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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
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ggTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTT‑AACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAaca < 2:1383943/207‑1 (MQ=255) ggTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTT‑AACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAaca > 1:1383943/1‑207 (MQ=255) gTCCTTAAGTTTTCACCCGGTTTT‑AACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCGGGGAAAGCGATGATCGTGCAAAAAGAGCTGGTTGCTATTTACGATTATGAGGTCCCTGTAACTGAAGAt > 2:1365748/1‑288 (MQ=255) ||| CTGATTGGCATTGCCCACCCGTTAGAAATGACAGCAGAAATGCGCAGTGAATTTGCACAGCTTTTTGCCGATTACGAAATTATGCCGCCTTTTCGCCAGTTGAGCCGCCGCACGGTGCTGCTCACACCTGACGAGAGTACCAGTAACAGCCTGACTCGCTGGGAAGGTAAATCCGCTACCGTTGGGCAACTTATGGGAATGCGATACAAAGGCTGGGAGAGTGGCTATGAGGACGCATTTGTCTATAACCTGGGTGAGTACCGGCTGGTCCTTAAGTTTAGTCCCGGTTTT‑AACCACTACAATGTTGATAGCAAAGCGCTAATGAGCTTCCGTTCTCTTCGAGTGTACCGTGACAATAAATCCGTCACTTTTGCCGAACTTGATGTGTTTGATTTGAGTGAGGCGTTAAGCGCACCTGACGTCATTTTCCATTAAAACACAGCGGGCAGTGATGCAACTGCCCGTTATCAACACGACTTACCAGCGGGGAAAGCGATGATCGTGCAAAAAGAGCTGGTTGCTATTTACGATTATGAGGTCCCTGTACCTGAAGATCCGTT > CP042583/1778359‑1778918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |