Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,955,586 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,955,586 | 0 | G | C | 99.6% | 634.4 / ‑5.4 | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (134/132); minor base T (1/0); total (135/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,955,587 | 0 | C | G | 100.0% | 627.7 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (135/132); total (135/132) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,955,588 | 0 | T | A | 100.0% | 629.3 / NA | 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (135/132); total (135/132) |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
ATCCGCCAGTTCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCGCTTTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATACTTGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCAATACTTTCTGCGC > CP042583/1955307‑1955867 ||| tCCGCCAGTTCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTa < 1:1115390/289‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTTCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTa < 2:1253100/289‑1 (MQ=255) cGCCAGTTCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAAt < 2:557512/289‑1 (MQ=255) cAGTTCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTg < 1:529416/289‑1 (MQ=255) tCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTAt < 1:1581914/289‑1 (MQ=255) cAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATc < 1:1275431/289‑1 (MQ=255) tCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCgg > 1:994975/1‑289 (MQ=255) cGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCgggg < 1:1252190/286‑1 (MQ=255) cGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCgggg < 1:637633/286‑1 (MQ=255) aaaTTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGt < 1:1238272/289‑1 (MQ=255) aaaTTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGt < 2:152141/289‑1 (MQ=255) tAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTAt > 1:1520067/1‑262 (MQ=255) tgtgGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAAttgatgctt > 2:509463/1‑281 (MQ=255) tgGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTg > 1:458287/1‑250 (MQ=255) tgGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCtttt > 1:1671897/1‑289 (MQ=255) cTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGccc > 1:977863/1‑289 (MQ=255) tCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTa > 2:566520/1‑238 (MQ=255) tCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTa < 1:566520/238‑1 (MQ=255) ccccTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTCTTCATAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCTCGAAAACGCATCTCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTCTCCTTTCCCTGCGGGTATTCCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCTGTTCTGTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTACCTTATCAATTGCTGTTTTTTccccct > 2:1763977/1‑286 (MQ=255) ccccTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGtt < 1:913027/289‑1 (MQ=255) ccccTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGtt < 2:366697/289‑1 (MQ=255) ccTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCa > 1:27410/1‑289 (MQ=255) ccTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCa > 1:304874/1‑289 (MQ=255) tgAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCg < 2:916650/288‑1 (MQ=255) aGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAAt > 1:1797900/1‑289 (MQ=255) tGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACg > 1:24268/1‑289 (MQ=255) ttGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGtt < 1:436121/288‑1 (MQ=255) gATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTtata > 2:732481/1‑289 (MQ=255) gctgcCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGttt > 1:142661/1‑289 (MQ=255) cAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTg < 1:794333/289‑1 (MQ=255) tagtGTTCATGTATTCAGAACCCCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGAATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTGCCCTGCGGGTATTTCCTGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCtat < 2:1558565/286‑1 (MQ=255) ttCAGGTATTCCGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATccc < 2:1583961/289‑1 (MQ=255) gTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCTGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCa > 2:222870/1‑289 (MQ=255) gTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATaac < 2:1868352/253‑1 (MQ=255) gTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATaac > 1:1868352/1‑253 (MQ=255) cAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGtt < 2:1182531/254‑1 (MQ=255) cAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCaa > 2:483213/1‑288 (MQ=255) cAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAAc > 1:860134/1‑289 (MQ=255) ccGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGt > 2:1509083/1‑289 (MQ=255) gcgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCg < 2:860134/289‑1 (MQ=255) cgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTg < 1:505025/259‑1 (MQ=255) cgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGt > 1:1032635/1‑289 (MQ=255) cgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGt > 1:1733491/1‑289 (MQ=255) cgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGt > 2:16896/1‑289 (MQ=255) cgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGt > 2:742689/1‑289 (MQ=255) cgTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTGCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCCGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTACATTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTCGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTTTCGt > 2:640669/1‑289 (MQ=255) gCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATg > 1:1134135/1‑289 (MQ=255) gCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGaa > 2:257836/1‑289 (MQ=255) cTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTc > 2:1862105/1‑200 (MQ=255) cTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTc < 1:1862105/200‑1 (MQ=255) cTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACATTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAg > 1:1444997/1‑289 (MQ=255) ctgctgCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTg > 1:1566510/1‑289 (MQ=255) gcgAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCTTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCttt > 2:1880593/1‑289 (MQ=255) gcgAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCttt > 2:836105/1‑289 (MQ=255) gcgAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCACGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATACGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCCTCAACGTTGTCGTTACTAAAATGTTCGACACGATGTTGGCGCttt > 2:588962/1‑289 (MQ=255) cGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAAc < 2:142661/289‑1 (MQ=255) cGCATATCGTCGGAGGGGGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGTTGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAAc < 2:1084522/289‑1 (MQ=255) ttCAGAGGGGTCGTTTATTGTTGGCCCCGGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGa < 2:1235306/289‑1 (MQ=255) cAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAGCCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCACTCTGACg > 1:1589482/1‑289 (MQ=255) agagGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTAACgg > 1:204051/1‑289 (MQ=255) gggCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGt < 1:362705/287‑1 (MQ=255) ggCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTAt > 2:1646495/1‑288 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTg > 2:467401/1‑279 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTAtt > 2:439660/1‑287 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTAtt > 2:703106/1‑287 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTcc > 1:1181708/1‑289 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTcc > 1:1066922/1‑289 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTcc > 1:1400969/1‑289 (MQ=255) cgcgTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTAACCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTg < 1:467401/279‑1 (MQ=255) ttATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTAc < 1:1538272/289‑1 (MQ=255) tgGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCAcgcg < 1:1184111/289‑1 (MQ=255) ggCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCgg > 2:1207668/1‑289 (MQ=255) cGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGTTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTaa > 2:430218/1‑287 (MQ=255) cAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCa > 1:1049814/1‑101 (MQ=255) aactaactGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTgc < 1:417621/289‑1 (MQ=255) actaactGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTgcg < 2:977863/289‑1 (MQ=255) gACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGAc > 2:803525/1‑289 (MQ=255) aCTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAGCGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACa > 1:692970/1‑289 (MQ=255) ctttctttTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACa > 1:149469/1‑288 (MQ=255) ctttTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCg > 2:425808/1‑134 (MQ=255) tCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCt < 1:855008/289‑1 (MQ=255) cccTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTa < 2:234108/289‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTgc > 2:287061/1‑269 (MQ=255) ccTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTgc < 1:287061/269‑1 (MQ=255) cTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACg < 2:1490822/289‑1 (MQ=255) cTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACg < 1:738093/289‑1 (MQ=255) tGCGGGTATTTCCATCGATTTTTTACCCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGTTAATTTGTTTTCCGGGGCATAGGTTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACgg < 2:688418/289‑1 (MQ=255) cGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATaac < 2:1044530/130‑1 (MQ=255) cGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTa > 2:1829093/1‑289 (MQ=255) cGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTa > 1:612712/1‑289 (MQ=255) cGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTa > 2:1321209/1‑289 (MQ=255) cGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTGACCCACCCGGGGTTAAACACACTTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTCGGGTa > 2:1619325/1‑289 (MQ=255) tcacacggCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTCTCCGGGGCATAGAGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTCCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCa < 2:1066922/283‑1 (MQ=255) tAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCa < 1:596830/289‑1 (MQ=255) tAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCa < 1:1840357/289‑1 (MQ=255) gCCAGTTCTTTCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCa > 1:1000933/1‑289 (MQ=255) ttCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCAATACTTTCt < 2:1134135/289‑1 (MQ=255) tCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCTACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCAATACTTTCTg < 2:1733491/289‑1 (MQ=255) tCGTTTTGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCAATACTTTCTg < 2:277952/289‑1 (MQ=255) ttttGTCCGATTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATTGATGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCAATACTTTCTgcgc < 2:12863/289‑1 (MQ=255) ||| ATCCGCCAGTTCAATCAGGCGAATAAATTCCGCCCTGTAACCCTGTGGATCTTCCCCTTTTGCCTGCTGAGCCCACTGTTTGATCTGCTGCCAGGAGGTATTGTTCAGGTATTCAGAACCGCGTAACTTTTGCCCATATGCAGCTACTGCTGCGCGAAAACGCATATCTTCAGAGGGCGCGTTTATTGTTGGCCCCAGCGGGAATTCAACTAACTGACTTTCTTTTCCCTGCGGGTATTTCCAGCGAATTTTTAACCAGGCCAGTTCTTTCGTTTTGTCGCTTTTCGCTAATTTGTTATCCGGGGCATAGCGTAACTTATCAATACTTGCTTTTTGCCCGTTCAGCGTTAATTCGAATAACAACGTTATATGTTTGCCTGCGCCTATATCCCCTGCATCAACGTTGTCGTTATTAAAATGTTCCACCCGAAGTTGGCGCTTTTCATAACCAATCTGACGGTATTCCGTTACCCACGCGGGGTTAAACTCAATTTGCGCTTTGACATCTTTTGCTACGGTAATCAACATCTGCCGCATTTCACTATTCAATACTTTCTGCGC > CP042583/1955307‑1955867 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |