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Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (133/99); minor base T (1/0); total (134/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,730,804 | 0 | C | G | 99.6% | 545.3 / NA | 233 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (132/99); total (134/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TAACCCCTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACGGTGATGATGGTGAGCCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCG > CP042583/1730525‑1731081 ||| cTTGCAAAATCTGGCTGACTGGCTGCGTCTGGCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCg > 1:608697/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |