Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,730,664 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 1,730,664 | 0 | A | T | 99.5% | 494.6 / NA | 207 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,730,665 | 0 | G | C | 100.0% | 495.2 / NA | 207 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (109/98); total (109/98) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,730,666 | 0 | T | A | 99.5% | 492.1 / NA | 207 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (108/98); minor base C (1/0); total (109/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
TGAGCTGTAGCCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCAGCCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGAGCCTGATGATGGCCGCGGATCCCTC > CP042583/1730389‑1730944 ||| ttcgcTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCTTTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTg > 2:786977/5‑289 (MQ=255) 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tccatccTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGt > 2:1536422/1‑289 (MQ=255) atccTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTAt < 2:132623/289‑1 (MQ=255) tGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCATCAATATTGTTGAAGCCGTGGTCGGGGCAGTGCTGCTACGTAAATTGCTGCCGTGGTATAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTaa < 2:733634/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |