Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,697,823 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,697,823 | 0 | A | T | 100.0% | 551.9 / NA | 232 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (138/94); total (138/94) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,697,824 | 0 | C | G | 99.6% | 541.2 / NA | 232 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (137/94); total (138/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,697,825 | 0 | T | A | 100.0% | 546.0 / NA | 232 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (138/94); total (138/94) |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
TCAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGACTGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATACTTTCCAGCGTCAATGGACTAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGAACCTCCGGGAAAAGTTCGCGAAAAGCTTTAAT > CP042583/1697552‑1698104 ||| acAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATcc > 1:965263/2‑288 (MQ=255) acAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTCAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATcc > 1:1583078/2‑288 (MQ=255) acAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGATGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAAACAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAACTCTCTTCCCCTTATTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCATGCTCAAGAGCAACCTAGGTGTTAATGACATCAGAATCCTGCTCACTTGATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGAAACTGCGTCATCAATACGTGAGCCCCCCGTAATct > 2:524287/2‑287 (MQ=255) aGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATcc > 1:322609/1‑286 (MQ=255) aGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATcc > 1:1052824/1‑286 (MQ=255) ccTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATCGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCTATCCCAAGCCCAATAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTg < 2:130108/287‑1 (MQ=255) ccTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGt < 1:1740192/288‑1 (MQ=255) ccTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTc > 2:1772521/1‑289 (MQ=255) ttACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAg < 1:513064/289‑1 (MQ=255) cAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATccc < 1:1735293/275‑1 (MQ=255) cAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGa > 2:1626624/1‑289 (MQ=255) gAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATCAGTGAGCGCCCCGTACACCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGcc > 2:1639274/1‑288 (MQ=255) aaaGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTACTCGCGTAAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAATAGATGCCGCGTATCCATGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACAAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAAGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATAAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCa < 2:1263185/288‑1 (MQ=255) cgcCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTc > 1:202679/1‑288 (MQ=255) cgcCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTc > 1:1866671/1‑288 (MQ=255) cgcCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTc > 2:41660/1‑288 (MQ=255) cATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCtat < 1:41660/286‑1 (MQ=255) tACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCtattgattcc < 1:1802219/287‑8 (MQ=255) aaGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAAt > 1:1237627/1‑289 (MQ=255) gTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATgg > 2:1226076/1‑289 (MQ=255) tGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGCCAGTATTAGCATCATAAAGATGACGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCACCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATggt < 2:534022/288‑2 (MQ=255) tCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATggtgaa > 2:1197571/1‑285 (MQ=255) tCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATggtgaaatt < 1:1850165/289‑8 (MQ=255) tCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGt < 1:1557374/289‑1 (MQ=255) tCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGt < 1:1513741/289‑1 (MQ=255) tCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGt < 1:1197571/289‑1 (MQ=255) cccAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAgg < 2:965263/289‑1 (MQ=255) cAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGTTCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGga < 2:61405/289‑1 (MQ=255) aCCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGgatg > 1:524408/1‑289 (MQ=255) aCCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGgatg < 1:467529/289‑1 (MQ=255) ttAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGATCGCCCCGTAATCCCCTGCCGGTAACTGATTCACGGCCATTTCGCTTTTGATTCCACTGTCAATGGTAGCATTTGCGTCAACGGACAACCGTGT‑GGac > 2:1138737/1‑288 (MQ=255) ttAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTGAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGaa < 2:980531/289‑1 (MQ=255) gCATCCAAAAGATGACGCTTTACCAGGCGTATTAAATTTTCTTCCTTTGGTTCGCCACTGGATTGCTCTGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGGGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATAGCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACaa < 2:510671/289‑1 (MQ=255) aaaaaGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCaaa > 1:447799/1‑289 (MQ=255) aaaaaGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCaa > 1:76801/1‑288 (MQ=255) aaaaaGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCaa > 1:1079590/1‑288 (MQ=255) aTCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGa < 2:1653827/289‑1 (MQ=255) cAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAAc < 1:1587415/289‑1 (MQ=255) gCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCAc > 2:1389287/1‑289 (MQ=255) aTTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTCAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCACTGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCACACTATGGTCCCAACGAACCCCCGGGa > 2:1417922/1‑289 (MQ=255) aTTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGcg < 2:405616/289‑1 (MQ=255) ctTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGcgacga > 1:115169/1‑288 (MQ=255) tctTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCg < 1:717913/289‑1 (MQ=255) tctTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAAGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCg < 2:1736626/289‑1 (MQ=255) ctTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCgg > 2:336561/1‑289 (MQ=255) tGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGt < 2:444284/289‑1 (MQ=255) tGTTCGCCACGGGTGTGCTCGTCAACTAATCCCATCCCAAGCCCAACAGCAACATAGGTTTTAATGACTTCAGAATCCTGCCAACTTAATCCAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGTCAAAGGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGt < 2:857179/289‑1 (MQ=255) gTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTc > 1:56711/1‑289 (MQ=255) tCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCAt > 1:1268702/1‑289 (MQ=255) cTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGTTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACTAGCTGCGGGCCATTACTCAAAcgatc > 2:74949/1‑288 (MQ=255) cTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAAcgctc > 1:1787754/1‑288 (MQ=255) cTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAAcgcta > 1:120833/1‑287 (MQ=255) cTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGAAGAGCTGCGGGGCATTACACAAAcgctc > 1:1402736/1‑288 (MQ=255) cAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGc > 2:688649/1‑289 (MQ=255) aaCTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATCGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCg < 2:1002204/289‑1 (MQ=255) tCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACTAATATc > 1:1206768/1‑289 (MQ=255) tCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATc > 2:1050049/1‑289 (MQ=255) aagcccaagGACAACATAGGTTTTAATAGCATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAAGAGCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCt < 2:1014798/289‑1 (MQ=255) gcccaagAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATAc > 2:1572365/1‑276 (MQ=255) caagAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGTGGGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTCCTCAAACGGCCGCTGGCGAACACAATATCAACTTcc > 2:1604129/1‑287 (MQ=255) aagAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTTCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCCTTACTCAAACGCTCCCCTGCGATACCAATATCCGCATCCCCa > 2:1077207/1‑289 (MQ=255) agagCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTCTGCGGGCAAATGCGTCATCAATAAGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTACTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCCTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCTACGAGCTGCGGGCCATTACTACAACGATCCCTGGCGATGCCAATAACAGCTTCGccct > 2:694779/1‑287 (MQ=255) aCATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAg > 1:477774/1‑230 (MQ=255) aCATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATACCAGCTTCGCCATTTTGca > 2:1869139/1‑289 (MQ=255) cATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGt > 2:6867/1‑237 (MQ=255) cATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGt < 1:6867/237‑1 (MQ=255) aaTGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCa > 1:1001337/1‑289 (MQ=255) aaTGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCa < 1:125533/289‑1 (MQ=255) cATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAAttt > 1:372664/1‑288 (MQ=255) aTCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAAttt > 2:1342538/1‑287 (MQ=255) atacTGCGCACTTTATACAAGGTCTGCCAGCAAACCTTGGCGGGCAAAGGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGc < 2:1266488/286‑1 (MQ=255) aTCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGc < 2:1582678/289‑1 (MQ=255) aTCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTAATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCtgtg < 2:202679/287‑1 (MQ=255) aTCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCCTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGc < 2:767699/289‑1 (MQ=255) tCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCg < 1:1525725/289‑1 (MQ=255) tGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTc > 1:546524/1‑288 (MQ=255) tGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTc > 1:1888361/1‑288 (MQ=255) tGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTc > 1:273780/1‑288 (MQ=255) gcgcACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTccc < 2:1692237/289‑1 (MQ=255) gcgcACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTccc < 1:592757/289‑1 (MQ=255) cgcACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTccc > 1:1113291/1‑288 (MQ=255) cgcACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTcc > 1:1665222/1‑287 (MQ=255) agaaCTTCATACACTACCTGCCAGTATACCCTTGCGGGCAAATGCGACATGACGCCGTGAGCGCCCAGCAGTCCCGTGTCGGTACGTGATTAACGGCCACTTCGGTATGGATTACAGCGTAAATGGTGAAATGTTCGTAAAGGGATGATCGTGT‑GGAGCAACCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAACCGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTccc < 2:603173/285‑1 (MQ=255) cTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGa < 1:855362/289‑1 (MQ=255) aaTACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTa > 2:1440242/1‑289 (MQ=255) aCAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCt < 1:1031260/289‑1 (MQ=255) atatCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGc < 1:1428817/270‑1 (MQ=255) atatCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCCATAACAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGAAATTTCCTGTGGATGCCCCTGGAttctctcac > 2:1810861/1‑282 (MQ=255) tatCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GG‑ACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCg > 1:1655346/1‑235 (MQ=255) atCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAg > 1:1364785/1‑288 (MQ=255) atCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAg > 2:14658/1‑288 (MQ=255) atCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAg > 1:883442/1‑288 (MQ=255) atCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAg > 1:338807/1‑288 (MQ=255) cTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGGTACCAATATCAGCTTCGCCATTCTGCAACAATGTCGCa < 1:1626897/254‑1 (MQ=255) gCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGa > 1:1097866/1‑288 (MQ=255) gCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGa > 1:25333/1‑288 (MQ=255) cAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCTCAATTCCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGAAccctc > 2:578550/1‑286 (MQ=255) cAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGAACCTcc > 1:1594335/1‑289 (MQ=255) tGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGAACCTCCGGGAAAAg > 2:715788/1‑289 (MQ=255) tcaATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGAACCTCCGGGAAAAGTTCGCGAAAAGCTTTaa < 1:63361/289‑1 (MQ=255) ||| TCAGTCCTGCATTACAAAGTTCCAGAAAGCGCCAGACATAGTTACGCTGAAGTTGTCCTCGCTTCAGTCCCAACCAGACAGTATTAGCATCAAAAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGACTGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATACTTTCCAGCGTCAATGGACTAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGT‑GGAACAAGCAAACTATGGTGCCAACGAAACCACGGGAAGGCGACGAGCTGCGGGTCATTACTCAAACGCTCGCTGGCGATACCAATATCAGCTTCGCCATTTTGCAACAATGTCGCAATTTCCTGTGGCGTCCCCTGGATTAGCTCGAGCCGAACCTCCGGGAAAAGTTCGCGAAAAGCTTTAAT > CP042583/1697552‑1698104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |