| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,492,636 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,492,636 | 0 | A | T | 99.1% | 537.2 / ‑5.5 | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (101/125); minor base C (1/1); total (103/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,492,637 | 0 | G | C | 99.1% | 529.6 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (102/124); total (103/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,492,638 | 0 | C | G | 99.1% | 536.7 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (102/126); total (103/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
CGCCCGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGAGCGT‑ATGGATGCCCCATAGTTTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGAGTAGC‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCGTGGT > CP042583/1492356‑1492916 ||| tgCCCTCGCCTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCAAAGTCTGCTGCAGGTTTTGTCTCTTCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATgg < 2:1377733/288‑1 (MQ=255)cGCCCGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATgg < 1:189043/289‑1 (MQ=255) gcTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTTGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGccc < 1:1738302/288‑1 (MQ=255) gcTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGccc < 1:603327/288‑1 (MQ=255) aTCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCAttcattac > 1:448354/1‑281 (MQ=255) cGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTCCGCCGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGTTATGCTGACACCCGCAGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCGGGCGTTTCCGCTTGCCTATCTTGGGTCCCCAAAAGGGCAACCAAACGGAACGCATTATCTGCATGTCATTATTTGTCTGGTCGTT‑ATGGATGCCACAttcattacctg > 2:1129994/1‑279 (MQ=255) ttttACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGaa < 1:858425/288‑1 (MQ=255) ttttACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGaa < 1:343619/288‑1 (MQ=255) cccACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAgc > 2:651140/1‑287 (MQ=255) acaGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGt > 2:228110/1‑289 (MQ=255) aGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCATAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTCTCTGG‑TCGTGATGGCTGCCCCATTCATTACCCGCCAACCGTGCTGtt > 2:1366184/1‑288 (MQ=255) aGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTc > 2:1096221/1‑289 (MQ=255) aGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTc > 1:1629363/1‑289 (MQ=255) tCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGt > 2:935101/1‑289 (MQ=255) tgctgGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTg > 2:754856/1‑289 (MQ=255) tgctgGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTg > 1:1674874/1‑289 (MQ=255) ttgCGGTATTTGCGCTGCTGGCACCCTTTTCCCTTAAGATTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGGGCTGGGTTATTTGCGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggt < 2:498274/286‑2 (MQ=255) cGGTTTTTGCGGTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTGCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCAAGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcat < 2:1595024/288‑5 (MQ=255) gTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgc > 2:23439/1‑282 (MQ=255) atgtGCCCTTCTGGCAACCTGTTGCCGTAGGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGAGCTACAAGTAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 2:708784/286‑10 (MQ=255) gctgctGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaaatgat < 1:579673/288‑15 (MQ=255) gctgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 1:778083/280‑10 (MQ=255) gctgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa > 2:778083/1‑271 (MQ=255) gctgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAAt > 1:73893/1‑289 (MQ=255) gctgGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAAt > 1:557340/1‑289 (MQ=255) aaGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCCGTTTc > 1:1900102/1‑289 (MQ=255) aaGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTc > 1:517161/1‑289 (MQ=255) ttCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATc < 1:752562/288‑1 (MQ=255) tCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCg < 1:1089402/288‑1 (MQ=255) cGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGACCGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTTGTCATCT‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCCGTTTCCTCGGCt > 1:41252/1‑289 (MQ=255) aGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCttatt < 2:727873/289‑1 (MQ=255) ggCGGGTTAATTGCGGCTGCTGGGCTACAAGCAGTGGTCCTGGTTTATTTGAGCCACCTACTAGCCGATATTCTGGCACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCAGGCCGCTGACGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCttatt < 2:744893/288‑1 (MQ=255) cTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa > 1:593768/1‑238 (MQ=255) cTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 2:593768/247‑10 (MQ=255) cTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGCACAATACCTTTCAGATCCAGTTGCATCGGCTTATTAAg > 2:676769/1‑289 (MQ=255) cTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTaa > 1:1480927/1‑288 (MQ=255) cTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTaa > 2:1726510/1‑288 (MQ=255) gTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCa > 2:1495458/1‑288 (MQ=255) gCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAAt > 1:1234056/1‑289 (MQ=255) gCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAAt > 1:894525/1‑289 (MQ=255) acTACAAGGAATGGTCCTGGGTTATTTGAGCCACTTACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTaaaa < 2:374330/287‑1 (MQ=255) cTACAAGGAATGGTGCTGTGTTATTTGAGCCACAGACTGGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCGGCTCTGGCCATTCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTggtcatcgcaa < 2:1740052/225‑10 (MQ=255) gAAGGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCa < 2:846965/285‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCa > 2:802491/1‑288 (MQ=255) ggTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCAc < 1:1600802/289‑1 (MQ=255) tGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCAttcat > 1:1043004/1‑173 (MQ=255) tGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCt > 2:584631/1‑289 (MQ=255) tGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGCCACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCttt < 1:1430166/288‑1 (MQ=255) tGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCtt > 1:813080/1‑287 (MQ=255) tttGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGCTGCCGCATTCATTATCCGAGAACAGCGCTGGTCGTTGGTCATCG‑CAAATGAACCATACCTTCCAGTTCCAGTCTCACCGTGCTATTAAGCATCGAGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 2:79282/1‑289 (MQ=255) tttGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 1:350336/1‑289 (MQ=255) tttGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 1:1489403/1‑289 (MQ=255) tttGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGG‑GAATCGCAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCCGGTTGAATTCAAAAACGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATa > 2:283190/1‑289 (MQ=255) tGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGa < 1:1519525/289‑1 (MQ=255) gCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCCAAAATCCCATTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAagaa > 2:1838041/1‑288 (MQ=255) gCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCAGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAagag < 1:796728/289‑1 (MQ=255) cggACAGCCGCCGGGTTGCCCCTGCTCGGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTAGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAagag < 1:1110613/286‑1 (MQ=255) tGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGc < 2:1183879/288‑1 (MQ=255) gACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCa < 2:518470/289‑1 (MQ=255) gACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCa < 1:1726510/289‑1 (MQ=255) cgccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCttatt < 2:1170700/208‑1 (MQ=255) cgccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCttatt > 1:1170700/1‑208 (MQ=255) gccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTcaca > 1:1097844/1‑289 (MQ=255) ccgGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAg > 1:952643/1‑289 (MQ=255) tGCTCTGGCCCTGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCt < 1:783641/289‑1 (MQ=255) ctctGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGt < 2:195105/276‑1 (MQ=255) tctGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTg < 1:1803390/288‑1 (MQ=255) ggCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGcc < 1:82992/289‑1 (MQ=255) ggCCAGTCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTAGCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGTTCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAAGCTTGCGcc < 2:1109472/289‑1 (MQ=255) gCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGcc < 2:894525/288‑1 (MQ=255) gCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCa > 1:1341441/1‑289 (MQ=255) cATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAac < 1:1408597/289‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGc < 2:1262183/255‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACt > 2:1638265/1‑289 (MQ=255) gCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACt > 2:885229/1‑289 (MQ=255) gCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACt > 2:1013397/1‑289 (MQ=255) ccGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTa > 2:1448957/1‑289 (MQ=255) tGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGc < 2:415222/172‑1 (MQ=255) tGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGc > 1:415222/1‑172 (MQ=255) tGGCGGTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGa < 1:1850869/288‑1 (MQ=255) ttCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGC‑TATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 1:720384/289‑1 (MQ=255) tCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 1:651140/289‑1 (MQ=255) tCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 2:1669600/289‑1 (MQ=255) tCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 1:23439/289‑1 (MQ=255) gtcGCTTGCCTAGCCTGTGTCCCCAAAAGGGCAACCATCTGGAACTTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTGGGT‑ATGGATTCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATAACTTGCAGATCCACTTTCATCGGCTTAGTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 2:1060679/287‑1 (MQ=255) gccGCTTGCCTAACCTGGTTCCCCAAGAGGGCAACCAAATGTAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGACTGGACGGT‑ATGGATGCACCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGGTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGAACCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATATGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGGTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACg < 2:1900102/288‑1 (MQ=255) tGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGa < 1:228110/289‑1 (MQ=255) ggTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAaataat < 1:133102/289‑1 (MQ=255) gTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAataata > 1:680582/1‑289 (MQ=255) ccAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATc > 1:18301/1‑289 (MQ=255) ccAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATc > 1:1295633/1‑289 (MQ=255) gCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGaa < 1:1638265/288‑1 (MQ=255) caaccaacTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGaa < 1:621104/287‑1 (MQ=255) caaccaacTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACg > 2:175612/1‑289 (MQ=255) caaccaacTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCACCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACg > 1:207457/1‑289 (MQ=255) tATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTa > 1:1561748/1‑289 (MQ=255) tATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGAACAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTa > 2:344865/1‑289 (MQ=255) cATGGCATTATTTGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCg > 1:842967/1‑289 (MQ=255) tttGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCgtgg > 1:1204581/1‑289 (MQ=255) tttGTCTGGTCGGT‑ATGGATGCCCCATTCATTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGTCATCG‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCgtgg > 1:464875/1‑289 (MQ=255) ||| CGCCCGCGCTTTTGGGCATCGTGGTTTTACCCACAGTCTGCTGGCGGTATTTGCGCTGCTGGCAACCTTTTACCTTAAGGTTCCGGAAGGCTGGTTCATTCCGGCTGATGCGCTACAAGGAATGGTGCTGGGTTATTTGAGCCACATACTTGCCGATATGCTGACACCCGCCGGTGTTCCCCTGCTCTGGCCATGCCGCTGGCGTTTCCGCTTGCCTATCCTGGTTCCCCAAAAGGGCAACCAACTGGAACGTTTTATCTGCATGGCATTATTTGTCTGGAGCGT‑ATGGATGCCCCATAGTTTACCCGAGAACAGCGCTGTTCGTTGGAGTAGC‑CAAATGATCAATACCTTGCAGATCCAGTTTCATCGGCTTATTAAGCATCAGGTTGAATACTAAAAAGGCAAAAATCACCTTTCTGGAATAAGCAATTCCATTTGAATATAAGAGCCAGCTCACAGTTCTGTTAATCTTGCGCCAACACTATGACTGCTACGCAGTGATAGAAATAATAAGATCAGGAGAACGGGGATGAACTTTCCATTAATTGCGAACATCGTGGT > CP042583/1492356‑1492916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |