Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,730,919 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,730,919 | 0 | A | T | 99.6% | 631.1 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (152/114); minor base G (0/1); total (152/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,730,920 | 0 | G | C | 100.0% | 625.2 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (152/115); total (152/115) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,730,921 | 0 | C | G | 99.6% | 620.0 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (150/115); total (152/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGAGCCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAGG > CP042583/1730639‑1731198 ||| ttttGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCcgc > 2:1120284/1‑289 (MQ=255) ggTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGAtccctc > 1:865745/1‑288 (MQ=255) actgtcagAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATccctccct < 1:827569/281‑1 (MQ=255) agAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGTATCCCTCCCctcttgc > 2:732641/2‑288 (MQ=255) tCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgc < 1:686228/289‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgcc < 1:606846/289‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgcc < 1:706093/289‑1 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgccgc > 1:1909544/1‑288 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTAAATGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTTCTGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCAACAAACGGAATCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGAGGGTTTCGCGTATGATGGCCGCGGAGCCCTCCCTGACAGCTActccg > 2:1525001/1‑287 (MQ=255) tctGGCATGGGGGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACCCTATCTGCTGCGCCATCGCAACCTACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGCCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTTGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCgtacgtac < 2:621987/289‑1 (MQ=255) aCTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat < 1:718207/288‑1 (MQ=255) aCTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCtgat < 1:1641713/288‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTTCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGc > 2:1226982/1‑288 (MQ=255) gTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGc > 2:477813/1‑288 (MQ=255) gTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGc > 1:1695220/1‑288 (MQ=255) gTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGACTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTCTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGGTGATGCCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGCACTGACCTGATGAGcc > 2:1385364/1‑289 (MQ=255) tGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGcc < 2:536846/288‑1 (MQ=255) gCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTTGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCTCTGATGATGGCCGCGGCTCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTTCGTCCCTGATGAGCCat > 2:1539379/1‑289 (MQ=255) gCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGACGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGAGGATCTCTCCCTTCTTGCTAACCCGCGTGTGTTCGTGGTGATCCat > 2:1211558/1‑289 (MQ=255) gCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCat < 1:1776999/289‑1 (MQ=255) cGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCatat > 1:1040/1‑289 (MQ=255) cacaCTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGttttt > 1:1197572/1‑286 (MQ=255) tCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCct > 1:1002620/1‑288 (MQ=255) tCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCct > 2:676709/1‑288 (MQ=255) gctgcGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGATTGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCctgctg < 1:987296/289‑1 (MQ=255) tgcGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCtgctgc > 2:694387/1‑288 (MQ=255) gcgcCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGccc > 1:832920/1‑289 (MQ=255) gcCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCg < 1:1284967/288‑1 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTCCGTACCGGATGGGACATTTGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCGTCTGCCCGccc > 2:1895/1‑288 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGcc < 1:363906/288‑1 (MQ=255) cATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCa > 2:610169/1‑289 (MQ=255) aCCCACGGTTGCTTTTTGCGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGAAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAAcatcat < 2:1448852/289‑1 (MQ=255) ccACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGa < 1:1100214/289‑1 (MQ=255) cGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTGGCCATCAACCTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCa < 2:1473695/289‑1 (MQ=255) ttGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCTTTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATg < 2:1289575/288‑1 (MQ=255) tGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGt > 1:29430/1‑289 (MQ=255) ttttGAGTCGCTGCTAACGTTAGCCAGAACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATg < 2:1040/289‑1 (MQ=255) tttatccgcTGCTCACGTTATCCATCACCCTGACGTTTAGCTGGCGTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCATCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTa < 2:248333/281‑1 (MQ=255) aGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTTCCCCCCAACATCCTGACCAGGGTGATGTATGCCTTTCGTGTGGAAccg > 2:1169617/1‑287 (MQ=255) tCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAac > 1:782379/1‑288 (MQ=255) tGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATGTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATTTATTCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACAttt > 1:443640/1‑288 (MQ=255) tGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATTACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTTCGGAACGCAAACACAttt > 2:522254/1‑288 (MQ=255) aCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCTCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCg > 1:272276/1‑289 (MQ=255) aCGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCg > 2:577503/1‑289 (MQ=255) tAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGaaa > 1:916075/1‑288 (MQ=255) aGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTAcgcc > 2:884776/1‑167 (MQ=255) aGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACACCATGACCATGGTGATGGATGCCTTCCGTGCGGAACGCAAAAACCTTTcctcaagtg > 2:1804931/1‑282 (MQ=255) ggctttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCCTGACCATGGTGATTTATGCCTTTCGTTCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGaaa > 2:507053/9‑288 (MQ=255) ggctttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTTCGGAACGCAAACAAATTTCCGAAAGCGgaa > 2:445685/9‑288 (MQ=255) ggctttcgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCACGCACATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACAGTTCCGACAGCGaaa > 2:1697493/9‑288 (MQ=255) cgaTGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACtt > 1:1798678/3‑289 (MQ=255) tATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAcg < 2:808724/289‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATTAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAAAACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAAGCGATg > 1:75170/1‑289 (MQ=255) gTGGCCTTTCACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCAGCGCGTCTGCCACGACTGGCAGCCTTTTTGATCTTCCTTCCCACG‑GTGATGATGGTGTCGCCGATGATGGCCGCGGCGCCCTCCCTGCTTGCTACGCTGCGTACGTACCTGACGAGCCATATCCCGTGGCTCACGTCTTTGCTGCTACTGCAGTCCGCCAACATCATGACCATGGTGCTGTATGCCTTTCGTGCCGAACGCAACCACACTTCCGAAAGCAAAACCCCATTCAGGAAcgccgtgg > 2:1107598/1‑282 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGa < 1:906172/256‑1 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAata > 1:1751415/1‑289 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAata > 1:1571093/1‑289 (MQ=255) ggCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCCACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAata > 2:235716/1‑289 (MQ=255) ggcctttACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGTCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAatat > 1:1072725/5‑289 (MQ=255) aCTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCTTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTa < 1:1345260/289‑1 (MQ=255) tCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCgg > 1:1492477/1‑289 (MQ=255) cgtattGTGCTGTTGCTGTGGAGCGCCGTGCCTCTGGCACTAATGGAAGACTTTTTGCTCTGCCTTACCTCG‑GTGCTGATGGTGTCGCTGAGGCAGGCCGCGGACCCCCCCCTGCTCGCTACGCCGCGTACGGAGCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGCTCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATCGAATATTCCGCTATCGGTa < 2:418911/287‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa < 1:1174778/289‑1 (MQ=255) attattGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTa > 1:677893/1‑289 (MQ=255) ttattGTGCTGTTGATGTGGAGGGCCGTGCGTCGGCCTCGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGTTCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTAt < 2:1654959/289‑1 (MQ=255) tgtgCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:930766/289‑1 (MQ=255) tgtgCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:1109412/289‑1 (MQ=255) tgtgCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCg < 1:51885/289‑1 (MQ=255) cTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAg > 1:337110/1‑289 (MQ=255) tGATTTCGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGCTCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGGGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTggg < 2:33218/289‑1 (MQ=255) tGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACA‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTggg < 1:646919/289‑1 (MQ=255) tGATGTGGAGCGCCGTGCGTCGGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTggg < 2:1488031/289‑1 (MQ=255) ggAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGa > 1:1121821/1‑289 (MQ=255) gAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAg > 1:1530931/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:1414977/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg > 1:167260/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCCAAAACCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCTGTCTGGCGCTAGTGGGCACCCAggg > 2:1143024/1‑289 (MQ=255) cgcCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAggg < 2:832920/288‑1 (MQ=255) cGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTCCCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTTGGCACCGAGGGACaa > 1:236237/1‑289 (MQ=255) cGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACaa < 2:960972/289‑1 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAcg > 2:91570/1‑237 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 1:565846/1‑289 (MQ=255) tGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATACCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATg > 2:1507752/1‑289 (MQ=255) ccACGGATGGCCGCCTGTGTGATCGTCCATCGCACGCGTG‑TGAGGGTGTCGCTGCTGATCGCCACGGATCCCTCCCCGATTGCTACGCCGCGTACGTACATAATTAGCCATATGCCTTGTCTACCGTTTTTACTGATCCTGCTGCCCGCCAACAGCATGACTATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCTGAACGCAAACACATTACCGAAAGCGAAGCCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGTGGGACTATGGCTGCaa < 2:399812/288‑1 (MQ=255) tttttGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAgcgccc > 2:1902049/1‑286 (MQ=255) tGATCTGCCTTGCCACG‑GGGATGATGGTGTCGCTGATGCTGGCCTCGGGTCCCTCCCGGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGGGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCa < 2:361903/289‑1 (MQ=255) aTCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAAAATTCCGCTATCGGTATGGCCTTAGTGGGCACCGACGGACAATGGCTGCCAACCACCAAATCGCACTTCCAGt > 2:1007257/1‑289 (MQ=255) tCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAAcg > 2:1068542/1‑204 (MQ=255) tACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCggg < 1:1614250/289‑1 (MQ=255) tACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCggg < 1:622905/289‑1 (MQ=255) tACCACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCggg < 1:544903/289‑1 (MQ=255) ccACG‑GTGATGGTGGTGTCGCTGAGGATGGCCGCGGGTCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 2:271139/289‑1 (MQ=255) ccACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 1:1474332/289‑1 (MQ=255) ccACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 1:1226982/289‑1 (MQ=255) ccACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 1:428372/289‑1 (MQ=255) ccACG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTa < 1:484256/289‑1 (MQ=255) cG‑GTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCGGCAAACCAAAAAAGCGCTCTGCCCGCTTCTCGGGTACAg > 2:1614250/1‑289 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTTCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACCCGCTGGAATATTCCGCTATCGGGATGGCGTTAGTGGGCCCCGGGGGACAATGTCTGCAAACCAACAAATCCCTCAGCCGTTTTCTCGGGTACAgct > 2:1730834/1‑287 (MQ=255) gTGATGATGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTtct < 1:246306/278‑1 (MQ=255) tgatgaTGGTGTCGCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCctgctg > 2:1776262/1‑107 (MQ=255) ||| CAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGAGTGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGAGCCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTAGCATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTTCATTATTGTGCTGTTGATGTGGAGCGCCGTGCGTCTGCCACGAATGGAAGCCTTTTTGATCTTCCTTACCACG‑GTGATGATGGTGAGCCTGATGATGGCCGCGGATCCCTCCCTGCTTGCTACGCCGCGTACGTACCTGATGAGCCATATGCCGTGGCTACCGTTTTTGCTGATCCTGCTGCCCGCCAACATCATGACCATGGTGATGTATGCCTTTCGTGCGGAACGCAAACACATTTCCGAAAGCGAAACCCACTTTCGGAACGCGATGGAATATTCCGCTATCGGTATGGCGTTAGTGGGCACCGAGGGACAATGGCTGCAAACCAACAAAGCGCTCTGCCAGTTTCTCGGGTACAGTCAGG > CP042583/1730639‑1731198 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |