| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (144/120); total (144/120) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,539,899 | 0 | T | A | 99.2% | 621.1 / ‑6.2 | 264 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (142/118); total (144/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
GTGCCATACTTACCATCATGTGAGAGAAATCTTCAAAACTGGTGTTACCGACAAAACCTGTACCAAAAGAAATAATAACCGGGGATTTCGCTTCTTCGGCTGCGTCGATAACGCCCATCAACATTTCTGCATTCCATACGTTAAAATGGGCAATTGCATAATGTTTATTTGTGGCATCGTTTTCCCAATATCTGATATCTGCGAGCATGTTCTGTTCTCCCGTATTAATTAATCGCTAATTTTAATAACGCCTTTAATAATGTCGCGTTTGTTGTTAACACTCTCTTCAAATGCCTGTTGTACATCCCGATAATCGTAAATATGCGTCACCAT‑GCTTTTCACATCGAATCGCCCACTAGAAATAGCTTCAATCGTGACCGGATAACGATTGGCATAGCGGAATACCGTCTGGATAGTGACTTCGCGATTGATTTTGAGGAAATTGATTGCGCTA‑TCGCCGGGTACAGTACCAACAATCATAATTTTACCGCCGCGCATTACCAGATAAGGTGC‑CTGTTTAACG‑GTGACCGCAGAACCCGCTGTTTCGAAAACAATATCT > CP042583/1539618‑1540176 ||| gtgCCATTGATAACATCATGTGAGAGAAATCTTCAAATGAGGTGTTACCGACAAAACCTGTACCAAAAGAAAGAATAACCGGGGATTTCGCTTCTTCGGCTGCGTCGATAACGCCTATCAACATTTCTGCATTCCATACGTTAAAATGGGCAATTGCATAATGTTTATTTGTGGCATCGTTTTCCAAATATCTGATATCTGCGAGCATGTTCTGTTCTCCCGTATTAATTAATCGCTAATTTTAATAACGCCTTTAATAATGTCGCGTTTGTTGTTAACTGACTCTTCa < 1:1329805/289‑1 (MQ=255) 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tttGTTGTTAACTGACTCTTCAAATGCCTGTTGTACATCCCGATAATCGTAAATATGCGTCACCAT‑CGATTTCACATCGAATCGCCCTGAAGAAATAGCTTCAATCGTGACCGGATAACGATTGGCATAGCGGAATACCGTCTGGATAGTGACTTCGCGATTGATTTTGAGGAAATTGATTGCCGAA‑TCGCCGGGTACAGTACCAACAATCATAATTTTACCGCCGCGCATTACCAGATAAGGTGC‑CTGTTTAACG‑GTGACCGCAGAACCCGCTGTTTCGAAAACAata > 1:860268/1‑289 (MQ=255) tgttgtTAACTGACTCTTCAAATGCCTGTTGTACATCCCGATAATCGTAAATATGCGTCACCAT‑CGATTTCACATCGAATCGCCCTGAAGAAATAGCTTCAATCGTGACCGGATAACGATTGGCATAGCGGAATACCGTCTGGATAGTGACTTCGCGATTGATTTTGAGGAAATTGATTGCCGAA‑TCGCCGGGTACAGTACCAACAATCATAATTTTACCGCCGCGCAtt < 2:1006993/230‑1 (MQ=255) tgttgtTAACTGACTCTTCAAATGCCTGTTGTACATCCCGATAATCGTAAATATGCGTCACCAT‑CGATTTCACATCGAATCGCCCTGAAGAAATAGCTTCAATCGTGACCGGATAACGATTGGCATAGCGGAATACCGTCTGGATAGTGACTTCGCGATTGATTTTGAGGAAATTGATTGCCGAA‑TCGCCGGGTACAGTACCAACAATCATAATTTTACCGCCGCGCAtt > 1:1006993/1‑230 (MQ=255) ||| GTGCCATACTTACCATCATGTGAGAGAAATCTTCAAAACTGGTGTTACCGACAAAACCTGTACCAAAAGAAATAATAACCGGGGATTTCGCTTCTTCGGCTGCGTCGATAACGCCCATCAACATTTCTGCATTCCATACGTTAAAATGGGCAATTGCATAATGTTTATTTGTGGCATCGTTTTCCCAATATCTGATATCTGCGAGCATGTTCTGTTCTCCCGTATTAATTAATCGCTAATTTTAATAACGCCTTTAATAATGTCGCGTTTGTTGTTAACACTCTCTTCAAATGCCTGTTGTACATCCCGATAATCGTAAATATGCGTCACCAT‑GCTTTTCACATCGAATCGCCCACTAGAAATAGCTTCAATCGTGACCGGATAACGATTGGCATAGCGGAATACCGTCTGGATAGTGACTTCGCGATTGATTTTGAGGAAATTGATTGCGCTA‑TCGCCGGGTACAGTACCAACAATCATAATTTTACCGCCGCGCATTACCAGATAAGGTGC‑CTGTTTAACG‑GTGACCGCAGAACCCGCTGTTTCGAAAACAATATCT > CP042583/1539618‑1540176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |