Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,844,220 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,844,220 | 0 | A | T | 100.0% | 632.0 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (146/119); total (146/119) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,844,221 | 0 | G | C | 99.2% | 619.3 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (143/119); minor base T (2/0); total (146/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,844,222 | 0 | T | A | 100.0% | 631.1 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (146/119); total (146/119) |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
AAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTAGTCTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCAGTCGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTAGCGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTAGCATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACAAAAGTCTACCAGGAAAAAACAAACATTTCCAA > CP042583/1843940‑1844501 ||| aaGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAg < 1:1560058/287‑1 (MQ=255) aGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCGGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCtt > 1:732717/1‑289 (MQ=255) tttGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGc > 1:1497792/1‑289 (MQ=255) tgtgtGGTTGACTTGTGCAACAATCGCGACTTGGACGGTGGTTCACTGGTGGCGATGGGTATGGTGGTGCTGGGTTGCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACTACGTGTCGTTATTATTGGTCGGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTACTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCTTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGACAGCGAACTGCTCTCTCTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGAt < 2:1694280/284‑1 (MQ=255) gCTGGTTGCATTGACAAATCATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGTGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGTTATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCa < 2:1317512/288‑1 (MQ=255) ttGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCa < 1:472899/288‑1 (MQ=255) cgcCTTCGACGGTTGTTCACTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCCCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTAttttttcg > 1:1280015/1‑286 (MQ=255) tgttcactgctgGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGc > 1:1207224/7‑289 (MQ=255) ttcactgctgGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGt > 2:150530/5‑289 (MQ=255) ctgGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCg > 1:1003102/1‑289 (MQ=255) tgGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCg > 1:637871/1‑288 (MQ=255) gggTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGtt > 1:1613047/1‑289 (MQ=255) gggTATGTTGATGCTGAATTTCTGGCTGAAAGAAAACCCACCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCAACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTCTCCCGGCGATCAAGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGt > 1:783205/1‑288 (MQ=255) gggTATGTTGACGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGAt > 1:319595/1‑232 (MQ=255) gggTATGTTGACGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTACTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGAt < 2:319595/232‑1 (MQ=255) aTGTTGAGGCTGAGTTGCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGAAGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCa < 2:620395/288‑1 (MQ=255) tGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTa > 1:896943/1‑288 (MQ=255) tGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCGGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTa > 1:1448046/1‑288 (MQ=255) gCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTTACTAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTCCTTCTTTTTACGGCATTTAGCTGGCGCTCTTTCGTGAAAGtttatggccgtat > 2:1656702/1‑277 (MQ=255) gCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATc < 2:609725/289‑1 (MQ=255) cTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATc > 2:320805/1‑288 (MQ=255) aGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCTGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGc > 1:1827605/1‑287 (MQ=255) aGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGc > 1:185712/1‑287 (MQ=255) aaagaaaACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGAt < 1:658484/189‑1 (MQ=255) aaagaaaACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCGTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTGATTTCGGCATAGTTGCAGGCCATATCGCCCTTATTATTTTtg > 2:771736/1‑289 (MQ=255) aagaaaACTCGCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCTTGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTtgt < 2:1551728/289‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGt < 2:1207224/289‑1 (MQ=255) cccTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCa < 2:1036005/289‑1 (MQ=255) ccTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCAt > 1:616298/1‑289 (MQ=255) gCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTc < 1:1508292/288‑1 (MQ=255) cAGACGACGTATTAGTATTAGTTGTCTGGTTATTCCATTTGCTGCAGTGGTATCAAAACAGCGGGGTAAGGCATGAATTCTTGTAAACCTGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACAGATATTAACCGCTTCAGCGAACCGCTCTTTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTGCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCTCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTTCATTTcc < 2:731180/288‑1 (MQ=255) acgacgTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCa > 2:1278262/1‑186 (MQ=255) cgacgTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCagag > 2:361096/1‑289 (MQ=255) cgacgTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCa < 1:696175/286‑1 (MQ=255) gtgtCGGGATCATTGGACTGGTCACGTTATTAACTGCAGTGTAATTAAACCAGCTGGTTCAGGCATTAATTCCTGTACAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCACACGAAAGATGCCTCACGATATAGCTTTCCCGGCGATCACTGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAATTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATGTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAAt < 2:58763/286‑1 (MQ=255) tATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGttt < 1:1046493/269‑1 (MQ=255) tATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATg > 1:1660646/1‑289 (MQ=255) aTCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCATCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGa < 2:245333/289‑1 (MQ=255) attagtGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGgcg < 1:1307433/289‑1 (MQ=255) attGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTTAAGGCCTTATCGCACTTATTTTTTTTTTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTTATGATTGGCGgac > 2:501155/1‑289 (MQ=255) agtggtctggtcATGCTATTAACTGCAGTTGTATTAACCCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGGGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATACTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTCTCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGcac < 2:1182366/287‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGcaca < 1:1081914/289‑1 (MQ=255) gtggtcATGTAATTAACTGAAGGGGTGTTAACACAGTTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAACCGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGAGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTGCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGt < 2:1282027/288‑1 (MQ=255) ggtcATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGttt > 1:351540/1‑289 (MQ=255) gtcATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGttt > 1:541413/1‑288 (MQ=255) gtcATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTa > 2:924593/1‑289 (MQ=255) gCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGAc > 1:169707/1‑289 (MQ=255) tATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGAcat < 1:251775/289‑1 (MQ=255) tAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGCTGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGGTATTTCGGCAAAGTTGCATGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGGTTTTGTATTTCCCAGAGTAAATGTTGGTGCACCATGGTTTattttcataat > 2:1163121/1‑279 (MQ=255) tAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCg > 2:850089/1‑219 (MQ=255) tAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGttt < 2:1106048/240‑1 (MQ=255) tAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGAcatcat > 2:1351063/1‑289 (MQ=255) tAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGAcatcat > 2:19401/1‑289 (MQ=255) cAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTgg > 2:460010/1‑259 (MQ=255) aGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGt > 1:1176687/1‑289 (MQ=255) aGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGAACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGt > 1:1301564/1‑289 (MQ=255) attgcaCCAGCTGTGTCAACCATTAATTCCCGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGAGTGTTACGGATATTAACCGCGTCCGCGCGCTCCTCCCTGTTCCCCCGAAAGTGGTCTCACGAGATAGCTTTCACCGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCACTCATGTGGCGTTATTTCGGCAATGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTCTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATTATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgat < 2:1540624/283‑6 (MQ=255) aTTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgat < 2:1613047/288‑6 (MQ=255) aTTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgat < 2:274607/288‑6 (MQ=255) ttAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCCCACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgatga > 2:41712/1‑282 (MQ=255) ttAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgatg > 2:1571573/1‑282 (MQ=255) ttAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACAGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgatga < 1:1155502/289‑8 (MQ=255) tAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgatgac < 2:1063370/289‑9 (MQ=255) aaCCAGCTGAGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCg < 1:1421820/289‑1 (MQ=255) ccAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTg > 1:404913/1‑289 (MQ=255) aGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTTGATGACCGTGat > 2:740015/1‑289 (MQ=255) aGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGat > 1:123876/1‑289 (MQ=255) gCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCTCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGGCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGTTGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGGTTATTTTTTCGGCTTTCATGTGGCGTTATTGCGGCAAATGTGCAGGCCTTATCGCCTTTATTATTTTTGTGGTTTTTGTATTTCCCAGTGTTATGATTGGCGCCTACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgctgacctggt > 2:864892/1‑274 (MQ=255) gTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGa < 1:1256788/288‑1 (MQ=255) tCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATc > 2:125962/1‑289 (MQ=255) ggCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGt > 2:1802212/1‑289 (MQ=255) cATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAACCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGt < 1:598571/287‑1 (MQ=255) aTTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGttt < 1:863793/288‑1 (MQ=255) tAATTCCGTTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTGTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGcc < 2:453323/289‑1 (MQ=255) tCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGCCTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTgg < 2:1395725/289‑1 (MQ=255) aCGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTg < 1:1681504/289‑1 (MQ=255) cGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTCACCGCTTCAGCGAACTGCGCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGa < 2:1524187/289‑1 (MQ=255) gCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgatga > 1:299366/1‑243 (MQ=255) gCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGttcgatga < 2:299366/250‑8 (MQ=255) gCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACg > 1:234813/1‑288 (MQ=255) ccAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCAtt < 1:924593/287‑1 (MQ=255) ttGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCTGCATTCATGTGTCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATc < 1:501155/289‑1 (MQ=255) tACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATTTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGTTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCCCACTGGTTTACTGACATAATTTTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGTGTTTGCTGACGCCCTTAATGGATGGATTaaca > 2:1675886/1‑287 (MQ=255) tACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCAGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTg < 2:121763/278‑1 (MQ=255) aCCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGt > 1:1111075/1‑246 (MQ=255) aCCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCa < 2:1139393/289‑1 (MQ=255) aCCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCa < 1:836124/289‑1 (MQ=255) atTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCtttt > 1:190440/1‑289 (MQ=255) aCCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGa < 1:450372/289‑1 (MQ=255) aCCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGa < 2:185712/289‑1 (MQ=255) cgTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGcaca > 2:14401/1‑183 (MQ=255) gTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACaaat < 1:993357/289‑2 (MQ=255) gTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACaaa > 1:1327171/1‑288 (MQ=255) tCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGgcg > 1:1091858/1‑177 (MQ=255) tCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGgcg < 2:1091858/177‑1 (MQ=255) aCGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGCCAAATCACTACCAGGAAAAACAAAACAtt > 2:1717439/1‑289 (MQ=255) cGAAAGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACAAATCACTACCAGGAAAAAACAAACAtt > 1:175900/1‑288 (MQ=255) aaaGATGCCTCACGAGCTAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACCCTGGTTTACTGACATCATTGTCGTTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTTCTGACGCCATTAAGTGATCGATGAATCACCTTTGTTGACAAATCATTACCGGGAAAACACAAACATTTcc > 2:643297/1‑289 (MQ=255) aaGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACAAATCACTACCAGGAAAAAACAAACATTTCCa < 2:507151/289‑1 (MQ=255) aaGATGCCTCACGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTTCGGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACAAATCACTACCAGGAAAAAACAAACATTTCCa < 1:1534147/289‑1 (MQ=255) ||| AAGTAAGGCCTTTTTGTGGCTGGTTGCATTGACCAACAATCGCGCCTTCGACGGTTGTAGTCTGCTGGCGATGGGTATGTTGATGCTGAGTTTCTGGCTGAAAGAAAACGCCCCTGGCAGACGACGTATCGTGATTATTGGTCTGGTCATGCTATTAACTGCAGTGGTATTAAACCAGCTGGGTCAGGCATTAATTCCTGTAAAACGGGCCAGCCCAACATTGACTTTTACCGATATTAACCGCGTCAGCGAACTGCTCTCTGTTCCCACGAAAGATGCCAGTCGAGATAGCTTTCCCGGCGATCACGGCATGATGCTGCTTATTTTTAGCGCATTCATGTGGCGTTATTTCGGCAAAGTTGCAGGCCTTATCGCCCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTAGCATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTAATCACCTTTTTTGACAAAAGTCTACCAGGAAAAAACAAACATTTCCAA > CP042583/1843940‑1844501 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |