| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,859,407 | 0 | G | C | 100.0% | 532.5 / NA | 227 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (123/104); total (123/104) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,859,408 | 0 | C | G | 99.6% | 535.4 / NA | 227 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (122/103); total (123/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
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CTCAACGTACTGGAAAAACATAAGGCTCCGACCGACCTTTCCCTGATGGTGTTAGGCAACATGGTCACTAACCTTATCAACACCAGCATTGCCCCGGCCCAACGCCAGGCAATTGCCAACTCTTTTGCCCGCGCCTTACAGTCCTCTATCAACGAAGACAAAGCGCACTAAGGGAAACAGATAACAGGTTATGGTAACTCATCGTCAGCGCTACCGTGAAAAAGTCTCCCAGATGGTCAGTTGGGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTAGCCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTACTCGTTTCCATCTCCATCTTAATCCCATCGTCTGGCAACTGGTT > CP042583/1859129‑1859687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |