Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,744,758 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,744,758 | 0 | A | T | 99.6% | 527.0 / NA | 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (103/124); minor base G (0/1); total (103/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,744,759 | 0 | G | C | 99.1% | 523.2 / NA | 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (102/122); total (103/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,744,760 | 0 | C | G | 100.0% | 537.9 / NA | 228 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (103/125); total (103/125) |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CACCGAAAATACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCAGTATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATAGCCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGAGCGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGATCACCATTCTCAGCACGCTACCCACCGCAGGGGTTGGCGCACTGCTGGCGTTGCTGATTGCTGGTAGCGAACTGGATGTGATTGCGATTATCGGCATTATTTTGCTGATCGGTATCGTGAAGAAGAACGCCATCATGATGATCGACTTCGCGCTGGCTGCTGAGCGCGAGCAAGGCATG > CP042583/1744478‑1745030 ||| ccGAAAATACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTggg < 1:1032934/289‑1 (MQ=255) ccGAAAATACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTggg < 1:878184/289‑1 (MQ=255) ccGAAAATACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTggg < 1:1229533/289‑1 (MQ=255) aaTACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGgcagca < 1:410102/289‑1 (MQ=255) aaTACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGgcagca < 2:1379793/289‑1 (MQ=255) cgcgGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGAtt > 1:1835793/1‑289 (MQ=255) cgcgGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGAtg > 1:941420/1‑288 (MQ=255) gATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATTAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGcggcgg > 2:158435/1‑289 (MQ=255) aCCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCggtgg < 2:1773136/289‑1 (MQ=255) cATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGgtggtg < 1:458367/289‑1 (MQ=255) cATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGgtggtg < 2:157007/289‑1 (MQ=255) ttCGCCTGGCCAGCGGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCGCAATTGCCAAAATTGGGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGc < 2:154331/289‑1 (MQ=255) ttCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAGTTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGc > 1:32638/1‑289 (MQ=255) 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aCGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCAACAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTTCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTCTGGACAACGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCCCACACGCCTTTCAGTTGGCGCGGGGCCGCCACGTCCGGCTGAGTGTCCGGGTCGAGGGTGGCGGTGT‑‑TAGCGTGCGCgg > 2:143204/1‑289 (MQ=255) ggcggcGTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCa < 1:1293554/289‑1 (MQ=255) gcggcgTGGTGCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCa < 2:135452/288‑1 (MQ=255) tgCCGCTAAGCTCAATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACg < 1:1608426/288‑1 (MQ=255) ctaagctcaaTTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCt > 1:1050794/10‑289 (MQ=255) aagctcaaTTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCCCTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCGGGGCATTCTGTACGAGAGCttt > 1:1750440/8‑289 (MQ=255) agctcaaTTGCCAAACTTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTa < 2:1072989/283‑1 (MQ=255) agctcaaTTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTa < 2:745203/283‑1 (MQ=255) ctcaaTTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTAt > 1:1725416/5‑288 (MQ=255) gcaaTTGCCAAAATTGGGCAGCGTTCTGCGCCGCTCTCCATCAACCATATGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTAtt < 2:1232290/285‑1 (MQ=255) aaTTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCa > 1:726055/2‑288 (MQ=255) tcgCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCCCGCCTTCCAGTCGGCGTTGGGCAGACCTGCCTGGCCGATTGG‑TTGTGCTGGGGTTGCGAGTG‑AACTCGTTCTCGGACCTCTGTACGATAGCTTTATTCAcc > 2:1714063/3‑288 (MQ=255) ccAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGCTGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCTCCGGAt > 2:1118513/1‑289 (MQ=255) ccAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGa > 1:521438/1‑288 (MQ=255) cAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATTAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGAt < 1:158435/288‑1 (MQ=255) cAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGAt < 1:989555/288‑1 (MQ=255) tGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCCTTCTTTACGGGGGCTTTATTCACCCGATCCCCAtt > 2:287253/1‑289 (MQ=255) agcGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGATCACCATtctct < 2:86590/288‑2 (MQ=255) 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gcaCCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGATCACCATTCTCTCGACGCTACCCACCGCAGGGGTTGGCGCACTGCTGGCGTTGCTGATTGCTGGTAGCGAACTGGATGTGATTGCGATTATCGGCATTATTTTGCTGATCGGTATCGTGAAGAAGAACGCCATCATGATGATCGACTTCGCGCTGGCTGCTGAGCGCGAGCAAGGCAt > 1:89630/1‑289 (MQ=255) gcaCCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGATCACCATTCTCTCGACGCTACCCACCGCAGGGGTTGGCGCACTGCTGGCGTTGCTGATTGCTGGTAGCGAACTGGATGTGATTGCGATTATCGGCATTATTTTGCTGATCGGTATCGTGAAGAAGAACGCCATCATGATGATCGACTTCGCGCTGGCTGCTGAGCGCGAGCAAGGCAt > 2:698619/1‑289 (MQ=255) caCCCTCGCCTTCCAGTCGGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGATCACCATTCTCTCGACGCTACCCACCGCAGGGGTTGGCGCACTGCTGGCGTTGCTGATTGCTGGTAGCGAACTGGATGTGATTGCGATTATCGGCATTATTTTGCTGATCGGTATCGTGAAGAAGAACGCCATCATGATGATCGACTTCGCGCTGGCTGCTGAGCGCGAGCAAGGCATg > 2:584409/1‑289 (MQ=255) ||| CACCGAAAATACCCCAGGCCTCGCGGCGCTGGATACCATTCGCCTGACCAGCAGCGACGGCGGCGTGGTGCCGCTAAGCAGTATTGCCAAAATTGAGCAGCGTTTTGCGCCGCTCTCCATCAACCATCTGGATCAGTTCCCGGTAACGACCATCTCCTTTAACGTGCCGGATAACTATAGCCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGGTGGATATCACCACGCAGTTCCAGGGCAGCACCCTCGCCTTCCAGAGCGCGCTGGGCAGCACTGTCTGGCTGATTGT‑CGCGGCGGTGGTGGCGATGT‑ATATCGTGCTCGGCATTCTGTACGAGAGCTTTATTCACCCGATCACCATTCTCAGCACGCTACCCACCGCAGGGGTTGGCGCACTGCTGGCGTTGCTGATTGCTGGTAGCGAACTGGATGTGATTGCGATTATCGGCATTATTTTGCTGATCGGTATCGTGAAGAAGAACGCCATCATGATGATCGACTTCGCGCTGGCTGCTGAGCGCGAGCAAGGCATG > CP042583/1744478‑1745030 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |