| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 1,722,499 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,722,499 | 0 | A | T | 99.5% | 450.6 / ‑4.1 | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| * | CP042583 | 1,722,500 | 0 | C | G | 100.0% | 442.5 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (81/107); total (81/107) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,722,501 | 0 | T | A | 100.0% | 451.3 / NA | 188 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (81/107); total (81/107) | |||||||||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
AGTACGCCACGCGCATCGCCAGGTAGGTGTTTGCAAAAAGTTTAATCGCTTCTGCTTCAGTGGAGTCGGTAAACAGCATCGGGATATTTTGCTTAATCGCGCCTTCCTGTAACAGAGCAGCGAAACGTTCTGCGCGTTCACTACGCTCACCGATGACAATACGACTAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTATGCATCGCTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGTACTTTTGATGACCATAACCGCATAAGGATTTATCTCAACTACGTCTTTAATTACACTTTCTACACTGGATGTATTGAAATAATTAGTTTTAGGATCATAGTCGGTTGGAGTGGCGATGATGACATAATCAGCATCCCGGTAGGCTTCATTTTTATCTAATGTGGCATTAAAGTGTATTTTATCACTTTGCAAAAACTGCTGAATTTCCTTATCAACAATAGGAGATATCCGATCATTCAGCATAGCAACGCGACTCGGTAAAATATCTAATGCCAC > CP042583/1722219‑1722774 ||| aGTACGCAACCCGCATAGCCAGGTACGTGTATGCAAAAAGTTTAATCGCTTCTGCTTCAGGCGAGTCGGTAAACAGCATCGGGATATTTTGCTTAACCTCGCCTTCCTGTAACAGGGCAGCGAAACGTTCTGCGCGTTCTGAACGCTCACCGATGACAATACGTGAAGGATGGAGATTATCGTAAAGGGCTTTACCCTCACGGAGAAATTCCGGGGAGAATATAATATTTTCAGTGCGATATTTCTTAGGCATCGCTGCGGTAAAACCAACGGGAACCGttgatttgat < 2:630614/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |