Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,592,073 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,592,073 | 0 | A | T | 100.0% | 433.8 / NA | 184 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (85/99); total (85/99) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,592,074 | 0 | G | C | 98.9% | 427.0 / NA | 184 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (83/99); minor base T (2/0); total (85/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,592,075 | 0 | T | A | 99.5% | 435.2 / ‑4.6 | 184 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (84/98); minor base G (0/1); total (85/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
TGGCAATGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGAGTCCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGAGTCCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCAGCCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCTTTTTAGTATTTACT > CP042583/1591795‑1592352 ||| tGGCAATGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATaa < 1:11491/289‑1 (MQ=255) gCAATGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAAcc > 1:17445/1‑289 (MQ=255) aaTGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACca < 2:1204465/288‑1 (MQ=255) aTGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCGCCCAATAACcaca < 1:500249/289‑1 (MQ=255) aTGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca < 1:385842/289‑1 (MQ=255) aTGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca < 2:147469/289‑1 (MQ=255) ggTTCCCCTACCATTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGGAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGGCACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACAcc < 2:584740/289‑1 (MQ=255) ttCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCatt < 1:1504280/289‑1 (MQ=255) cccTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCTTGGTTCTGCTGCCCGCGTCATCGGCGGATTTCAATATCTTCTGGCCGATGATCTTATGTGTGGCGTGTTTTGGCTTTTTCCAGTTACCAAATAACTACCGCGTTATTGcc > 2:1116019/1‑288 (MQ=255) tGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTCTTACCCTCGCCCCtg > 2:912580/1‑287 (MQ=255) aaCCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATAGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGaa < 2:828549/289‑1 (MQ=255) gTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTa < 1:1880511/289‑1 (MQ=255) cGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCCCCCACTACCCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCTAACCTAGCGGTGGa > 1:1024941/1‑288 (MQ=255) tAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGt < 1:1104778/283‑1 (MQ=255) tAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGt > 2:1104778/1‑283 (MQ=255) tGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca > 1:1338153/1‑245 (MQ=255) tGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca < 2:1338153/245‑1 (MQ=255) gTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGC‑TTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACca > 2:1433000/1‑238 (MQ=255) cTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGGGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACggaccgg > 2:59025/1‑283 (MQ=255) gACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCAAACCATTATTACCTCCGCGCCTCCGGAACGTAGCGGGGGAGGCAGGGGCCTGTTAAGAAAGGccctgtc > 2:763292/1‑282 (MQ=255) cGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTggg > 1:94546/1‑289 (MQ=255) gTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGt < 1:763292/289‑1 (MQ=255) tgtacGTTCGAAACGATGGTGATGTCTCCGCTGGCAGGCTATGTGATTGAACGCGTACATGCCGGATTGATGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATAATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGt < 2:800347/284‑1 (MQ=255) tGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca < 1:1638998/214‑1 (MQ=255) tGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca > 2:1638998/1‑214 (MQ=255) cggacGTTAGCAACGGTGGTGATGGCTCCTCTGGCAGGCTATTTGATTGAGCGCGTACATGCAGGTTTGCTGGGGGTTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATGATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGt < 2:1720824/284‑1 (MQ=255) ggCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCa > 1:1378027/1‑289 (MQ=255) ggCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCa > 2:1349929/1‑289 (MQ=255) cGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGt > 2:687889/1‑260 (MQ=255) ggCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATg < 1:59025/289‑1 (MQ=255) tATTTGATTGAACTCGTACATGCAGGCTTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGTGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAAt < 1:1162674/288‑1 (MQ=255) tATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAAt < 1:5364/288‑1 (MQ=255) aTTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACca > 1:172797/1‑172 (MQ=255) tttGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGGCCTGAGGCTAAATCAg > 2:33301/1‑289 (MQ=255) gattgaACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGttt < 1:33301/289‑1 (MQ=255) gattgaACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGttt < 1:3498/289‑1 (MQ=255) tgaACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGga < 1:830845/289‑1 (MQ=255) aaCGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTgg < 2:1145911/286‑1 (MQ=255) cgTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGt < 1:250561/235‑1 (MQ=255) cgTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGt > 2:250561/1‑235 (MQ=255) tACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGcggcgcggcg > 2:1780735/1‑251 (MQ=255) cTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTctcgc > 2:165282/1‑285 (MQ=255) aGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCg < 1:1349929/289‑1 (MQ=255) gttgttCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGc < 2:1286405/288‑1 (MQ=255) ttCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca < 1:1135214/127‑1 (MQ=255) ttCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACcaca > 2:1135214/1‑127 (MQ=255) atGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑g < 1:912580/289‑1 (MQ=255) atGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑g < 2:1733941/289‑1 (MQ=255) atGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑g < 1:733480/289‑1 (MQ=255) tGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑Gt > 1:47231/1‑289 (MQ=255) cTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGGCTCGCTGATGGTTGCGGCTATTTTGGCA‑GGGAt > 2:231806/1‑289 (MQ=255) cGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCg > 1:634862/1‑178 (MQ=255) cGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCg < 2:634862/178‑1 (MQ=255) cGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGGGGCTATTCTGGCA‑GTGAtt > 1:1800588/1‑287 (MQ=255) ggggCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATtgct < 1:823658/289‑1 (MQ=255) tCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCa < 1:1791574/289‑1 (MQ=255) cccTGGTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAg < 1:165282/289‑1 (MQ=255) ggTTCTGCTGCCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGt < 1:955882/289‑1 (MQ=255) cttgttgcCCGCGTCACCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGttt < 2:139805/283‑1 (MQ=255) gcgtcaccggcgcttatCAATTTTAGCTGGCCGGTGATCTTATTTGGTGCTGCATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCGCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTc < 2:47231/275‑1 (MQ=255) gtcaccTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACt < 2:556865/282‑1 (MQ=255) cTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGCTGGCTGCGGCCATTCTGGGAGGTGTTGTCTCTCTG‑GTCAGTTGTTTATGTATCCCTCAGcccac > 2:1163560/1‑286 (MQ=255) gATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCa > 2:261327/1‑289 (MQ=255) attatCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATaaa > 1:572345/1‑289 (MQ=255) tCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATaaaaaaa > 1:203819/1‑289 (MQ=255) tCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCCCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGAGGCTAAATCGGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCCCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGGGGTTTACGTATCCACCAGCCACCACCCAGGGCATaaaaaaa > 2:1647252/1‑289 (MQ=255) ccGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGATTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCCCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGTCGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GGGATTGCTGCCTGGGTCAGTGGCTTACGTATCACCCAGCCACGATCCCGGGTATacacaaaacacg > 2:179589/1‑284 (MQ=255) cgatatccTTTTGTGGTGCTGGATTTGGCTTATCCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGGTAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTTATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGcgcg < 2:657768/281‑1 (MQ=255) ttgtCTTATTGGTTGCGGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCGCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑Cg < 2:94546/285‑1 (MQ=255) tgatCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGa > 1:1607195/1‑289 (MQ=255) aTGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTAc > 2:838715/1‑113 (MQ=255) aTGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTAc < 1:838715/113‑1 (MQ=255) ggtgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGAcgcg < 2:1732444/288‑1 (MQ=255) gtgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCATCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACg > 1:1016041/1‑235 (MQ=255) gtgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCATCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACg < 2:1016041/235‑1 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTc < 2:664940/223‑1 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTc > 1:664940/1‑223 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCa > 1:659254/1‑247 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCCGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtt > 2:1297579/1‑289 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtt > 1:1733676/1‑289 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtt > 1:1247296/1‑289 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtt > 1:1399345/1‑289 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtt > 1:237637/1‑289 (MQ=255) tgCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTATGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtt > 2:1074793/1‑289 (MQ=255) gCTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCttt > 1:1369524/1‑289 (MQ=255) cTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGcc > 1:143234/1‑215 (MQ=255) cTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGcc < 2:143234/215‑1 (MQ=255) cTGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtttt > 1:325929/1‑289 (MQ=255) tGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtttt < 1:509927/288‑1 (MQ=255) tGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCtttt < 1:1163560/288‑1 (MQ=255) tGGATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTATGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCttttt < 1:1074793/289‑1 (MQ=255) ggATTTGGCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCTTTTTa < 1:1188548/289‑1 (MQ=255) ggCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCC‑GTGATTGCTGCCTGTGGCAGTGGTTTACGTATCCCTCAGCCACGGTACAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGTACAGGACGCGCGTTGTATCAttt > 2:552538/1‑289 (MQ=255) ggCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTTAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAACGCGTCCGAT‑AGGACGCGCTTTTTAGGAttt > 2:813595/1‑289 (MQ=255) ggCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCTTTTTAGTAttt > 1:1550392/1‑289 (MQ=255) ggCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑AGATCAGGACGCGCTTTTTAGTAgtt > 1:54701/1‑289 (MQ=255) ggCTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCGGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGCTTGCTGCCTGTGTACGTGGTTTACGGATCCATCAGCCACCATCCAGGGCATAAAAAAAACGCGT‑CGACGAGGACTCCACGTTTAGTAttt > 2:72549/1‑289 (MQ=255) cTTATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCTTTTTAGTATTTa < 2:1369524/288‑1 (MQ=255) ttATTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑TGAGCAGGACGCGCTTTTTAGTATTTACt < 1:1612375/289‑1 (MQ=255) aTTCCAGTCACCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCAAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCTCGCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTTCCTGTGTCAGTGGTTTAAGTATCAATCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGGTCGG‑CGAGCAGGACGCGCATTTTAGTCTTTagt > 2:122427/1‑285 (MQ=255) ||| TGGCAATGGTTTCCCTGCCCTTTTACCTGCAAACCGTGCTCGGGCGTAGTGAAGTCGAAACAGGTTTACTTCTGACACCGTGGCCGTTAGCAACGATGGTGATGGCTCCGCTGGCAGGCTATTTGATTGAACGCGTACATGCAGGATTGCTGGGGGCTTTAGGGTTGTTCATCATGGCTGCGGGGCTTTTTTCCCTGGTTCTGCTGCCCGCGAGTCCTGCGGATATCAATATTATCTGGCCGATGATCTTATGTGGTGCTGGATTTGGCTTATTCCAGAGTCCCAATAACCACACCATTATTACCTCCGCGCCTCGCGAACGTAGCGGTGGAGCCAGTGGCATGTTAGGAACGGCTCGTCTACTGGGTCAGAGTAGCGGCGCGGCGCTGGTGGCGCTGATGCTAAATCAGTTTGGAGATAATGGTACACACGTCAGCCTGATGGCTGCGGCTATTCTGGCA‑GTGATTGCTGCCTGTGTCAGTGGTTTACGTATCACTCAGCCACGATCCAGGGCATAAAAAAAGCGCGT‑CGATCAGGACGCGCTTTTTAGTATTTACT > CP042583/1591795‑1592352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |