Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,850,049 | 0 | A | T | 100.0% | 498.6 / NA | 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,850,050 | 0 | G | C | 99.0% | 493.9 / NA | 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (89/117); minor base A (2/0); total (91/117) | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,850,051 | 0 | T | A | 99.5% | 493.3 / NA | 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (90/117); minor base C (1/0); total (91/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.38e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
GTATCAGAAAATCACCGATTATCTGTGGCATATCACGCTGCCGGTGCTGGCGACAGTGATTGGTGGCTTTGCGGCGCTGACCATGCTGACAAAAAACAGTTTCCTTGATGAAGTGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCAGCCTGCTGATTGAGGTGATGTTTAGTCTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCAGCCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATATCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGAGCCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGAGCTTATGGATTTTCCTCGTCTTGTTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTG > CP042583/1849772‑1850330 ||| gTATCAGAAAATCACCGATTATCTGTGGCATATCACGCTGCCGGTGCTGGCGACAGTGATTGGTGGCTTTGCGGCGCTGACCATGCTGACAAAAAACTCATTCCTTGATGAAGTGCGCAAGCAATACGTGGTGACCGCGCGTGCGAAAGGGGTAAGTGAAAAAAATATTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGt > 2:1690404/1‑289 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |