Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,644,100 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,644,100 | 0 | A | T | 100.0% | 655.1 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (135/143); total (135/143) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,644,101 | 0 | G | C | 99.6% | 646.5 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (135/141); total (135/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,644,102 | 0 | C | G | 99.6% | 661.3 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (134/143); minor base T (1/0); total (135/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTAGCCGAGCATCCTGCAGCGCGAAAAGAGTTATTGCCAGTAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCTTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGGCTCATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCAC > CP042583/1643820‑1644380 ||| aGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTAt < 1:57166/289‑1 (MQ=255) ggACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAATAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTTCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGATCATCCTGCTCTGCGAACAGAGTTAtt > 2:1101256/1‑288 (MQ=255) ggACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTAtt > 2:203002/1‑288 (MQ=255) cacaTCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGcct < 2:671560/289‑2 (MQ=255) acaTCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGcctc > 1:900100/1‑287 (MQ=255) caTCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTAt < 1:1689847/282‑1 (MQ=255) caTCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGcctca > 2:983173/1‑286 (MQ=255) caTCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGcctca > 2:1542518/1‑286 (MQ=255) tCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGcctcaag < 1:491480/289‑6 (MQ=255) tttAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAg > 1:989450/1‑289 (MQ=255) ttAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTTCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAgg < 2:821135/289‑1 (MQ=255) ttACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGa > 1:1738035/1‑289 (MQ=255) aCTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGAtg < 1:1503724/289‑1 (MQ=255) ctcGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTAt > 2:1240102/1‑266 (MQ=255) tcGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCt < 1:1801643/289‑1 (MQ=255) gCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGt > 1:187641/1‑289 (MQ=255) cGACCCGGAAAGGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACGTATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGtt < 2:168924/289‑1 (MQ=255) cGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAAGTACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCTTCCTCCTCGGCGCAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTATTTCCACt > 2:1880053/1‑289 (MQ=255) gAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACtt > 2:913083/1‑288 (MQ=255) gAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACtt > 1:601386/1‑288 (MQ=255) aTGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACgg < 1:213186/289‑1 (MQ=255) aTGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCAGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACgg < 1:808085/289‑1 (MQ=255) tcaatTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCTCTTACGGGAGTTTaa > 2:684226/1‑289 (MQ=255) tcaatTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTa > 2:961063/1‑288 (MQ=255) tcaatTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTa > 1:1135856/1‑288 (MQ=255) gcgcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTTCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTAc > 1:1021103/1‑289 (MQ=255) gcgcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTa > 2:594677/1‑288 (MQ=255) gcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGc > 1:42901/1‑289 (MQ=255) gcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGc > 1:751180/1‑289 (MQ=255) gcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGc < 1:636178/289‑1 (MQ=255) gcCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGc > 1:1238278/1‑289 (MQ=255) ccGATGCTTGAAGATTTAAGCAGCGTGAAGCATGAACAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGCTGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCa < 2:247315/289‑1 (MQ=255) attACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGt < 1:44325/288‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTa > 1:1106069/1‑288 (MQ=255) tGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTa > 1:1245762/1‑288 (MQ=255) aTGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATc > 2:1771782/1‑288 (MQ=255) gaagaaACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGGGTTCTTTCCCTACGGTAGGTCGATGTGCTGTTAGTTACACTTACGGGGTATTAACTGCTCCTACCAACTCTTTGGCAAGGTAGCACCTTTATccctct > 2:1021611/1‑282 (MQ=255) agaaACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGctgctg > 1:1435620/1‑289 (MQ=255) aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACt > 1:1143284/1‑218 (MQ=255) aGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCcgcg < 1:983173/289‑1 (MQ=255) tCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTcg < 2:1106069/289‑1 (MQ=255) cTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTcgc < 1:780229/289‑1 (MQ=255) tAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTAt < 1:1542518/287‑1 (MQ=255) tAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTAt < 1:255883/287‑1 (MQ=255) tAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTAt < 1:961063/287‑1 (MQ=255) gATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAgg > 2:1150831/1‑289 (MQ=255) tGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGt < 1:1592378/288‑1 (MQ=255) cGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGaa < 2:1509015/271‑1 (MQ=255) aTCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGa > 1:1404256/1‑289 (MQ=255) aTCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGa > 1:135090/1‑289 (MQ=255) cccGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCCGGCTTTCCGCGCTTCGGGGAACTATCTGCTTTAGGTCGTCAATGaa > 2:18164/1‑288 (MQ=255) ccGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGc < 2:751180/289‑1 (MQ=255) cGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGc > 2:1136963/1‑288 (MQ=255) tGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAg > 2:1641828/1‑219 (MQ=255) tGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACt > 2:1844345/1‑288 (MQ=255) cGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATGTCGGTTTGGTGATGTGCGGTAATCACAATCTCAGGTTCTTTTGGCGATCATCCTGCTTGGCGGAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGGGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTGTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCa < 2:899219/287‑1 (MQ=255) tATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCCCTAATGAAGCACTACCGCCAGTGGtt > 2:179149/1‑289 (MQ=255) ttGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTaa > 1:16051/1‑289 (MQ=255) tACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGt > 1:68133/1‑254 (MQ=255) tACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCg > 1:734556/1‑289 (MQ=255) cGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTTGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGGTAATATCGtt > 1:924758/1‑289 (MQ=255) aGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTc > 1:948808/1‑288 (MQ=255) aGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATa > 2:30612/1‑289 (MQ=255) aGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATa > 1:460045/1‑289 (MQ=255) aCATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTcgc < 1:1765490/218‑1 (MQ=255) aCATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTcgc > 2:1765490/1‑218 (MQ=255) aCATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACg < 1:1298466/287‑1 (MQ=255) aCATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGt > 2:1372976/1‑288 (MQ=255) gAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCCAATGAAGCACTCCTGCACGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCAttt > 2:1298466/1‑287 (MQ=255) tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATg > 1:167035/1‑288 (MQ=255) tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGa < 2:1233123/289‑1 (MQ=255) tGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCT‑ATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGAc < 1:1914101/289‑1 (MQ=255) tcatTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACg > 2:1385769/1‑289 (MQ=255) catTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGaa < 1:591239/194‑1 (MQ=255) catTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTCATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGTATTACGGTAAATActt > 2:1205620/1‑287 (MQ=255) cGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGc < 2:1248923/289‑1 (MQ=255) ttttGGTAGTTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCa < 2:1709250/288‑1 (MQ=255) aTTTGGTGATTTGCGGTATTCACAATCACATTTTCTTTTCGCGGGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCa < 2:602573/289‑1 (MQ=255) aTTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACATTTTGTACTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGCGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGTTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGcc < 2:737817/288‑1 (MQ=255) aTTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGcc > 2:903977/1‑288 (MQ=255) gTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCa < 1:613231/284‑1 (MQ=255) gTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAgcgac > 2:782581/1‑285 (MQ=255) taTTTGGTGTAATCACAATCACAGTTTCTTGTCGCGCACATCCTGCTCGGCGAAAATAGTTATTTCCTCAAGTTAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCAATTACGGGAGCTTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAgcgaca < 2:359084/287‑6 (MQ=255) gATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAgcgacat < 1:1254161/289‑7 (MQ=255) ttGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGt < 1:1385769/289‑1 (MQ=255) ttGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGt < 1:1210174/289‑1 (MQ=255) ttGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGt < 1:153005/289‑1 (MQ=255) ttGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGt < 2:1124292/289‑1 (MQ=255) gCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCa < 2:443150/289‑1 (MQ=255) cGGTAATCACACTCACAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCCAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCGAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCa < 2:380054/288‑1 (MQ=255) aatcacaatcacAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCa < 2:51283/289‑1 (MQ=255) aatcacaatcacAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCa < 1:30612/289‑1 (MQ=255) aatcacaatcacAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCa < 2:803078/289‑1 (MQ=255) aatcacaatcacAGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTGATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTACCCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCa < 2:556263/289‑1 (MQ=255) aatcacaataacAGTTTGTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTAGTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCa < 1:864718/289‑1 (MQ=255) caatcacaGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATc < 2:1435620/289‑1 (MQ=255) cacaGTTTCTTTTCGCGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAgc > 1:746279/1‑289 (MQ=255) tcttttcgcGAGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTg < 1:109305/281‑1 (MQ=255) aGCATCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTc > 1:1079884/1‑289 (MQ=255) aTCCTGCTCGGCGAAAAGAGTTATTGCCTCAAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCCTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGCGACATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCAc < 2:1599001/288‑1 (MQ=255) ||| GCCAGTAAAGGGACACATCAGTTTAATTACTCTCGCTTCCGACCCGGAAATGTACAATCAATTAGCTGCGCCGATGCTTGAAGATTTACGCAGCGTGATGCATGAAGAAACGCAAAGCTTTCTTGATAAGTTAATTCAGGATGCGGGGTATCCCGTTGACAAGACGTTTATTGCCTACGGTGAGTTAAGCGAACATATTCTGGAAGTATGTCACAAGCATCATTTCGATTTGGTGATTTGCGGTAATCACAATCACAGTTTCTTTAGCCGAGCATCCTGCAGCGCGAAAAGAGTTATTGCCAGTAGTGAGGTCGATGTGCTGTTAGTTCCACTTACGGGAGATTAACCGCTCTTACGCAAGCTTTGGAAAGGTAGCAACTTTATCGCGCTGCTGGCTTTCCGCGCTTCGCGGAACTATCTGCTTTAGGTCGCTAATGAAGCACTCCTGCCAGTGGTTAATATCGTTTTTCACGATAACGTCCAGCATTTCTGCATGACGGGAAATACGTTCCGCCAGGCTCATAGTCAATGCACGATCCAGCGCAGCTGCAACTTCGTCAC > CP042583/1643820‑1644380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |