Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,515,079 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,515,079 | 0 | A | T | 99.3% | 682.4 / NA | 290 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (146/141); minor base G (1/1); total (148/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,515,080 | 0 | G | C | 99.3% | 687.7 / NA | 290 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (146/142); minor base A (2/0); total (148/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,515,081 | 0 | T | A | 99.7% | 690.2 / NA | 290 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (147/142); minor base C (1/0); total (148/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
CCATCCGATAAAATTCCCGGCAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCAGTTGGTTTGATTACCGCAGTAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCG > CP042583/1514799‑1515358 ||| ccATCCGATAAAATTCCCGGCAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGttt < 2:667493/289‑1 (MQ=255) gATAAAATTCCCGGCAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTAc < 1:560311/289‑1 (MQ=255) ggCAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGACGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAACAAGCCGATCGTTTCCACTGGTTTGATCACAGCCCAAAAGGt > 2:1808578/1‑289 (MQ=255) cAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGtt < 2:1724807/288‑1 (MQ=255) aGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGAc < 1:459829/289‑1 (MQ=255) ttttATCAAAATCTGCAAAAGTACCTGGAAACCGAACGCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAAcc < 2:1712360/289‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCt < 1:1449411/286‑1 (MQ=255) tacatagcagAAACCTCACTCACACGTGAAAATCCGGTACTGAGTATGGGCGATATGAATATCAGACGTAGAGATCTGGATCTCGGCATTGGCGAAGGAAACCGTACGAGCTGGCTGCTTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGGGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGAcc < 2:1227616/280‑1 (MQ=255) ccTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGa < 2:1254195/261‑1 (MQ=255) aaaCCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCg > 2:1692176/1‑288 (MQ=255) aaaCGTGCTAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAAGATAAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGc < 2:1661900/289‑1 (MQ=255) aaaCGTGATAAACCGGAACTAATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCGGGATATCGGCATGGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGTTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGc < 2:58814/289‑1 (MQ=255) aaCGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGCCTTCGCATCGACCTGCTGCCCCCCAGCCAAcc > 2:876021/1‑286 (MQ=255) ggTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCAGCGACCTGCCGCTCGCCAGCCACCCGCTGGCAGAATGTTGc > 2:1879052/1‑289 (MQ=255) aCTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTa < 2:941918/289‑1 (MQ=255) aTTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGACTCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCGGCCAACCGCTGGCCGAACGGTTCTTAGaa > 2:1459496/1‑288 (MQ=255) aTTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGCTCGTTTCGCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTGGACGATAACCCTTGTCTGCGCATCGACCTGCTGCATTCCAGCCAATCGCTCGCAGAATGTTTCGTAGcaa > 2:55489/1‑289 (MQ=255) aTTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGaa > 1:429277/1‑288 (MQ=255) cGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTGAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCCCGCCAGCCAACCGCTGGCCGAATGTTGCGTAAAAACCGACATc > 2:1417789/1‑289 (MQ=255) cGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCAt < 2:690400/288‑1 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGCTTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCg > 2:504620/1‑288 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCg > 1:811471/1‑288 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCg > 1:1840071/1‑288 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCg > 1:1770502/1‑288 (MQ=255) atatGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCg > 2:434878/1‑288 (MQ=255) taataaTATCAGCCCTCAAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGa < 2:703677/284‑1 (MQ=255) aGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATcc > 1:1409414/1‑289 (MQ=255) aGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATcc > 1:368863/1‑289 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCgc > 1:992616/1‑289 (MQ=255) cccTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGATGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGCCAGCATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGaaaccagc > 2:726428/1‑284 (MQ=255) ctaccgcacTGGATTGCGGCAGTCGACAAGAAACCCGTAAGCTCGGGCTGCTAACCGGTAAATTCTCTTTCCTGCCGGAAGAGAGCGCATGGATGGACAGGCTTATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGAGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTATCATTGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGACAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAATACGGCATCGACTATGAAATCCgcag < 2:793961/281‑1 (MQ=255) aCAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCgcagca < 1:434878/289‑1 (MQ=255) aCAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCgcagca < 1:495767/289‑1 (MQ=255) aTCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGa > 1:1245638/1‑289 (MQ=255) cTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAACAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGaaa > 2:1899132/1‑289 (MQ=255) cTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGCAATCCGCAGCATGGaaa > 2:109653/1‑289 (MQ=255) cTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGaaa > 2:1850204/1‑289 (MQ=255) cTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGaaa > 2:1562840/1‑289 (MQ=255) cTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGaaa > 1:1322586/1‑289 (MQ=255) gATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGCTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTCGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGaaaaa > 2:755562/1‑288 (MQ=255) cGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTcc > 1:205842/1‑289 (MQ=255) cGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTcc > 1:1207129/1‑289 (MQ=255) cGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTc > 2:425257/1‑288 (MQ=255) cGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCCGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTcc > 1:172784/1‑289 (MQ=255) cGGCATGGGCGAAGGAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTcc < 1:1391086/289‑1 (MQ=255) ttGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGACGCATGGAAAAACCGTCCGATc > 2:910208/1‑288 (MQ=255) gaagaaAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGTGAAATGCTCTGTCCTGACGGAAGAGCGCGAAGGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGTTCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGcc < 2:1755663/288‑1 (MQ=255) tAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCg > 1:693262/1‑289 (MQ=255) tgCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTccgcc < 1:676491/288‑1 (MQ=255) tACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATg > 2:1022044/1‑201 (MQ=255) tACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATg < 1:1022044/201‑1 (MQ=255) tACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTaa > 1:1589683/1‑289 (MQ=255) caCCGGTAAATGGCTTTTCGTGCCAGCACGTGGCGACAGGATGGACAGGTTGCTGGGTGTGGGGTTGGTCGCATCCTGCCGCCAGGCGAATCCGCAAACAGCAGTTCGTTTCTCATGGTGTGAGTACCACTCAAAAGGTTTTGACGATACCCGTGGTCTGCGCATCGACCTGATGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTaa < 2:1504365/288‑1 (MQ=255) ggTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCgcag > 1:531564/1‑233 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTagcag < 2:1042510/289‑1 (MQ=255) aaTGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTagcag < 1:1067326/289‑1 (MQ=255) tctTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCtctc < 1:1685177/289‑1 (MQ=255) tctTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCtctc < 1:734393/289‑1 (MQ=255) tttCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGACCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCCCTAAtttcgaacccct > 2:1404055/1‑277 (MQ=255) ccGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCaa > 1:1141958/1‑289 (MQ=255) cGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCaaa < 2:316445/289‑1 (MQ=255) cGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCaa < 2:1372376/288‑1 (MQ=255) ggAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAAc < 1:1850204/289‑1 (MQ=255) gAAGGGCGCGAATGGCTGGACAGGCTGATGGGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTAGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAAc < 2:205842/288‑1 (MQ=255) gcgcGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTagcag < 1:1465466/267‑1 (MQ=255) cgcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCa > 1:163/1‑289 (MQ=255) cgcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGACCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTCGCAGCTCGCCGGGCTCAACCTGGGTCa > 2:1184736/1‑289 (MQ=255) gcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCa > 1:1001038/1‑226 (MQ=255) gcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCa < 1:1785612/288‑1 (MQ=255) gcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAg < 2:1322586/289‑1 (MQ=255) gcgAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAg < 1:320441/289‑1 (MQ=255) aCAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTcc < 2:1343698/259‑1 (MQ=255) aCAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTcc > 1:1343698/1‑259 (MQ=255) cTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCt < 2:322700/284‑1 (MQ=255) tgatgaGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATc < 1:793490/207‑1 (MQ=255) tGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATcaac > 1:1643666/1‑289 (MQ=255) ggggTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTccgcc < 2:777057/224‑1 (MQ=255) ggggTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATcaacaa > 1:292666/1‑289 (MQ=255) ggTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATcaacaa > 1:779777/1‑287 (MQ=255) ggTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACaaa > 2:1446992/1‑288 (MQ=255) ggTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACaaa < 2:1770502/288‑1 (MQ=255) tGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATcaacaa > 2:459949/1‑284 (MQ=255) tGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGt < 1:1284443/289‑1 (MQ=255) ggTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTc > 1:946567/1‑289 (MQ=255) gTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCa > 2:1615533/1‑289 (MQ=255) gATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTa < 1:1175511/289‑1 (MQ=255) ccGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATttg > 1:1891713/1‑289 (MQ=255) cATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTtgc < 1:636495/289‑1 (MQ=255) tGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATttgttg > 1:1742854/1‑286 (MQ=255) tGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTtgcat > 1:82634/1‑287 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTTATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGGCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCTGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGTCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 1:1371355/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCTTCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 1:759296/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 1:1706469/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 2:779777/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 2:1589683/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 1:851542/289‑1 (MQ=255) tCCGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTGTTGACGGTAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 1:701396/289‑1 (MQ=255) cGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCt < 1:1808578/289‑1 (MQ=255) cGCAAACAGCAGATCGTTTCTCATGGTTGGATTACCGCTCAAAAAGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCAAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGCATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTc < 2:274626/287‑1 (MQ=255) agcagATCGTTTCTCATGGTTTGATTACCGCTCAAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCCGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTGCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCCCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAACAATCAACAAACTGGTAGTACTGATTTGTTGCCTGCCGTCAGTTGTtat > 2:990190/1‑289 (MQ=255) ||| CCATCCGATAAAATTCCCGGCAAAAGCGCAGTTTTATCAGAATCTGCAAAACTACCTGGAAACCGAACTCAAACGTGATAATCCGGTACTGATTATGGGCGATATGAATATCAGCCCTACAGATCTGGATATCGGCATTGGCGAAGAAAACCGTAAGCGCTGGCTGCGTACCGGTAAATGCTCTTTCCTGCCGGAAGAGCGCGAATGGATGGACAGGCTGATGAGCTGGGGGTTGGTCGATACCTTCCGCCATGCGAATCCGCAAACAGCAGATCGTTTCAGTTGGTTTGATTACCGCAGTAAAGGTTTTGACGATAACCGTGGTCTGCGCATCGACCTGCTGCTCGCCAGCCAACCGCTGGCAGAATGTTGCGTAGAAACCGGCATCGACTATGAAATCCGCAGCATGGAAAAACCGTCCGATCACGCCCCCGTCTGGGCGACCTTCCGCCGCTAATTTAGCAGCTCTCCTGGCTCAAACTGGGTCAGGAGAATTAACCTTGAGAAAAATCAACAAACTGTCAGTAATGATTTGTTGCCTGCCGTCCTTTGTTATACCG > CP042583/1514799‑1515358 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |