Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,494,877 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,494,877 | 0 | A | T | 100.0% | 108.7 / NA | 47 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,494,878 | 0 | C | G | 100.0% | 108.5 / NA | 47 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (24/23); total (24/23) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,494,879 | 0 | T | A | 100.0% | 108.2 / NA | 47 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (24/23); total (24/23) |
AAATGCTCCCGACAGGATGTATATAATTTTGTTCATAGTATATAGTCCTTAAATAGTGAATAACCAACCTGTTTTTTATACTGATCAAATTGGTCATTTTTTCTGGGCGAAATACAGAAGTGACATCCATTCCAATAAAATCTTTATTTATACCTCTTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTACTGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTACTTTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTACTTATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATTATTATCTCATTTAAATCTAAGTCATTTACAATATAAGTTTAAGAGCGA > CP042583/1494621‑1495158 ||| aaaTGCTCCCGACAGGATGTATATAATTTTGTTCATAGTATATAGTCCTTAAATAGTGAATAACCAACCTGTTTTTTATACTGATCAAATTGGTCATTTTTTCTGGGCGAAATACAGAAGTGACATCCATTCCAATAAAATCTTTATTTATACCTCTTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGc < 2:368875/289‑1 (MQ=255) 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tCTTTATTTATACCTCTTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCAc < 1:965447/289‑1 (MQ=255) ctTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTa > 1:1897941/1‑289 (MQ=255) cACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGt > 2:785945/1‑282 (MQ=255) 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tatTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGttga < 1:646023/146‑4 (MQ=255) tatTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGttga > 2:646023/1‑143 (MQ=255) aaCATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCa < 2:1317328/123‑1 (MQ=255) aaCATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCa > 1:1317328/1‑123 (MQ=255) aaCATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGaa < 1:1020035/253‑1 (MQ=255) 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tCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGt > 1:1837949/1‑238 (MQ=255) tCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATtattat < 1:751027/283‑1 (MQ=255) tCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATtattat > 2:751027/1‑283 (MQ=255) ccTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATTATTATCTCAtt < 1:454319/288‑1 (MQ=255) atGTATCAAAACTCAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTACTGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATTATTATCTCATTTAAATCTAAg > 2:1263855/1‑289 (MQ=255) atGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTTGATATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGAAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATTATTATCTCATTTAAATCTAAg > 1:104983/1‑289 (MQ=255) 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AAATGCTCCCGACAGGATGTATATAATTTTGTTCATAGTATATAGTCCTTAAATAGTGAATAACCAACCTGTTTTTTATACTGATCAAATTGGTCATTTTTTCTGGGCGAAATACAGAAGTGACATCCATTCCAATAAAATCTTTATTTATACCTCTTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTACTGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTACTTTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTACTTATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATTATTATCTCATTTAAATCTAAGTCATTTACAATATAAGTTTAAGAGCGA > CP042583/1494621‑1495158 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |