 2:1357287/263‑1 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCt > 1:1529799/1‑289 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCt > 2:390620/1‑289 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATATCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCt > 2:1688260/1‑289 (MQ=255) gTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa > 2:407067/1‑243 (MQ=255) tCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGc > 2:687828/1‑288 (MQ=255) tgtttGGACGGGTCGCGCTGATGCGGTTGAAAAGCAAATTCGCCAGCGAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATGCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCGAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCAtc < 2:1874905/237‑1 (MQ=255) gTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGa > 1:943135/1‑289 (MQ=255) aCTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGaaa > 1:1162167/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCCAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCCCTTATTACa > 1:1874905/1‑239 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa < 1:858536/227‑1 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCa > 2:858536/1‑227 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATggg < 1:426545/246‑1 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:1805424/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:751342/1‑289 (MQ=255) gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGt > 1:334791/1‑288 (MQ=255) tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGACGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 2:1048220/1‑288 (MQ=255) tGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 1:585184/289‑1 (MQ=255) gTTGAAAAGCAAATTCCCCGGCCAGTTGGTGGGCGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc < 2:1387345/289‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCa > 1:839529/1‑286 (MQ=255) ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCGGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTACGGCCCa > 2:335337/1‑286 (MQ=255) aaaaGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTggg < 1:1615783/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 2:741652/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:1685436/289‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGACCCATCTGGGCTa < 2:802113/289‑1 (MQ=255) cAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAAt < 2:1534435/289‑1 (MQ=255) agccagTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAAc > 2:732176/1‑288 (MQ=255) ttGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGc > 2:1514193/1‑207 (MQ=255) ttGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGc < 1:1514193/207‑1 (MQ=255) tggtggACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTATAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCa < 1:740574/287‑1 (MQ=255) ggACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGATGAGCAACCCGTTAGTCTGGCTGGAAGGGG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCACATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 2:91308/288‑1 (MQ=255) ggACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 1:1409752/288‑1 (MQ=255) gACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc > 2:927053/1‑258 (MQ=255) gACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATc < 1:927053/258‑1 (MQ=255) ccAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAAt > 1:1105231/1‑289 (MQ=255) cAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAAt < 1:1672031/288‑1 (MQ=255) gTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcag < 2:1235388/289‑1 (MQ=255) aTTACCGCAATTGAACAGCAAAACGTTAGTCTGGCTGGAAGTTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTAt < 2:1554274/288‑1 (MQ=255) aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 2:1376589/289‑1 (MQ=255) aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 2:1672816/289‑1 (MQ=255) aTTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:454859/289‑1 (MQ=255) aCCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTAc < 1:797139/289‑1 (MQ=255) aaTGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCTTCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTa < 1:543152/289‑1 (MQ=255) tGAACGGCAAACGGTTAGTCTGGTTGTAAGGTGTTTAATCG‑GTACGGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 2:1657976/289‑1 (MQ=255) tGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc < 1:390620/289‑1 (MQ=255) aCAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCtt < 2:1738465/288‑1 (MQ=255) cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTAtt < 1:1543144/234‑1 (MQ=255) gctggAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGcc > 1:751685/1‑289 (MQ=255) gctggAAGGTG‑TTTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGcc > 2:443095/1‑289 (MQ=255) ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcag < 1:1286631/220‑1 (MQ=255) ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcag > 2:1286631/1‑220 (MQ=255) ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctca > 1:625155/1‑285 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc > 2:49477/1‑226 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:49477/226‑1 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctcagca > 2:658198/1‑280 (MQ=255) ccGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTggcg > 2:309921/1‑288 (MQ=255) cGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTggcg < 1:1805424/287‑1 (MQ=255) ||| CTGGTAGCGCGGTCATACTGGTTAAAGCGATGGTGAGTTTTGGGCAAATGTTCTACCCAATGCTGGTGAGCTATATGTTGCTCAATAATATCTGGTACGGCTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑TTAGTAGCGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGCACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTA‑TTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCAGTGCAGCTGGCG > CP042583/1454863‑1455420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |