Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,819,243 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,819,243 | 0 | A | T | 99.6% | 605.5 / NA | 257 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (128/128); minor base C (1/0); total (129/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,819,244 | 0 | G | C | 98.8% | 594.7 / NA | 257 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base C (129/125); total (129/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,819,245 | 0 | C | G | 99.6% | 600.9 / NA | 257 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (128/128); total (129/128) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GATCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGAGCCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACAGTATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTAGCGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGGGCGATAATGAT > CP042583/1818967‑1819521 ||| gATCCCACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATg < 1:1293995/289‑1 (MQ=255) cGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGAcc > 2:300632/1‑288 (MQ=255) ccaccaGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGAcc > 1:1416661/1‑286 (MQ=255) accaGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTgc < 1:967063/289‑1 (MQ=255) accaGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTgc < 1:1194094/289‑1 (MQ=255) ccaGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTgcg < 1:4390/289‑1 (MQ=255) caGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTgcg > 1:390261/1‑288 (MQ=255) cTGTACGGGCTTTCCGGATTGACCTGCAAGGACGAGAACGTCACACCCTAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACGGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCAtt < 2:1040206/288‑1 (MQ=255) tGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAg < 2:377214/289‑1 (MQ=255) cgtgCTTTCCGGAATGACCGGCAAAGAAGAGAACTTCGCCAGCCAGGGGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGt < 2:1453878/286‑1 (MQ=255) cTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGt < 2:1386046/289‑1 (MQ=255) cTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGt < 2:1766181/289‑1 (MQ=255) tttCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCCGCGGCATCAGCGGTcactc > 2:1226075/1‑287 (MQ=255) ttCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACACAACCGCCTGGGGCGACGCATTACCGGATGTACGATTATCTTCGCGATGAATTCCCGGAGCTGGTTCCGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCCGCCGCATTACGGGTctctca > 2:1148645/1‑284 (MQ=255) ccGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTcactcaat > 1:931885/1‑284 (MQ=255) aTTAACCTGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTcactcaatggg < 1:632414/288‑9 (MQ=255) tgacaTGGCGAGAACTTCACCACCAGGGGGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACGGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACg < 2:931885/285‑1 (MQ=255) tGCAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACg < 1:328044/289‑1 (MQ=255) cAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGt > 2:85829/1‑289 (MQ=255) cAATGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGt > 1:792286/1‑289 (MQ=255) cAAGGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGt < 2:1583947/289‑1 (MQ=255) aTGAGGAGAAGTGCGACACGAAGGCCGGGGCCCACGGGGTGGCGGGCGAGCTTGGGATTGTCCTGGTGATGACTGACAGCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATGTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTGGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTgc < 2:392520/289‑1 (MQ=255) aTGACGAGAACTTCACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTgc < 1:1885990/289‑1 (MQ=255) caccacCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGgcg < 1:594675/289‑1 (MQ=255) caccacCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGgc > 1:237329/1‑288 (MQ=255) 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cGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCACGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATc < 1:1174110/288‑1 (MQ=255) ggTGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGTGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCgg > 1:222635/1‑289 (MQ=255) tGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGACGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCCGCGACCGCTGCGCCATTACCGGCCACTCATCGGGTGGTCCCGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAACCCGGGt > 2:1688710/1‑289 (MQ=255) tGCCCAGCGGGTAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGCGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTCCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAACGTCAGCGACCGCTGCTCCGTTATCGGTCACGACAAGGGTGTTCATGGTGCACTGCTTCTGGCTCTGTAAATCCCggat > 2:1341363/1‑287 (MQ=255) tAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCa < 1:1335877/288‑1 (MQ=255) tAGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGGGAGGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCa < 2:1680034/288‑1 (MQ=255) gaGCGGCGGAACTGGGGGTTGGACTGGGGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCa < 2:1277732/287‑1 (MQ=255) aGCGGCGGAACTGGGGATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGATTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGc > 1:1772328/1‑289 (MQ=255) atggTACTGGCGACGCCCGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTTGCCAACGACGATGGCTACGTTTTAGGCCAGGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGACGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGCGATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATGGCGCTGAAAAATCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTgcg < 2:940789/285‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |