| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 1,494,928 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,494,928 | 0 | A | T | 100.0% | 137.7 / NA | 59 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| * | CP042583 | 1,494,929 | 0 | C | G | 100.0% | 136.5 / NA | 59 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (30/29); total (30/29) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,494,930 | 0 | T | A | 100.0% | 137.8 / NA | 59 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (30/29); total (30/29) | |||||||||||
TATAGTCCTTAAATAGTGAATAACCAACCTGTTTTTTATACTGATCAAATTGGTCATTTTTTCTGGGCGAAATACAGAAGTGACATCCATTCCAATAAAATCTTTATTTATACCTCTTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTACTGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTACTTTCTGCTATTTCATCGCAGTCACATTGACCCGTACTTATAAAGAAAGTGAGTGCTGTCATAGTAGACTGCAGCCTTTCTTTAAAAGAGTCGAAAGCCAGGCTTTTAATATTTAAATCACCATAATTACTCTGTATTAAGTTTGTAGAAAACATCTCCCGCCTCATATTGTTAACAAAATTATTATCTCATTTAAATCTAAGTCATTTACAATATAAGTTTAAGAGCGACGCCACAGGATGAACTATCAAAAATAGCTCATCATGATTAGC > CP042583/1494661‑1495200 ||| tataGTCCTTAAATAGTGAATAACCAACCTGTTTTTTATACTGATCAAATTGGTCATTTTTTCTGGGCGAAATACAGAAGTGACATCCATTCCAATAAAATCTTTATTTATACCTCTTATCCGAATTTCACTACCATAAAGATTATTAATTATTACTCTATATTTAACATTGTCCTGCAGATATGTATCAAAACTAAGTGCTGGCGCTCCTGGCTTTGAGGCATCATAGTTAATGTTAGACATATAGGCAATCATATAATTAAAGTTTGATTCTGCTATTTCATCGCAg < 2:52678/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |